65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0045 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0045  FAD-dependent thymidylate synthase  100 
 
 		 310 aa  639    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  69.51 
 
 		 325 aa  438  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  66.12 
 
 		 318 aa  419  1e-116  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4942  FAD-dependent thymidylate synthase  64.72 
 
 		 316 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  66.23 
 
 		 310 aa  416  9.999999999999999e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  68.6 
 
 		 305 aa  413  1e-114  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  56.94 
 
 		 284 aa  366  1e-100  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1151  FAD-dependent thymidylate synthase  57.56 
 
 		 316 aa  355  5e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  55.21 
 
 		 293 aa  348  9e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  55.77 
 
 		 253 aa  322  5e-87  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  52.56 
 
 		 292 aa  311  9e-84  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0311  FAD-dependent thymidylate synthase  50.19 
 
 		 266 aa  273  2.0000000000000002e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0369902  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0014  thymidylate synthase, flavin-dependent  49.07 
 
 		 313 aa  234  1.0000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  45.98 
 
 		 233 aa  190  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  41.44 
 
 		 229 aa  181  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  37.4 
 
 		 265 aa  178  1e-43  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  41.96 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  42.67 
 
 		 220 aa  176  6e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  42.67 
 
 		 220 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  39.41 
 
 		 261 aa  162  6e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  35.84 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.3 
 
 		 279 aa  111  1.0000000000000001e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0880  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.33 
 
 		 280 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0732  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.33 
 
 		 266 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  34.9 
 
 		 243 aa  99  9e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  34.9 
 
 		 235 aa  97.8  2e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  29.7 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  30.05 
 
 		 221 aa  75.1  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  28.49 
 
 		 220 aa  73.2  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  30 
 
 		 217 aa  68.6  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  29.17 
 
 		 212 aa  67.4  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  31.35 
 
 		 239 aa  67  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  31.18 
 
 		 222 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  27.47 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  26.98 
 
 		 216 aa  64.7  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  29.47 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  26.96 
 
 		 210 aa  60.8  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.22 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.26 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.26 
 
 		 195 aa  57  0.0000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  27.07 
 
 		 212 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  27.07 
 
 		 212 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  22.62 
 
 		 258 aa  54.3  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  27.92 
 
 		 210 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  27.92 
 
 		 210 aa  52.8  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.74 
 
 		 195 aa  50.8  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  24.64 
 
 		 245 aa  50.1  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  24.22 
 
 		 245 aa  49.7  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  23.77 
 
 		 245 aa  49.3  0.00009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  23.33 
 
 		 263 aa  48.5  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.84 
 
 		 249 aa  48.5  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3547  FAD-dependent thymidylate synthase  24.17 
 
 		 265 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  22.94 
 
 		 218 aa  47.8  0.0003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.96 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  25.85 
 
 		 226 aa  46.6  0.0005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.5 
 
 		 231 aa  46.2  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  22.43 
 
 		 250 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  27.87 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  25.85 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  25.85 
 
 		 228 aa  44.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  25 
 
 		 230 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  27.4 
 
 		 231 aa  44.3  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  24.31 
 
 		 228 aa  43.1  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  24.86 
 
 		 245 aa  42.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  24.66 
 
 		 229 aa  42.7  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>