27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_0027 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_0027  hypothetical protein  100 
 
 
137 aa  267  4e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.185446  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0032  hypothetical protein  60 
 
 
136 aa  145  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.397492  normal  0.0135173 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2440  hypothetical protein  41.67 
 
 
130 aa  107  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0535  hypothetical protein  39.39 
 
 
131 aa  90.5  6e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0206  hypothetical protein  38.64 
 
 
128 aa  90.5  7e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2870  hypothetical protein  37.31 
 
 
128 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.713519  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3783  hypothetical protein  37.12 
 
 
130 aa  79  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.588858  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4188  hypothetical protein  41.67 
 
 
130 aa  77  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26550  hypothetical protein  32.03 
 
 
129 aa  61.6  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1889  hypothetical protein  30.83 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.969442  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1897  hypothetical protein  33.65 
 
 
126 aa  57  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2170  hypothetical protein  33.65 
 
 
126 aa  57  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2005  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.355027  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0713  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.407364  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0801  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.795973  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1195  hypothetical protein  33.65 
 
 
126 aa  57  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1031  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0908  hypothetical protein  33.65 
 
 
126 aa  57  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0736  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.311796  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2086  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.215775  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0450  hypothetical protein  30 
 
 
129 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0256  hypothetical protein  33.65 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0347  hypothetical protein  33.65 
 
 
126 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454695  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0859  hypothetical protein  38.33 
 
 
119 aa  57  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0488792  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1707  hypothetical protein  33.65 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2437  hypothetical protein  25.86 
 
 
430 aa  48.9  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2829  hypothetical protein  31.46 
 
 
180 aa  42  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>