62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0769 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  100 
 
 		 325 aa  663    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0045  FAD-dependent thymidylate synthase  69.51 
 
 		 310 aa  438  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4942  FAD-dependent thymidylate synthase  66.34 
 
 		 316 aa  423  1e-117  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  62.96 
 
 		 305 aa  394  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  61.64 
 
 		 318 aa  393  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  61.76 
 
 		 310 aa  390  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  56.14 
 
 		 284 aa  351  8.999999999999999e-96  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  55.44 
 
 		 293 aa  344  1e-93  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  56.87 
 
 		 253 aa  326  4.0000000000000003e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1151  FAD-dependent thymidylate synthase  53.59 
 
 		 316 aa  322  4e-87  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  54.11 
 
 		 292 aa  308  5.9999999999999995e-83  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0311  FAD-dependent thymidylate synthase  47.41 
 
 		 266 aa  252  6e-66  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0369902  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0014  thymidylate synthase, flavin-dependent  49.08 
 
 		 313 aa  242  7.999999999999999e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  44.83 
 
 		 228 aa  200  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  48.23 
 
 		 233 aa  201  1.9999999999999998e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  44.64 
 
 		 229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  45.13 
 
 		 220 aa  194  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  45.13 
 
 		 220 aa  192  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  42.26 
 
 		 261 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  35.23 
 
 		 265 aa  169  7e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.61 
 
 		 279 aa  122  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  38.16 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  35.5 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  33.33 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0732  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.91 
 
 		 266 aa  101  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0880  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.91 
 
 		 280 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  28.92 
 
 		 221 aa  72  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  28.65 
 
 		 212 aa  70.1  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  31.25 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  31.15 
 
 		 239 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  30.73 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  28.02 
 
 		 220 aa  64.7  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  28.42 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  27.7 
 
 		 216 aa  62  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  29.7 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.81 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.27 
 
 		 237 aa  58.2  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  27.14 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  27.17 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  27.17 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  28.96 
 
 		 191 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  27.14 
 
 		 210 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.05 
 
 		 231 aa  53.9  0.000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  27.14 
 
 		 210 aa  52.8  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.89 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  26.11 
 
 		 245 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  28.38 
 
 		 245 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.29 
 
 		 218 aa  51.2  0.00003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1044  thymidylate synthase complementing protein ThyX  27.27 
 
 		 240 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  24.53 
 
 		 263 aa  50.4  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  25.66 
 
 		 245 aa  49.7  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.75 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.08 
 
 		 260 aa  45.4  0.001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.1 
 
 		 195 aa  45.4  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  26.42 
 
 		 248 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2917  thymidylate synthase complementing protein ThyX  26.57 
 
 		 240 aa  45.8  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000386154  normal  0.0185293 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  24.27 
 
 		 250 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  23.42 
 
 		 228 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2071  thymidylate synthase complementing protein ThyX  28.73 
 
 		 241 aa  43.9  0.004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  25.59 
 
 		 226 aa  43.1  0.006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  23.77 
 
 		 232 aa  42.7  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.42 
 
 		 226 aa  42.7  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>