100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1838 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  100 
 
 
221 aa  464  9.999999999999999e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  78.24 
 
 
220 aa  359  2e-98  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  71.63 
 
 
216 aa  339  2e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  71.89 
 
 
222 aa  335  2.9999999999999997e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  69.91 
 
 
217 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  69.44 
 
 
239 aa  321  5e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  69.63 
 
 
191 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  53.27 
 
 
210 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  50.46 
 
 
210 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  52.26 
 
 
212 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  52.26 
 
 
212 aa  206  2e-52  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  50.75 
 
 
210 aa  201  6e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  50.75 
 
 
210 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  49 
 
 
212 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  50.25 
 
 
210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  31 
 
 
228 aa  93.2  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0311  FAD-dependent thymidylate synthase  32.52 
 
 
266 aa  88.6  7e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0369902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  28.8 
 
 
233 aa  85.9  4e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  30.1 
 
 
253 aa  80.5  0.00000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  28.72 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0014  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.28 
 
 
313 aa  80.1  0.00000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  31.44 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  28.21 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  26.87 
 
 
284 aa  76.3  0.0000000000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0045  FAD-dependent thymidylate synthase  30.05 
 
 
310 aa  75.1  0.0000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1151  FAD-dependent thymidylate synthase  27.43 
 
 
316 aa  74.7  0.0000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  28.34 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  27.81 
 
 
220 aa  73.6  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  29.08 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  28.35 
 
 
261 aa  73.2  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  28.92 
 
 
325 aa  72  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  26.7 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  27.32 
 
 
318 aa  70.1  0.00000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  27.32 
 
 
305 aa  68.6  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.94 
 
 
226 aa  68.2  0.00000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.68 
 
 
230 aa  67.4  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000307587  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  26.83 
 
 
310 aa  64.7  0.000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.6 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.6 
 
 
195 aa  63.5  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  25.25 
 
 
233 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.37 
 
 
195 aa  63.5  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  25.44 
 
 
243 aa  62.8  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2236  FAD-dependent thymidylate synthase  27.85 
 
 
233 aa  62.4  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477574  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  24.15 
 
 
250 aa  62  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  23.28 
 
 
250 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2386  FAD-dependent thymidylate synthase  24.04 
 
 
250 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  29.9 
 
 
228 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.81 
 
 
237 aa  59.7  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4942  FAD-dependent thymidylate synthase  26.7 
 
 
316 aa  59.3  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497472  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  28.83 
 
 
226 aa  58.9  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  28.64 
 
 
245 aa  58.9  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.91 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  27 
 
 
265 aa  57  0.0000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.19 
 
 
228 aa  57  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.96 
 
 
223 aa  57.4  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2189  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.08 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25280  FAD-dependent thymidylate synthase  23.5 
 
 
250 aa  56.6  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0348718  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.84 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  29.55 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.11 
 
 
218 aa  55.8  0.0000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  27.1 
 
 
230 aa  55.8  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.21 
 
 
279 aa  55.5  0.0000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5811  FAD-dependent thymidylate synthase  25.65 
 
 
250 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4274  thymidylate synthase flavin-dependent  22.05 
 
 
250 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.933149  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.5 
 
 
231 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  28.49 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  28.49 
 
 
229 aa  53.1  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  25.13 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  28.25 
 
 
229 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2482  thymidylate synthase complementing protein ThyX  25.14 
 
 
232 aa  53.1  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000421387  hitchhiker  0.00846096 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  25 
 
 
226 aa  53.1  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.46 
 
 
281 aa  52.4  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  28.95 
 
 
231 aa  52  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2102  FAD-dependent thymidylate synthase  23.56 
 
 
254 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1882  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.18 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0694605  normal  0.133921 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2161  FAD-dependent thymidylate synthase  23.56 
 
 
254 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298336  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2115  FAD-dependent thymidylate synthase  23.56 
 
 
254 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  24.6 
 
 
232 aa  49.7  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3547  FAD-dependent thymidylate synthase  24.26 
 
 
265 aa  48.9  0.00006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.29 
 
 
258 aa  48.1  0.0001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0508  thymidylate synthase complementing protein ThyX  27.86 
 
 
289 aa  47  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1388  FAD-dependent thymidylate synthase  23.04 
 
 
247 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2071  thymidylate synthase complementing protein ThyX  30.16 
 
 
241 aa  46.6  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.83 
 
 
248 aa  45.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1346  FAD-dependent thymidylate synthase  22.93 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2401  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  28.57 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1744  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.21 
 
 
216 aa  44.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246329  normal  0.887681 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1195  FAD-dependent thymidylate synthase  21.82 
 
 
274 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200813  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  25.71 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0273  thymidylate synthase complementing protein ThyX  29.23 
 
 
251 aa  44.7  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  27.78 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.01 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  26.01 
 
 
282 aa  43.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.01 
 
 
273 aa  43.5  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0732  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.38 
 
 
266 aa  43.1  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1148  thymidylate synthase, flavin-dependent  22.49 
 
 
267 aa  42.7  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.606793 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  27.84 
 
 
243 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0880  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.38 
 
 
280 aa  43.1  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  27.92 
 
 
245 aa  42.4  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2633  thymidylate synthase (FAD)  22.89 
 
 
262 aa  42.4  0.006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0928647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>