More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0312 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0312  putative two component response regulator  100 
 
 		 242 aa  498  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000704543  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4222  two-component response regulator  43.32 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.560932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3392  two component transcriptional regulator  38.91 
 
 		 239 aa  152  5e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000345034  normal  0.431956 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1193  two component transcriptional regulator  43.89 
 
 		 232 aa  151  8e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0519929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2321  two component transcriptional regulator  41.27 
 
 		 244 aa  150  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.483652  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3571  two component transcriptional regulator  43.62 
 
 		 232 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000262211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49440  two-component response regulator  42.78 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000474992  normal  0.747521 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1181  winged helix family two component transcriptional regulator  42.78 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.037877  normal  0.73042 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1211  two component transcriptional regulator  42.78 
 
 		 232 aa  146  3e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.676109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0196  two component transcriptional regulator  42.62 
 
 		 238 aa  145  8.000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000815382  hitchhiker  0.00535544 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3172  DNA-binding response regulator  42.11 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4235  two component transcriptional regulator  42.78 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.207223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4245  two component transcriptional regulator  41.62 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0492398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2325  two component transcriptional regulator  41.24 
 
 		 238 aa  143  2e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0521181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0669  two component transcriptional regulator  40.44 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.851863  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000579  putative DNA-binding response regulator  36.24 
 
 		 237 aa  142  5e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00151616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3716  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.16 
 
 		 247 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422774  normal  0.0121745 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1672  DNA-binding response regulator  42.16 
 
 		 247 aa  142  7e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2022  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.730555 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1754  DNA-binding transcriptional regulator RstA  41.24 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.618128  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0550  two component transcriptional regulator  41.01 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000958325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0557  response regulator receiver  43.26 
 
 		 234 aa  139  3e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3146  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.39 
 
 		 234 aa  137  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.119762  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3498  putative two-component response regulator  40 
 
 		 235 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0401889  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2800  response regulator receiver protein  40.56 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0122786  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3150  two component transcriptional regulator  44.09 
 
 		 249 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.991698  normal  0.0506876 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1104  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00308001  normal  0.0226787 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1002  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000471824  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1071  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000676378  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3287  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.67 
 
 		 237 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000200523  normal  0.324308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3391  two component transcriptional regulator  41.11 
 
 		 235 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05293  hypothetical protein  39.66 
 
 		 237 aa  134  9e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0878  two component transcriptional regulator  41.11 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00260237  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3062  two component transcriptional regulator, winged helix family protein  42.7 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41260  putative two-component response regulator  39.44 
 
 		 235 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.923976 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3690  two component transcriptional regulator  41.57 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.038332  normal  0.0151663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0749  two component transcriptional regulator  41.57 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.326027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3569  two component transcriptional regulator  41.57 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3501  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.57 
 
 		 234 aa  133  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1010  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  132  5e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000199702  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0896  two component transcriptional regulator  40.56 
 
 		 237 aa  132  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000189871  normal  0.423328 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0844  two component transcriptional regulator  41.57 
 
 		 231 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000690184  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1790  DNA-binding transcriptional regulator RstA  40 
 
 		 248 aa  131  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.704871  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0290  response regulator receiver domain-containing protein  33.77 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.870097  hitchhiker  0.0000582863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3594  transcriptional regulatory protein RstA, putative  40 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0981  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0593139  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1030  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000542446  normal  0.656047 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3006  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000324706  normal  0.0671955 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3087  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000126315  normal  0.467683 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3184  two component transcriptional regulator  40 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0220819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0108  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.36 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0107  DNA-binding response regulator  36.36 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2275  DNA-binding transcriptional regulator RstA  42.19 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00968308  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2580  DNA-binding transcriptional regulator RstA  42.19 
 
 		 245 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0305  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 235 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0309  two component transcriptional regulator  41.53 
 
 		 235 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3106  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 234 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3000  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.56 
 
 		 234 aa  129  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1699  DNA-binding transcriptional regulator RstA  42.25 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.205168  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1867  DNA-binding transcriptional regulator RstA  42.25 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0435355  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1643  DNA-binding transcriptional regulator RstA  42.25 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.15633  normal  0.900528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1584  DNA-binding transcriptional regulator RstA  42.25 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.163508  normal  0.857869 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1575  DNA-binding transcriptional regulator RstA  42.25 
 
 		 243 aa  128  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.169233 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  38.34 
 
 		 235 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5615  DNA-binding response regulator YycF  38.34 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0318  two component transcriptional regulator  35.75 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.523003  normal  0.212939 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5319  DNA-binding response regulator YycF  38.34 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.169223  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5147  response regulator  38.34 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5163  response regulator  38.34 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00196509  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5650  DNA-binding response regulator YycF  38.34 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00563499  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5715  DNA-binding response regulator YycF  38.34 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.656882  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5572  DNA-binding response regulator YycF  38.34 
 
 		 235 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.81316e-29 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0675  two component transcriptional regulator  39.46 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.920274  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5346  DNA-binding response regulator YycF  38.34 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000234523  hitchhiker  0.00000000000323141 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  38.34 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2914  two component transcriptional regulator  40.98 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634998  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5589  DNA-binding response regulator YycF  38.34 
 
 		 235 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1426  transcriptional regulatory protein RstA  37.5 
 
 		 248 aa  126  3e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.319576  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01577  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with RstB  41.18 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.223446  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01567  hypothetical protein  41.18 
 
 		 242 aa  125  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.244563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2035  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.18 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00013009  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1683  DNA-binding transcriptional regulator RstA  41.18 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.160047  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2022  DNA-binding transcriptional regulator RstA  41.18 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1816  DNA-binding transcriptional regulator RstA  41.18 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0513956  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2318  DNA-binding transcriptional regulator RstA  41.18 
 
 		 239 aa  125  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0386418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3978  two component transcriptional regulator  37.02 
 
 		 234 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.832558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  38.25 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0585  DNA-binding response regulator  38.8 
 
 		 230 aa  124  1e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00125793  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1591  DNA-binding transcriptional regulator RstA  42.25 
 
 		 239 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00390701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2590  DNA-binding transcriptional regulator RstA  39.36 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.34 
 
 		 230 aa  123  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0081  two component transcriptional regulator  36.81 
 
 		 244 aa  122  4e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1794  DNA-binding transcriptional regulator RstA  41.05 
 
 		 242 aa  122  4e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0414199  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1937  DNA-binding transcriptional regulator RstA  38.78 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2892  two component transcriptional regulator  38.54 
 
 		 233 aa  122  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.440569  normal  0.202196 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2300  DNA-binding transcriptional regulator RstA  38.78 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.475192 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1826  DNA-binding transcriptional regulator RstA  38.78 
 
 		 248 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.494249  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0050  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.46 
 
 		 235 aa  121  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2206  two component transcriptional regulator  34.15 
 
 		 246 aa  121  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.121597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>