101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2038 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  100 
 
 
220 aa  461  1e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  78.24 
 
 
221 aa  359  2e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  72.56 
 
 
216 aa  346  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  73.61 
 
 
217 aa  340  1e-92  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  70.78 
 
 
222 aa  335  3.9999999999999995e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  70.37 
 
 
239 aa  329  3e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  71.73 
 
 
191 aa  298  4e-80  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  53.81 
 
 
212 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  53.81 
 
 
212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  52.48 
 
 
210 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  53.3 
 
 
210 aa  207  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  51.98 
 
 
210 aa  205  3e-52  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  52.82 
 
 
210 aa  205  4e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  52.71 
 
 
210 aa  205  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  48.28 
 
 
212 aa  195  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  30 
 
 
228 aa  89.7  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  29.85 
 
 
284 aa  85.1  8e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  33.53 
 
 
233 aa  85.1  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0311  FAD-dependent thymidylate synthase  32.96 
 
 
266 aa  81.6  0.000000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0369902  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  28.8 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  29.89 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  29.31 
 
 
293 aa  77  0.0000000000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0014  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.34 
 
 
313 aa  76.6  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  27.59 
 
 
292 aa  75.5  0.0000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  26.64 
 
 
235 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0045  FAD-dependent thymidylate synthase  28.49 
 
 
310 aa  73.2  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  24.77 
 
 
250 aa  72  0.000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  25.23 
 
 
250 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  28.24 
 
 
220 aa  69.3  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  26.09 
 
 
305 aa  68.9  0.00000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.75 
 
 
195 aa  68.2  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.15 
 
 
230 aa  68.2  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000307587  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25280  FAD-dependent thymidylate synthase  26.85 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0348718  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4274  thymidylate synthase flavin-dependent  27.78 
 
 
250 aa  67.8  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.933149  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.75 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  25.13 
 
 
229 aa  67  0.0000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  27.65 
 
 
220 aa  67  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1151  FAD-dependent thymidylate synthase  28.42 
 
 
316 aa  67.4  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.47 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  27.93 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  27.98 
 
 
261 aa  66.2  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  26.09 
 
 
318 aa  65.9  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2386  FAD-dependent thymidylate synthase  24.77 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  28.02 
 
 
325 aa  64.7  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  28.64 
 
 
226 aa  62.8  0.000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  28 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.15 
 
 
226 aa  62.4  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2189  thymidylate synthase, flavin-dependent  22.9 
 
 
250 aa  62.4  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  31.47 
 
 
228 aa  62.4  0.000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5811  FAD-dependent thymidylate synthase  25.63 
 
 
250 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2236  FAD-dependent thymidylate synthase  25.81 
 
 
233 aa  60.5  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477574  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.52 
 
 
237 aa  60.5  0.00000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  25.29 
 
 
243 aa  59.3  0.00000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2102  FAD-dependent thymidylate synthase  23.39 
 
 
254 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.213601 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2115  FAD-dependent thymidylate synthase  23.39 
 
 
254 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2161  FAD-dependent thymidylate synthase  23.39 
 
 
254 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.298336  normal  0.459496 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4942  FAD-dependent thymidylate synthase  26.84 
 
 
316 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497472  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.55 
 
 
281 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.59 
 
 
218 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.43 
 
 
279 aa  55.8  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  31.4 
 
 
229 aa  55.8  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  31.66 
 
 
234 aa  55.8  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.13 
 
 
249 aa  55.8  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  27.54 
 
 
245 aa  55.1  0.0000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1388  FAD-dependent thymidylate synthase  25.62 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  26 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  26 
 
 
263 aa  53.9  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  30.63 
 
 
229 aa  53.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.64 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  26.8 
 
 
230 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.94 
 
 
228 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.89 
 
 
223 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3547  FAD-dependent thymidylate synthase  24.14 
 
 
265 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1195  FAD-dependent thymidylate synthase  24.12 
 
 
274 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.200813  normal  0.0356101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1346  FAD-dependent thymidylate synthase  25.47 
 
 
247 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.2401  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  24 
 
 
233 aa  51.6  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1882  thymidylate synthase, flavin-dependent  25 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0694605  normal  0.133921 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.86 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2792  FAD-dependent thymidylate synthase  27.06 
 
 
285 aa  50.1  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2482  thymidylate synthase complementing protein ThyX  23.98 
 
 
232 aa  49.7  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000421387  hitchhiker  0.00846096 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  29.79 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal 
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  25.49 
 
 
265 aa  47.8  0.0001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1744  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.84 
 
 
216 aa  48.1  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246329  normal  0.887681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  25.93 
 
 
232 aa  47  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2633  thymidylate synthase (FAD)  25.6 
 
 
262 aa  47  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0928647  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  27.66 
 
 
229 aa  47.4  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  26.22 
 
 
248 aa  46.2  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  26.07 
 
 
245 aa  45.4  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2071  thymidylate synthase complementing protein ThyX  30.51 
 
 
241 aa  44.3  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0880  thymidylate synthase, flavin-dependent  22.91 
 
 
280 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0732  thymidylate synthase, flavin-dependent  22.91 
 
 
266 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  26.47 
 
 
243 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1044  thymidylate synthase complementing protein ThyX  31.71 
 
 
240 aa  44.3  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  26.84 
 
 
245 aa  43.9  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0400  thymidylate synthase complementing protein ThyX  26.39 
 
 
338 aa  43.1  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  26.32 
 
 
245 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0919  thymidylate synthase complementing protein ThyX  26.54 
 
 
324 aa  43.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  28.44 
 
 
246 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0508  thymidylate synthase complementing protein ThyX  25.56 
 
 
289 aa  42.4  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.07 
 
 
254 aa  42  0.007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>