49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4188 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4188  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  256  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  91.54 
 
 		 130 aa  241  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  79.84 
 
 		 128 aa  202  9e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  73.64 
 
 		 128 aa  191  4e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  73.28 
 
 		 131 aa  190  6e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  68.46 
 
 		 130 aa  180  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  50.77 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  53.85 
 
 		 129 aa  122  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  53.08 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  53.08 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  53.08 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  53.08 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  53.08 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  53.08 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  53.08 
 
 		 129 aa  121  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0032  hypothetical protein  44.12 
 
 		 136 aa  102  3e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0027  hypothetical protein  40.15 
 
 		 137 aa  95.1  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  44.35 
 
 		 119 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  47.06 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  47.06 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  47.06 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  47.06 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  47.06 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  47.06 
 
 		 126 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  46.08 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0734  hypothetical protein  41.18 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1684  hypothetical protein  41.18 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2036  hypothetical protein  41.18 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.880163  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2134  hypothetical protein  41.18 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0726  hypothetical protein  41.18 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.735909  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0615  hypothetical protein  41.18 
 
 		 130 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.542557  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  32.65 
 
 		 180 aa  63.5  0.0000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0236  hypothetical protein  40.91 
 
 		 138 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.869279  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1193  hypothetical protein  39.62 
 
 		 556 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.000362542  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3554  hypothetical protein  33.98 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3182  hypothetical protein  31.07 
 
 		 126 aa  52.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3425  hypothetical protein  33.98 
 
 		 121 aa  52  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4078  hypothetical protein  31.78 
 
 		 153 aa  52  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000216879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0288  hypothetical protein  34.09 
 
 		 237 aa  51.6  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7054  hypothetical protein  36.27 
 
 		 464 aa  51.2  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00922196  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3870  hypothetical protein  34.83 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000411635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0928  hypothetical protein  31.78 
 
 		 1227 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.261917  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3015  hypothetical protein  35.85 
 
 		 373 aa  47.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.264185  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  33.67 
 
 		 430 aa  47  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2129  hypothetical protein  30.84 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.573437  normal  0.772527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3169  hypothetical protein  33.33 
 
 		 222 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03070  hypothetical protein  28.85 
 
 		 1461 aa  43.5  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06817  hypothetical protein  29.41 
 
 		 214 aa  42.7  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000428  hypothetical protein  31.25 
 
 		 485 aa  41.6  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>