132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_09250 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  100 
 
 
226 aa  472  1e-132  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  70.8 
 
 
226 aa  340  7e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  70.67 
 
 
226 aa  336  9.999999999999999e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  59.26 
 
 
231 aa  267  8.999999999999999e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  57.87 
 
 
229 aa  265  5e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  58.99 
 
 
232 aa  263  2e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  59.26 
 
 
229 aa  262  3e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  58.8 
 
 
229 aa  259  2e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  56.94 
 
 
230 aa  254  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  54.17 
 
 
245 aa  253  1.0000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  56.48 
 
 
228 aa  249  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  55.76 
 
 
234 aa  246  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  56.94 
 
 
218 aa  238  5e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  52.16 
 
 
245 aa  233  3e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  52.16 
 
 
245 aa  232  4.0000000000000004e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  50.45 
 
 
231 aa  226  2e-58  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  49.17 
 
 
258 aa  224  7e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  51.98 
 
 
246 aa  222  4e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  49.37 
 
 
263 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  50.93 
 
 
223 aa  207  2e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  49.34 
 
 
245 aa  198  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  46.05 
 
 
228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  50.43 
 
 
248 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  49.58 
 
 
243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  48.03 
 
 
245 aa  182  3e-45  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  44.61 
 
 
254 aa  176  2e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  43.06 
 
 
260 aa  176  3e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  45.93 
 
 
237 aa  159  4e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  40.76 
 
 
281 aa  152  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  39.34 
 
 
282 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  39.34 
 
 
273 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  39.34 
 
 
273 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1200  thymidylate synthase, flavin-dependent  42.56 
 
 
223 aa  141  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.001686  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1187  thymidylate synthase, flavin-dependent  38.39 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.933104 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  41 
 
 
195 aa  128  6e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  41 
 
 
195 aa  128  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  41 
 
 
195 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.91 
 
 
249 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3530  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  39.2 
 
 
257 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537663  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3813  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  39.2 
 
 
252 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  37.88 
 
 
248 aa  116  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3445  thymidylate synthase  37.95 
 
 
253 aa  115  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277161  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0584  thymidylate synthase complementing protein ThyX  37.5 
 
 
267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000716478  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.03 
 
 
230 aa  108  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000307587  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5811  FAD-dependent thymidylate synthase  36.41 
 
 
250 aa  108  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  38.89 
 
 
250 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4274  thymidylate synthase flavin-dependent  38.12 
 
 
250 aa  106  4e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.933149  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1744  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.17 
 
 
216 aa  103  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246329  normal  0.887681 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  36.31 
 
 
250 aa  104  1e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2386  FAD-dependent thymidylate synthase  38.82 
 
 
250 aa  103  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25280  FAD-dependent thymidylate synthase  38.33 
 
 
250 aa  100  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0348718  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2189  thymidylate synthase, flavin-dependent  39.41 
 
 
250 aa  100  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1388  FAD-dependent thymidylate synthase  37.78 
 
 
247 aa  99.8  3e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1148  thymidylate synthase, flavin-dependent  41.1 
 
 
267 aa  99.4  4e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.606793 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1346  FAD-dependent thymidylate synthase  37.22 
 
 
247 aa  98.6  7e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2401  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.18 
 
 
226 aa  98.2  9e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3547  FAD-dependent thymidylate synthase  36.11 
 
 
265 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1195  FAD-dependent thymidylate synthase  36.07 
 
 
274 aa  97.8  1e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200813  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  33.16 
 
 
233 aa  95.5  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0508  thymidylate synthase complementing protein ThyX  30.73 
 
 
289 aa  94.4  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2115  FAD-dependent thymidylate synthase  40.34 
 
 
254 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2161  FAD-dependent thymidylate synthase  40.34 
 
 
254 aa  94  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298336  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2102  FAD-dependent thymidylate synthase  40.34 
 
 
254 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2792  FAD-dependent thymidylate synthase  37.5 
 
 
285 aa  92.4  5e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2482  thymidylate synthase complementing protein ThyX  32.45 
 
 
232 aa  92  6e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000421387  hitchhiker  0.00846096 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2236  FAD-dependent thymidylate synthase  37.65 
 
 
233 aa  91.3  1e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477574  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  33.73 
 
 
220 aa  88.6  7e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  33.73 
 
 
220 aa  88.2  9e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2472  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.96 
 
 
284 aa  85.9  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000436575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1689  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.82 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179029 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0026  FAD-dependent thymidylate synthase  28.29 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0001  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.95 
 
 
204 aa  84.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.248117  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2633  thymidylate synthase (FAD)  34.29 
 
 
262 aa  84.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0928647  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0053  FAD-dependent thymidylate synthase  28.29 
 
 
207 aa  84.3  0.000000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1762  FAD-dependent thymidylate synthase  29.76 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1441  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.63 
 
 
265 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.637537 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0028  FAD-dependent thymidylate synthase  28.29 
 
 
207 aa  84  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1861  FAD-dependent thymidylate synthase  28.37 
 
 
218 aa  83.6  0.000000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.224616  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1387  thymidylate synthase complementing protein ThyX  33.17 
 
 
269 aa  82  0.000000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0493208  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0011  FAD-dependent thymidylate synthase  28.64 
 
 
210 aa  80.5  0.00000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  29.17 
 
 
229 aa  80.5  0.00000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1800  FAD-dependent thymidylate synthase  30.32 
 
 
206 aa  79.7  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0219748  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  29.38 
 
 
233 aa  79  0.00000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2063  FAD-dependent thymidylate synthase  29.25 
 
 
235 aa  78.6  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.828676  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1625  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.12 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00115057  normal  0.386894 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1882  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.06 
 
 
217 aa  74.7  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0694605  normal  0.133921 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0769  thymidylate synthase, flavin-dependent  35.98 
 
 
244 aa  73.2  0.000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.354412  normal  0.842984 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0709  thymidylate synthase, flavin-dependent  39.13 
 
 
246 aa  72.8  0.000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.62086  normal  0.337229 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  33.14 
 
 
261 aa  72  0.000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1753  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.76 
 
 
244 aa  70.5  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  26.36 
 
 
210 aa  70.5  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0919  thymidylate synthase complementing protein ThyX  29.34 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  25.13 
 
 
212 aa  69.3  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  26.51 
 
 
210 aa  68.6  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  31.68 
 
 
233 aa  68.2  0.0000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  29.61 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  27.55 
 
 
228 aa  67  0.0000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0501  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.38 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3898  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.74 
 
 
216 aa  65.9  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.262304 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  25.71 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>