112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1504 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  100 
 
 
243 aa  499  1e-140  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  73.19 
 
 
235 aa  365  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  42.79 
 
 
220 aa  150  1e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  42.36 
 
 
220 aa  150  2e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  38.81 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  38.2 
 
 
229 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  39.73 
 
 
233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0311  FAD-dependent thymidylate synthase  35.43 
 
 
266 aa  122  5e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0369902  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  41.62 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  35.68 
 
 
261 aa  118  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1151  FAD-dependent thymidylate synthase  38.03 
 
 
316 aa  115  6e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  33.49 
 
 
253 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4942  FAD-dependent thymidylate synthase  34.19 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497472  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  33.33 
 
 
284 aa  113  3e-24  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  35.5 
 
 
325 aa  108  6e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  32 
 
 
292 aa  108  1e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  34.36 
 
 
310 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.62 
 
 
279 aa  107  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0880  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.82 
 
 
280 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0732  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.82 
 
 
266 aa  107  2e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  35.06 
 
 
318 aa  105  6e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  32.73 
 
 
293 aa  105  8e-22  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  34.2 
 
 
305 aa  103  4e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  29.91 
 
 
265 aa  102  5e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0045  FAD-dependent thymidylate synthase  34.9 
 
 
310 aa  99  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0014  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.47 
 
 
313 aa  85.5  7e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  28.38 
 
 
212 aa  83.6  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.72 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  28.8 
 
 
212 aa  75.1  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  28.96 
 
 
212 aa  74.7  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.45 
 
 
195 aa  73.2  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  29.35 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  26.6 
 
 
210 aa  72.8  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.77 
 
 
195 aa  72.4  0.000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  30.73 
 
 
263 aa  71.6  0.00000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.82 
 
 
195 aa  71.2  0.00000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.55 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.61 
 
 
231 aa  69.7  0.00000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  29.61 
 
 
226 aa  67.8  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  30.43 
 
 
245 aa  67  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  28.82 
 
 
228 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  28.99 
 
 
239 aa  65.9  0.0000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.22 
 
 
223 aa  65.9  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  31.07 
 
 
245 aa  65.9  0.0000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  26.46 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  25.23 
 
 
210 aa  65.5  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  27.08 
 
 
222 aa  65.1  0.0000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.14 
 
 
260 aa  64.3  0.000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  25.34 
 
 
210 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  31.76 
 
 
226 aa  63.5  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  25.44 
 
 
221 aa  62.8  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.84 
 
 
254 aa  62.4  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  31.94 
 
 
232 aa  62.4  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  31.54 
 
 
229 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  25.29 
 
 
220 aa  59.3  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  31.54 
 
 
229 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.95 
 
 
249 aa  59.3  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  27.04 
 
 
245 aa  58.9  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.19 
 
 
230 aa  58.5  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000307587  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1044  thymidylate synthase complementing protein ThyX  30.72 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.47 
 
 
226 aa  58.2  0.0000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  31.51 
 
 
229 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1762  FAD-dependent thymidylate synthase  30 
 
 
206 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  30 
 
 
226 aa  57.4  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  23.86 
 
 
216 aa  57  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  30.64 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2386  FAD-dependent thymidylate synthase  30.26 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  26.79 
 
 
191 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1148  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.88 
 
 
267 aa  55.5  0.0000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.606793 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  25 
 
 
228 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2482  thymidylate synthase complementing protein ThyX  29.21 
 
 
232 aa  53.9  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000421387  hitchhiker  0.00846096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  28.47 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.47 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1625  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.54 
 
 
253 aa  53.5  0.000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00115057  normal  0.386894 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  26.25 
 
 
231 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  25.44 
 
 
217 aa  53.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0011  FAD-dependent thymidylate synthase  28.99 
 
 
210 aa  53.1  0.000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4274  thymidylate synthase flavin-dependent  27.65 
 
 
250 aa  52  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.933149  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25280  FAD-dependent thymidylate synthase  28.49 
 
 
250 aa  52  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0348718  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2917  thymidylate synthase complementing protein ThyX  26.34 
 
 
240 aa  52  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000386154  normal  0.0185293 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3530  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  25.71 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3445  thymidylate synthase  25.81 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3813  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  25.71 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17838  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2189  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.88 
 
 
250 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  25.9 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  26.92 
 
 
245 aa  51.6  0.00001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0001  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.44 
 
 
204 aa  51.6  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.248117  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.34 
 
 
248 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  27.27 
 
 
248 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  27.88 
 
 
250 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  30.54 
 
 
245 aa  50.1  0.00003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0026  FAD-dependent thymidylate synthase  27.44 
 
 
207 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1800  FAD-dependent thymidylate synthase  27.86 
 
 
206 aa  49.7  0.00004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0219748  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0053  FAD-dependent thymidylate synthase  27.44 
 
 
207 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  29.5 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0028  FAD-dependent thymidylate synthase  27.44 
 
 
207 aa  49.7  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.89 
 
 
281 aa  49.7  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  29.25 
 
 
243 aa  48.9  0.00006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2071  thymidylate synthase complementing protein ThyX  25.68 
 
 
241 aa  46.6  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0273  thymidylate synthase complementing protein ThyX  25.89 
 
 
251 aa  46.2  0.0004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>