77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4289 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4289  hypothetical protein  100 
 
 		 446 aa  915    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3615  hypothetical protein  94.39 
 
 		 442 aa  790    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130992  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3670  hypothetical protein  76.02 
 
 		 421 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.753123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1805  hypothetical protein  74.22 
 
 		 430 aa  652    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.916296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3853  hypothetical protein  96.86 
 
 		 442 aa  808    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0186652  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1579  hypothetical protein  97.53 
 
 		 442 aa  811    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2761  hypothetical protein  72.42 
 
 		 430 aa  664    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1702  hypothetical protein  78.79 
 
 		 437 aa  710    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44880  hypothetical protein  72.2 
 
 		 425 aa  601  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.798821  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3822  hypothetical protein  72.65 
 
 		 423 aa  600  1e-170  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21090  hypothetical protein  63.23 
 
 		 389 aa  523  1e-147  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0855882  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  44.57 
 
 		 438 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.201182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4873  hypothetical protein  41.56 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2430  hypothetical protein  44.32 
 
 		 404 aa  353  4e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2384  hypothetical protein  43.02 
 
 		 400 aa  352  5e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.739988  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2426  hypothetical protein  43.02 
 
 		 400 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2529  hypothetical protein  42.79 
 
 		 400 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0707182  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1917  hypothetical protein  42.57 
 
 		 448 aa  350  4e-95  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.159844  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02521  predicted membrane protein  43.31 
 
 		 426 aa  349  6e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2071  hypothetical protein  43.02 
 
 		 400 aa  348  9e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3709  hypothetical protein  41.07 
 
 		 394 aa  348  9e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191189  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  40.32 
 
 		 398 aa  343  4e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1311  hypothetical protein  40.53 
 
 		 397 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  43.82 
 
 		 438 aa  335  1e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5269  hypothetical protein  40.22 
 
 		 397 aa  333  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6120  hypothetical protein  40.09 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469522  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1958  hypothetical protein  40.09 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1982  hypothetical protein  40.09 
 
 		 397 aa  330  3e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964885 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1946  hypothetical protein  39.64 
 
 		 397 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1873  hypothetical protein  39.64 
 
 		 397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  0.121684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2325  protein of unknown function DUF989  40.76 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.547716  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1932  hypothetical protein  40.09 
 
 		 397 aa  325  1e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.781025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2433  hypothetical protein  38.98 
 
 		 401 aa  323  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4495  hypothetical protein  38.76 
 
 		 410 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122524  normal  0.0576102 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1932  protein of unknown function DUF989  39.47 
 
 		 425 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0776481 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1295  hypothetical protein  39.47 
 
 		 396 aa  319  5e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  40.14 
 
 		 419 aa  316  4e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2255  protein of unknown function DUF989  39.02 
 
 		 418 aa  316  5e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0886  hypothetical protein  39.78 
 
 		 402 aa  315  8e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0272876  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3141  protein of unknown function DUF989  38.01 
 
 		 412 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3889  hypothetical protein  38.95 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  38.5 
 
 		 412 aa  313  5.999999999999999e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2869  protein of unknown function DUF989  37.78 
 
 		 412 aa  312  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0455  hypothetical protein  37.78 
 
 		 411 aa  311  2e-83  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0353  hypothetical protein  37.93 
 
 		 414 aa  306  4.0000000000000004e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2045  hypothetical protein  37.7 
 
 		 394 aa  301  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2611  hypothetical protein  37.84 
 
 		 413 aa  300  3e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3325  hypothetical protein  37.93 
 
 		 410 aa  300  5e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2837  hypothetical protein  36.18 
 
 		 404 aa  296  6e-79  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3207  protein of unknown function DUF989  38.6 
 
 		 410 aa  296  7e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.175006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3294  hypothetical protein  38.78 
 
 		 407 aa  295  9e-79  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.198313  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1345  protein of unknown function DUF989  38.63 
 
 		 397 aa  293  3e-78  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20155  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3268  hypothetical protein  37.3 
 
 		 406 aa  293  5e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152004 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  37.47 
 
 		 415 aa  292  6e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3583  class I monoheme cytochrome c  37.07 
 
 		 406 aa  291  1e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22446  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1151  hypothetical protein  36.22 
 
 		 399 aa  288  1e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3922  protein of unknown function DUF989  36.84 
 
 		 401 aa  277  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0780  putative transmembrane protein  35.36 
 
 		 399 aa  275  9e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1430  putative transmembrane protein  35.32 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2115  hypothetical protein  46.42 
 
 		 414 aa  271  2e-71  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.766532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1071  protein of unknown function DUF989  37.42 
 
 		 416 aa  271  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276689  decreased coverage  0.0064959 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1142  hypothetical protein  34.73 
 
 		 406 aa  271  2e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2061  protein of unknown function DUF989  35.7 
 
 		 416 aa  266  8e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.076874  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1742  hypothetical protein  35.92 
 
 		 416 aa  265  1e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1119  hypothetical protein  35.75 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697257 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6197  hypothetical protein  46.57 
 
 		 417 aa  262  8e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1103  hypothetical protein  34.44 
 
 		 400 aa  255  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0780  hypothetical protein  33.41 
 
 		 408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1128  hypothetical protein  45.16 
 
 		 401 aa  243  7e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.143546  normal  0.514398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1048  protein of unknown function DUF989  44.8 
 
 		 401 aa  241  2e-62  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2128  hypothetical protein  41.86 
 
 		 443 aa  236  8e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0357  hypothetical protein  44.16 
 
 		 405 aa  231  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  24.22 
 
 		 174 aa  53.9  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  27.67 
 
 		 253 aa  51.2  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  25.32 
 
 		 204 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  20.72 
 
 		 202 aa  45.8  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1852  hypothetical protein  20.72 
 
 		 166 aa  43.1  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>