73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_1742 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010172  Mext_1742  hypothetical protein  100 
 
 
416 aa  838    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1071  protein of unknown function DUF989  94.23 
 
 
416 aa  728    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276689  decreased coverage  0.0064959 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2061  protein of unknown function DUF989  98.8 
 
 
416 aa  830    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.076874  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3294  hypothetical protein  54.11 
 
 
407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.198313  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6197  hypothetical protein  53.72 
 
 
417 aa  410  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2045  hypothetical protein  50.49 
 
 
394 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2837  hypothetical protein  46.45 
 
 
404 aa  373  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  46.6 
 
 
412 aa  371  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3889  hypothetical protein  47.58 
 
 
408 aa  371  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3268  hypothetical protein  47.2 
 
 
406 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.152004 
 
 
-
 
NC_004310  BR0353  hypothetical protein  46.67 
 
 
414 aa  366  1e-100  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3583  class I monoheme cytochrome c  47.2 
 
 
406 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22446  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0455  hypothetical protein  45.45 
 
 
411 aa  368  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4495  hypothetical protein  46.44 
 
 
410 aa  360  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122524  normal  0.0576102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3325  hypothetical protein  44.53 
 
 
410 aa  355  5.999999999999999e-97  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3141  protein of unknown function DUF989  44.36 
 
 
412 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182707  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2869  protein of unknown function DUF989  44.12 
 
 
412 aa  348  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3207  protein of unknown function DUF989  44.07 
 
 
410 aa  346  6e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.175006 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  43.55 
 
 
419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2611  hypothetical protein  42.13 
 
 
413 aa  335  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  42.48 
 
 
415 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6120  hypothetical protein  41.3 
 
 
397 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469522  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1958  hypothetical protein  41.3 
 
 
397 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1982  hypothetical protein  41.3 
 
 
397 aa  310  4e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964885 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1946  hypothetical protein  41.3 
 
 
397 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5269  hypothetical protein  41.06 
 
 
397 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2071  hypothetical protein  43.06 
 
 
400 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1311  hypothetical protein  40.58 
 
 
397 aa  307  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3709  hypothetical protein  40.62 
 
 
394 aa  306  4.0000000000000004e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191189  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1873  hypothetical protein  41.06 
 
 
397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  0.121684 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2529  hypothetical protein  43.24 
 
 
400 aa  306  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0707182  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2426  hypothetical protein  43.24 
 
 
400 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2384  hypothetical protein  43.24 
 
 
400 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.739988  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1295  hypothetical protein  42.27 
 
 
396 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353438  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2325  protein of unknown function DUF989  41.79 
 
 
397 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.547716  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1932  hypothetical protein  41.79 
 
 
397 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.781025  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1345  protein of unknown function DUF989  41.47 
 
 
397 aa  302  9e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20155  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1702  hypothetical protein  37.95 
 
 
437 aa  300  4e-80  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317159  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0886  hypothetical protein  39.86 
 
 
402 aa  296  4e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0272876  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2433  hypothetical protein  38.66 
 
 
401 aa  296  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2761  hypothetical protein  37.7 
 
 
430 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1932  protein of unknown function DUF989  39.95 
 
 
425 aa  292  7e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0776481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2255  protein of unknown function DUF989  41.04 
 
 
418 aa  292  9e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2115  hypothetical protein  41.9 
 
 
414 aa  291  2e-77  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.766532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3670  hypothetical protein  40.05 
 
 
421 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.753123  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2430  hypothetical protein  39.04 
 
 
404 aa  286  4e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1151  hypothetical protein  39.14 
 
 
399 aa  281  2e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1805  hypothetical protein  37.5 
 
 
430 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.916296  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02521  predicted membrane protein  38.24 
 
 
426 aa  277  3e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1142  hypothetical protein  40.67 
 
 
406 aa  276  6e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0780  putative transmembrane protein  41.53 
 
 
399 aa  276  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3922  protein of unknown function DUF989  38.53 
 
 
401 aa  274  2.0000000000000002e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4873  hypothetical protein  34.7 
 
 
401 aa  272  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1430  putative transmembrane protein  38.82 
 
 
405 aa  272  9e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21090  hypothetical protein  41.59 
 
 
389 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0855882  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44880  hypothetical protein  38.08 
 
 
425 aa  270  2e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.798821  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3822  hypothetical protein  38.26 
 
 
423 aa  268  1e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115673  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3615  hypothetical protein  36.44 
 
 
442 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130992  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4289  hypothetical protein  35.68 
 
 
446 aa  267  2e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1579  hypothetical protein  35.78 
 
 
442 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3853  hypothetical protein  35.78 
 
 
442 aa  266  4e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0186652  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0357  hypothetical protein  39.61 
 
 
405 aa  264  2e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155454 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  35.51 
 
 
398 aa  263  3e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1119  hypothetical protein  38.57 
 
 
405 aa  258  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.697257 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  36.69 
 
 
438 aa  257  2e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.201182 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1917  hypothetical protein  33.86 
 
 
448 aa  253  5.000000000000001e-66  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.159844  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0780  hypothetical protein  37.71 
 
 
408 aa  252  7e-66  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1103  hypothetical protein  38.12 
 
 
400 aa  249  5e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  37.71 
 
 
438 aa  247  4e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1048  protein of unknown function DUF989  39.19 
 
 
401 aa  245  9.999999999999999e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1128  hypothetical protein  38.95 
 
 
401 aa  243  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.143546  normal  0.514398 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2128  hypothetical protein  43.09 
 
 
443 aa  223  6e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  25.55 
 
 
174 aa  46.2  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>