88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0311 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0311  FAD-dependent thymidylate synthase  100 
 
 		 266 aa  554  1e-157  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0369902  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  53.91 
 
 		 293 aa  276  3e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4942  FAD-dependent thymidylate synthase  49.64 
 
 		 316 aa  274  9e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497472  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  55.97 
 
 		 284 aa  274  1.0000000000000001e-72  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0045  FAD-dependent thymidylate synthase  50.19 
 
 		 310 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  50.19 
 
 		 310 aa  265  5.999999999999999e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  52.61 
 
 		 253 aa  263  3e-69  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  50.19 
 
 		 305 aa  261  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  49.81 
 
 		 318 aa  258  6e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  47.76 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  47.41 
 
 		 325 aa  252  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  48.21 
 
 		 292 aa  252  5.000000000000001e-66  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1151  FAD-dependent thymidylate synthase  46.95 
 
 		 316 aa  247  1e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  47.91 
 
 		 228 aa  210  2e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  47.53 
 
 		 229 aa  202  3e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  45.7 
 
 		 233 aa  201  9.999999999999999e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0014  thymidylate synthase, flavin-dependent  44.58 
 
 		 313 aa  197  1.0000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  43.18 
 
 		 220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  42.73 
 
 		 220 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  41.74 
 
 		 261 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  38.65 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  35.43 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.87 
 
 		 279 aa  119  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  35.43 
 
 		 235 aa  115  6e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0880  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.96 
 
 		 280 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0732  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.96 
 
 		 266 aa  106  5e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  32.52 
 
 		 221 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  32.96 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  33.53 
 
 		 217 aa  80.9  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  34.78 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  29.82 
 
 		 212 aa  77.4  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  32.92 
 
 		 222 aa  75.9  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  30.67 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  30.67 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  28.92 
 
 		 210 aa  72  0.000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  28.28 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  31.06 
 
 		 216 aa  68.9  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.15 
 
 		 237 aa  68.6  0.0000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  31 
 
 		 210 aa  68.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  31.48 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.26 
 
 		 195 aa  66.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  28.12 
 
 		 210 aa  65.9  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.75 
 
 		 231 aa  64.7  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  28.12 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.32 
 
 		 195 aa  61.6  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  26.67 
 
 		 228 aa  62  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.71 
 
 		 218 aa  61.2  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.32 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  28.65 
 
 		 245 aa  59.7  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  26.15 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.4 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  28.25 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  26.26 
 
 		 226 aa  58.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  27.81 
 
 		 229 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  26.11 
 
 		 232 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.39 
 
 		 223 aa  57  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.69 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.19 
 
 		 254 aa  56.6  0.0000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1762  FAD-dependent thymidylate synthase  26.5 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.24 
 
 		 260 aa  56.2  0.0000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.63 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  23.39 
 
 		 229 aa  55.1  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.07 
 
 		 228 aa  54.7  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  27.49 
 
 		 231 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1800  FAD-dependent thymidylate synthase  26.5 
 
 		 206 aa  53.1  0.000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0219748  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  25.82 
 
 		 230 aa  53.1  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  26.79 
 
 		 245 aa  52  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  26.4 
 
 		 263 aa  51.6  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  26.79 
 
 		 245 aa  51.2  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  26.7 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  27.49 
 
 		 245 aa  50.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  24.87 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  25.95 
 
 		 245 aa  49.7  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.74 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.74 
 
 		 273 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  28.74 
 
 		 282 aa  48.9  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  24.86 
 
 		 243 aa  48.5  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1187  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.75 
 
 		 273 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.933104 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.82 
 
 		 248 aa  45.4  0.0009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3813  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  26.26 
 
 		 252 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17838  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3530  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  26.26 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537663  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  25.71 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3445  thymidylate synthase  26.26 
 
 		 253 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277161  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0001  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.47 
 
 		 204 aa  43.1  0.004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.248117  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0028  FAD-dependent thymidylate synthase  25.14 
 
 		 207 aa  42  0.009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0053  FAD-dependent thymidylate synthase  25.41 
 
 		 207 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1861  FAD-dependent thymidylate synthase  24.74 
 
 		 218 aa  42  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224616  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0026  FAD-dependent thymidylate synthase  25.41 
 
 		 207 aa  42  0.01  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>