72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_0880 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0880  thymidylate synthase, flavin-dependent  100 
 
 		 280 aa  578  1e-164  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0732  thymidylate synthase, flavin-dependent  100 
 
 		 266 aa  550  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  59.48 
 
 		 279 aa  348  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  31.62 
 
 		 292 aa  124  1e-27  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  32.91 
 
 		 229 aa  123  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  32.46 
 
 		 228 aa  118  9.999999999999999e-26  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  34.32 
 
 		 233 aa  118  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  33.03 
 
 		 220 aa  115  6e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  33.48 
 
 		 220 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0311  FAD-dependent thymidylate synthase  30.96 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0369902  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0045  FAD-dependent thymidylate synthase  33.19 
 
 		 310 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  32.91 
 
 		 325 aa  112  9e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  32.77 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1151  FAD-dependent thymidylate synthase  33.07 
 
 		 316 aa  108  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4942  FAD-dependent thymidylate synthase  30.6 
 
 		 316 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497472  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  30.74 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  26.2 
 
 		 284 aa  103  2e-21  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  28.82 
 
 		 293 aa  102  6e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  32.76 
 
 		 235 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  30 
 
 		 318 aa  99.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  28.16 
 
 		 305 aa  97.8  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  29.17 
 
 		 253 aa  97.4  2e-19  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  28.51 
 
 		 310 aa  96.7  4e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0014  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.75 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  31.72 
 
 		 233 aa  89  7e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  28.57 
 
 		 265 aa  89  9e-17  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  28.5 
 
 		 248 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  29.15 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  29.07 
 
 		 246 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  26.78 
 
 		 263 aa  57.4  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  30.49 
 
 		 245 aa  56.6  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  28.65 
 
 		 245 aa  54.7  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  23.15 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  22.47 
 
 		 210 aa  53.1  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  28.28 
 
 		 245 aa  53.5  0.000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.07 
 
 		 218 aa  53.1  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  23.27 
 
 		 191 aa  53.1  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  28.65 
 
 		 245 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.05 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  26.87 
 
 		 222 aa  52.4  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  23.38 
 
 		 221 aa  51.6  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  26.58 
 
 		 234 aa  51.2  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  20.96 
 
 		 212 aa  50.4  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  20.96 
 
 		 212 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  22.91 
 
 		 220 aa  50.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  25.34 
 
 		 216 aa  50.1  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  23.04 
 
 		 239 aa  48.9  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  27.17 
 
 		 226 aa  48.5  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.54 
 
 		 226 aa  47.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25280  FAD-dependent thymidylate synthase  28.28 
 
 		 250 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0348718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.29 
 
 		 195 aa  47  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  22.66 
 
 		 210 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.31 
 
 		 195 aa  47  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.5 
 
 		 249 aa  47.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  22.69 
 
 		 210 aa  47  0.0004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  23.04 
 
 		 217 aa  46.2  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  22.22 
 
 		 210 aa  46.2  0.0007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.06 
 
 		 223 aa  45.4  0.0009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.42 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  28.42 
 
 		 282 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  25 
 
 		 195 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.42 
 
 		 273 aa  45.4  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.51 
 
 		 226 aa  45.1  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  33.33 
 
 		 212 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  28.65 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.33 
 
 		 231 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.99 
 
 		 260 aa  43.9  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2102  FAD-dependent thymidylate synthase  26.67 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2161  FAD-dependent thymidylate synthase  26.67 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298336  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2792  FAD-dependent thymidylate synthase  27.81 
 
 		 285 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2115  FAD-dependent thymidylate synthase  26.67 
 
 		 254 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  25.11 
 
 		 229 aa  43.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>