More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00208 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00208  cytochrome like B561  100 
 
 		 185 aa  349  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.915322  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2036  cytochrome B561  35.91 
 
 		 193 aa  100  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.625854 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1861  cytochrome B561  41.76 
 
 		 178 aa  99.4  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.846018  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1513  cytochrome b561  39.01 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.141112 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2794  cytochrome B561  39.08 
 
 		 174 aa  95.9  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2711  cytochrome B561  41.07 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3013  cytochrome B561  39.16 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00637618 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3682  cytochrome B561  41.42 
 
 		 188 aa  94.4  8e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.388705  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2358  cytochrome B561  37.36 
 
 		 178 aa  92  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.289419  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3507  cytochrome B561  38.6 
 
 		 185 aa  91.3  8e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.563423 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6508  cytochrome B561  38.24 
 
 		 188 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0286753 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01688  cytochrome B561  36.75 
 
 		 187 aa  89  3e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.883966  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5081  cytochrome B561  37.58 
 
 		 175 aa  87  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.601961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2023  cytochrome B561  39.64 
 
 		 186 aa  87  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.971591  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4984  cytochrome B561  40.35 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0448124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2228  cytochrome B561  40.48 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000575966  hitchhiker  0.00851734 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3044  cytochrome B561  36.14 
 
 		 190 aa  86.3  2e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3802  cytochrome B561  36.69 
 
 		 186 aa  85.5  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0603  cytochrome B561  36.31 
 
 		 188 aa  85.1  5e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0469  cytochrome B561  36.36 
 
 		 175 aa  84.7  6e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0508  cytochrome B561  36.11 
 
 		 191 aa  84.3  9e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1636  hypothetical protein  38.1 
 
 		 184 aa  83.6  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0965469  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3930  cytochrome b561 family protein  34.13 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.698888  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1272  cytochrome B561  34.3 
 
 		 190 aa  83.6  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.900483  normal  0.0192884 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2731  cytochrome B561  33.73 
 
 		 188 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578795  normal  0.080966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4185  cytochrome B561  37.95 
 
 		 189 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0014  cytochrome B561  37.2 
 
 		 176 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000000167547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0459  cytochrome B561  38.92 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1464  cytochrome B561  34.66 
 
 		 179 aa  83.2  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0681  cytochrome B561  36.09 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.400799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0714  cytochrome B561  36.09 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.657411  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4593  cytochrome b561  38.15 
 
 		 182 aa  82  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0230  cytochrome B561  36.09 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.249542  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2093  cytochrome B561  33.53 
 
 		 175 aa  81.6  0.000000000000006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2671  cytochrome B561  37.87 
 
 		 186 aa  81.6  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.107362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0005  cytochrome B561  36.57 
 
 		 177 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0183044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2064  putative cytochrome b-561 membrane protein  35.71 
 
 		 184 aa  81.3  0.000000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.913396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0252  cytochrome B561  36.05 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0697  cytochrome B561  35.33 
 
 		 178 aa  80.5  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0006  cytochrome B561  36.59 
 
 		 176 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000161036  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0259  cytochrome B561  39.64 
 
 		 178 aa  79.7  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0009  cytochrome B561  36 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000853372  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2465  putative cytochrome b561  39.16 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.104825 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2804  cytochrome B561  44.97 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.850837  normal  0.374097 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0062  cytochrome B561  36 
 
 		 176 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000272347  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3195  cytochrome B561  36.21 
 
 		 176 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.0000000000038673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0923  cytochrome B561  35.76 
 
 		 196 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.651214  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0030  cytochrome B561  36 
 
 		 177 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000693928  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5858  cytochrome B561  36.75 
 
 		 184 aa  79  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2745  putative cytochrome B561  33.94 
 
 		 191 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.227394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1811  nickel-dependent hydrogenase b561-type cytochrome subunit  31.74 
 
 		 175 aa  78.6  0.00000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0046692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3580  cytochrome B561  40.91 
 
 		 172 aa  78.6  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2963  cytochrome B561  37.65 
 
 		 193 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1714  cytochrome B561  36.14 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00452879  normal  0.140891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7129  putative cytochrome b561  35.71 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.815078 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0629  cytochrome B561  34.91 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2886  cytochrome B561  43.45 
 
 		 177 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0147593  normal  0.995623 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2553  cytochrome B561  37.06 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.885989  normal  0.411403 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  37.13 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1182  cytochrome B561  36.9 
 
 		 179 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3152  cytochrome B561  41.73 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.159258  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0686  cytochrome b561  35.71 
 
 		 188 aa  76.6  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3685  cytochrome B561  37.24 
 
 		 184 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0706  cytochrome B561  37.95 
 
 		 186 aa  76.6  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.404491  normal  0.794115 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0605  cytochrome B561  34.91 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1447  cytochrome B561  34.34 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2179  cytochrome B561  37.93 
 
 		 203 aa  75.9  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0073  cytochrome b561, putative  37.13 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.475436  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1335  cytochrome b561 family protein  34.34 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0086  putative [Ni] hydrogenase, b-type cytochrome subunit  36.53 
 
 		 175 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.083674  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3997  putative cytochrome b-561 membrane protein  37.35 
 
 		 186 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.50922  normal  0.334764 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2725  cytochrome b561 family protein  34.34 
 
 		 174 aa  75.9  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0296  cytochrome B561  36.53 
 
 		 174 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000303628  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2896  cytochrome B561  41.57 
 
 		 177 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.950416  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1521  cytochrome B561  36.26 
 
 		 182 aa  75.1  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1169  cytochrome b561, putative  30.54 
 
 		 173 aa  75.1  0.0000000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.840411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5356  putative cytochrome b561  34.5 
 
 		 180 aa  75.1  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00398289 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0761  cytochrome B561  32.12 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.599963 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1934  cytochrome B561  39.2 
 
 		 190 aa  74.7  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.48407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52380  cytochrome b561  37.35 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.583912 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1570  cytochrome B561  36.36 
 
 		 181 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.267805 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1661  cytochrome B561  39.69 
 
 		 179 aa  73.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.142328  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2549  cytochrome B561  39.1 
 
 		 182 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.481387  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0993  cytochrome B561  32.53 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1026  cytochrome B561  33.73 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1373  cytochrome B561  31.93 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.219895  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3307  cytochrome B561  36.97 
 
 		 180 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3732  cytochrome B561  36.97 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2753  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.29 
 
 		 176 aa  73.2  0.000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000856955  normal  0.186819 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01889  predicted cytochrome  30.51 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000869737  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1677  cytochrome B561  30.51 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00102602  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2010  cytochrome B561  36.97 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00709418  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2719  putative cytochrome B-561 transmembrane protein  37.06 
 
 		 195 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.12151 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1542  cytochrome B561  37.58 
 
 		 181 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.662748  normal  0.360468 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1211  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.51 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0465638  normal  0.30426 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2389  cytochrome B561  45.83 
 
 		 177 aa  72.8  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01879  hypothetical protein  30.51 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2075  nickel-dependent hydrogenase, b-type cytochrome subunit  30.51 
 
 		 176 aa  72.8  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.22561e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1671  cytochrome B561  30.51 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00739522  normal  0.320086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3123  cytochrome B561  33.13 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>