106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2027 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  100 
 
 
233 aa  479  1e-134  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  42.45 
 
 
228 aa  167  1e-40  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  42.2 
 
 
261 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  43.48 
 
 
233 aa  164  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  42.72 
 
 
229 aa  161  1e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  41.26 
 
 
220 aa  142  5e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  41.26 
 
 
220 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  37.85 
 
 
292 aa  136  3.0000000000000003e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  37.12 
 
 
293 aa  135  5e-31  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0014  thymidylate synthase, flavin-dependent  42.01 
 
 
313 aa  133  1.9999999999999998e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  37.25 
 
 
253 aa  129  3e-29  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  36.49 
 
 
284 aa  127  1.0000000000000001e-28  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  41.62 
 
 
243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  38.29 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0311  FAD-dependent thymidylate synthase  39.13 
 
 
266 aa  125  4.0000000000000003e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0369902  n/a   
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  35.24 
 
 
265 aa  125  6e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  38.16 
 
 
325 aa  123  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1151  FAD-dependent thymidylate synthase  39.47 
 
 
316 aa  122  7e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  36.89 
 
 
310 aa  121  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0045  FAD-dependent thymidylate synthase  37.12 
 
 
310 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4942  FAD-dependent thymidylate synthase  36.44 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497472  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  34.68 
 
 
318 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  37.22 
 
 
235 aa  114  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  36.04 
 
 
210 aa  105  4e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  35.32 
 
 
249 aa  98.2  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.9 
 
 
279 aa  97.1  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0732  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.39 
 
 
266 aa  95.1  9e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0880  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.39 
 
 
280 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  31.73 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  32.69 
 
 
210 aa  90.1  3e-17  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  31.25 
 
 
210 aa  89.4  4e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  30.43 
 
 
212 aa  89  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  31.4 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  36 
 
 
220 aa  86.3  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.86 
 
 
228 aa  85.5  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  31 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  34.86 
 
 
222 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  33.33 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  34.01 
 
 
221 aa  80.5  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.02 
 
 
226 aa  80.5  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.34 
 
 
231 aa  79.7  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  35.21 
 
 
234 aa  79.7  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  34.3 
 
 
216 aa  79.3  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  30.19 
 
 
212 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  34.83 
 
 
191 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  30.65 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.57 
 
 
230 aa  77.4  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000307587  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.14 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.55 
 
 
195 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  31.03 
 
 
245 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.46 
 
 
260 aa  75.9  0.0000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.77 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.28 
 
 
281 aa  75.5  0.0000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  32.75 
 
 
239 aa  74.3  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.94 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.94 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  31.07 
 
 
230 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  30.89 
 
 
228 aa  71.2  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  31.16 
 
 
229 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  33.53 
 
 
217 aa  71.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  30.52 
 
 
232 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2792  FAD-dependent thymidylate synthase  28.72 
 
 
285 aa  70.9  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2482  thymidylate synthase complementing protein ThyX  31.35 
 
 
232 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000421387  hitchhiker  0.00846096 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  28.38 
 
 
245 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  30.49 
 
 
226 aa  69.7  0.00000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  27.83 
 
 
245 aa  69.3  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  26.55 
 
 
233 aa  68.6  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  28.44 
 
 
263 aa  68.2  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.14 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  30.99 
 
 
229 aa  66.2  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  30.99 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  33.89 
 
 
248 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  29.77 
 
 
231 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3206  FAD-dependent thymidylate synthase  30.43 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.200528 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.9 
 
 
258 aa  64.3  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1200  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.82 
 
 
223 aa  62  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.001686  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1139  thymidylate synthase (FAD)  31.87 
 
 
282 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.421298  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.45 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1199  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.87 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1268  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.87 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.908128  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1744  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.32 
 
 
216 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246329  normal  0.887681 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1044  thymidylate synthase complementing protein ThyX  29.1 
 
 
240 aa  59.3  0.00000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3530  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  34.48 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3445  thymidylate synthase  31.67 
 
 
253 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3813  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  34.48 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  31.32 
 
 
245 aa  57.8  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2633  thymidylate synthase (FAD)  27.31 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0928647  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  29.57 
 
 
245 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.72 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0273  thymidylate synthase complementing protein ThyX  31.21 
 
 
251 aa  56.2  0.0000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2071  thymidylate synthase complementing protein ThyX  29.05 
 
 
241 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1187  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.77 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.933104 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  29.25 
 
 
246 aa  52.8  0.000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1689  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.43 
 
 
260 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.179029 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2917  thymidylate synthase complementing protein ThyX  30.51 
 
 
240 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000386154  normal  0.0185293 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1387  thymidylate synthase complementing protein ThyX  25.84 
 
 
269 aa  47  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0493208  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  27.75 
 
 
250 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2082  thymidylate synthase, flavin-dependent  38.57 
 
 
458 aa  47  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.734062  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2189  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.36 
 
 
250 aa  47  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2386  FAD-dependent thymidylate synthase  26.43 
 
 
250 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0115404 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>