101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7860 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_7860  FAD-dependent thymidylate synthase  100 
 
 
235 aa  486  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0403758  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1504  FAD-dependent thymidylate synthase  73.19 
 
 
243 aa  365  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00118656  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0062  FAD-dependent thymidylate synthase  37.99 
 
 
228 aa  141  8e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00428445 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0471  FAD-dependent thymidylate synthase  39.73 
 
 
220 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000151559  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0486  FAD-dependent thymidylate synthase  40.18 
 
 
220 aa  139  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000214395  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1909  FAD-dependent thymidylate synthase  38.81 
 
 
229 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1229  FAD-dependent thymidylate synthase  39.66 
 
 
261 aa  128  8.000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1336  FAD-dependent thymidylate synthase  36.89 
 
 
233 aa  122  7e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0311  FAD-dependent thymidylate synthase  35.43 
 
 
266 aa  115  5e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0369902  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0317  FAD-dependent thymidylate synthase  31.8 
 
 
253 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2027  thymidylate synthase (FAD)  37.67 
 
 
233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.647291  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0686  FAD-dependent thymidylate synthase  32.44 
 
 
293 aa  109  3e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00461112  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0163  FAD-dependent thymidylate synthase  32.74 
 
 
292 aa  108  5e-23  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000550226  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0934  FAD-dependent thymidylate synthase  33.48 
 
 
310 aa  107  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1198  FAD-dependent thymidylate synthase  33.63 
 
 
284 aa  107  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.197023  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4942  FAD-dependent thymidylate synthase  32.48 
 
 
316 aa  107  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.497472  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1151  FAD-dependent thymidylate synthase  35.04 
 
 
316 aa  105  4e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.596587  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0768  FAD-dependent thymidylate synthase  34.35 
 
 
305 aa  105  8e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.259768 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  34.35 
 
 
279 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0769  FAD-dependent thymidylate synthase  33.33 
 
 
325 aa  103  2e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1091  FAD-dependent thymidylate synthase  32.16 
 
 
318 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0284091 
 
 
-
 
NC_011784  BbuZS7_A66  FAD-dependent thymidylate synthase  29.46 
 
 
265 aa  99.8  4e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0045  FAD-dependent thymidylate synthase  34.9 
 
 
310 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0880  thymidylate synthase, flavin-dependent  33 
 
 
280 aa  96.3  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0732  thymidylate synthase, flavin-dependent  33 
 
 
266 aa  96.3  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1609  FAD-dependent thymidylate synthase  26.36 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03211  FAD-dependent thymidylate synthase  26.48 
 
 
212 aa  80.9  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0014  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.16 
 
 
313 aa  80.5  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03851  FAD-dependent thymidylate synthase  27.93 
 
 
210 aa  78.2  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.256114 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02761  FAD-dependent thymidylate synthase  27.56 
 
 
212 aa  77  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.990292  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02681  FAD-dependent thymidylate synthase  25.23 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0802  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.1 
 
 
218 aa  74.3  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000150033  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2038  FAD-dependent thymidylate synthase  26.64 
 
 
220 aa  73.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.81292  normal  0.670148 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0245  FAD-dependent thymidylate synthase  24.65 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02651  FAD-dependent thymidylate synthase  24.54 
 
 
210 aa  73.2  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1279  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.9 
 
 
195 aa  72.8  0.000000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0523  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.16 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1489  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.16 
 
 
195 aa  72  0.000000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1265  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.22 
 
 
195 aa  71.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02661  FAD-dependent thymidylate synthase  24.07 
 
 
210 aa  70.1  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.314215  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1838  FAD-dependent thymidylate synthase  26.7 
 
 
221 aa  70.1  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2890  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.52 
 
 
249 aa  69.7  0.00000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0819  thymidylate synthase, flavin-dependent  32.32 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000230738  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2044  FAD-dependent thymidylate synthase  28.8 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000390103  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09250  thymidylate synthase (FAD)  31.76 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0981097  normal  0.0643636 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0390  FAD-dependent thymidylate synthase  27.83 
 
 
222 aa  65.1  0.000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00258676  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0404  FAD-dependent thymidylate synthase  25.93 
 
 
217 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0366  FAD-dependent thymidylate synthase  27.49 
 
 
239 aa  64.3  0.000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2421  FAD-dependent thymidylate synthase  28.35 
 
 
245 aa  64.3  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0588955  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2383  FAD-dependent thymidylate synthase  25.73 
 
 
216 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20020  thymidylate synthase (FAD)  29.73 
 
 
226 aa  63.2  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2735  FAD-dependent thymidylate synthase  28.35 
 
 
245 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0772  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.24 
 
 
258 aa  62.8  0.000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1044  thymidylate synthase complementing protein ThyX  29.17 
 
 
240 aa  59.7  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.416178 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0173  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.31 
 
 
230 aa  59.7  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000307587  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1297  thymidylate synthase, flavin-dependent  31.68 
 
 
260 aa  58.9  0.00000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3494  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.87 
 
 
226 aa  58.9  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0404  thymidylate synthase, flavin-dependent  33.33 
 
 
223 aa  58.5  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0128021  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2693  FAD-dependent thymidylate synthase  29.14 
 
 
228 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000328347  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2482  thymidylate synthase complementing protein ThyX  29.35 
 
 
232 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000421387  hitchhiker  0.00846096 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2353  thymidylate synthase complementing protein ThyX  26.63 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.431052  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3106  FAD-dependent thymidylate synthase  31.25 
 
 
232 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2031  FAD-dependent thymidylate synthase  26.29 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.025295  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2649  FAD-dependent thymidylate synthase  26.4 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000329367  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0400  FAD-dependent thymidylate synthase  27.52 
 
 
234 aa  57  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000037909  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3711  FAD-dependent thymidylate synthase  29.87 
 
 
229 aa  55.8  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000128726  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0273  thymidylate synthase complementing protein ThyX  26.59 
 
 
251 aa  55.1  0.0000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1894  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.99 
 
 
254 aa  55.5  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.68416 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3806  FAD-dependent thymidylate synthase  29.87 
 
 
229 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1128  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.05 
 
 
226 aa  54.3  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.307637  hitchhiker  0.000034032 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2189  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.4 
 
 
250 aa  54.7  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2071  thymidylate synthase complementing protein ThyX  27.23 
 
 
241 aa  53.5  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1027  FAD-dependent thymidylate synthase  30.69 
 
 
230 aa  53.5  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00194248  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25280  FAD-dependent thymidylate synthase  26.96 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0348718  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4063  FAD-dependent thymidylate synthase  28.47 
 
 
229 aa  53.1  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000544981  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00980  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.63 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000221907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0195  FAD-dependent thymidylate synthase  29.95 
 
 
246 aa  52.4  0.000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00699129  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4274  thymidylate synthase flavin-dependent  24.02 
 
 
250 aa  52  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.933149  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3530  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  29.41 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.537663  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3445  thymidylate synthase  29.78 
 
 
253 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.277161  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3813  prophage LambdaBa01, thymidylate synthase-complementing protein  29.41 
 
 
252 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.17838  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2386  FAD-dependent thymidylate synthase  27.75 
 
 
250 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0115404 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0378  FAD-dependent thymidylate synthase  27.67 
 
 
231 aa  50.8  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000606523  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12767  FAD-dependent thymidylate synthase  24.38 
 
 
250 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3449  thymidylate synthase, flavin-dependent  30.59 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.354216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0028  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.05 
 
 
281 aa  50.8  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1762  FAD-dependent thymidylate synthase  26.58 
 
 
206 aa  50.1  0.00003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2321  FAD-dependent thymidylate synthase  23.83 
 
 
248 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.294658  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0990  FAD-dependent thymidylate synthase  25.14 
 
 
245 aa  47  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.329805  normal  0.245579 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1744  thymidylate synthase, flavin-dependent  26.17 
 
 
216 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.246329  normal  0.887681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4001  FAD-dependent thymidylate synthase  25.77 
 
 
250 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0999655 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3547  FAD-dependent thymidylate synthase  27.06 
 
 
265 aa  45.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.583534  normal  0.337603 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1148  thymidylate synthase, flavin-dependent  27.41 
 
 
267 aa  44.7  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.606793 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0189  FAD-dependent thymidylate synthase  29.29 
 
 
245 aa  44.7  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.125611  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0001  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.66 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.248117  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1753  thymidylate synthase, flavin-dependent  29.15 
 
 
244 aa  43.9  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2236  FAD-dependent thymidylate synthase  25.65 
 
 
233 aa  44.3  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000477574  normal  0.574533 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2082  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.28 
 
 
458 aa  43.5  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.734062  normal  0.451472 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1800  FAD-dependent thymidylate synthase  25 
 
 
206 aa  43.5  0.003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0219748  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0769  thymidylate synthase, flavin-dependent  28.14 
 
 
244 aa  42.4  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.354412  normal  0.842984 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>