77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3615 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4289  hypothetical protein  93.05 
 
 
446 aa  780    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3615  hypothetical protein  100 
 
 
442 aa  908    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130992  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3853  hypothetical protein  95.48 
 
 
442 aa  789    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0186652  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3670  hypothetical protein  75.85 
 
 
421 aa  660    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.753123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1805  hypothetical protein  73.98 
 
 
430 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.916296  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1579  hypothetical protein  95.7 
 
 
442 aa  791    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2761  hypothetical protein  72.85 
 
 
430 aa  660    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1702  hypothetical protein  78.38 
 
 
437 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317159  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44880  hypothetical protein  72.85 
 
 
425 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.798821  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3822  hypothetical protein  72.17 
 
 
423 aa  596  1e-169  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21090  hypothetical protein  64.48 
 
 
389 aa  528  1e-149  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0855882  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  45.19 
 
 
438 aa  376  1e-103  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.201182 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4873  hypothetical protein  42.15 
 
 
401 aa  360  2e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3709  hypothetical protein  41.89 
 
 
394 aa  353  4e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191189  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2430  hypothetical protein  44.85 
 
 
404 aa  352  7e-96  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02521  predicted membrane protein  43.94 
 
 
426 aa  349  6e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1917  hypothetical protein  41.94 
 
 
448 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.159844  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2426  hypothetical protein  42.95 
 
 
400 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2384  hypothetical protein  42.95 
 
 
400 aa  346  4e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.739988  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2529  hypothetical protein  42.73 
 
 
400 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0707182  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  40.68 
 
 
398 aa  343  4e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2071  hypothetical protein  42.73 
 
 
400 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  44.9 
 
 
438 aa  339  5e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1345  protein of unknown function DUF989  41.61 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20155  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1311  hypothetical protein  40.67 
 
 
397 aa  331  2e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5269  hypothetical protein  40.13 
 
 
397 aa  327  3e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6120  hypothetical protein  40 
 
 
397 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1982  hypothetical protein  40 
 
 
397 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964885 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1946  hypothetical protein  39.78 
 
 
397 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1958  hypothetical protein  40 
 
 
397 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1873  hypothetical protein  39.78 
 
 
397 aa  323  5e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  0.121684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2325  protein of unknown function DUF989  40.45 
 
 
397 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.547716  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4495  hypothetical protein  39.72 
 
 
410 aa  321  1.9999999999999998e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122524  normal  0.0576102 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2115  hypothetical protein  41.61 
 
 
414 aa  320  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.766532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2433  hypothetical protein  39.78 
 
 
401 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1932  hypothetical protein  40 
 
 
397 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.781025  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1932  protein of unknown function DUF989  39.6 
 
 
425 aa  317  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0776481 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3141  protein of unknown function DUF989  38.13 
 
 
412 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182707  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1295  hypothetical protein  39.82 
 
 
396 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353438  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2255  protein of unknown function DUF989  38.39 
 
 
418 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  39.08 
 
 
412 aa  313  2.9999999999999996e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2869  protein of unknown function DUF989  37.9 
 
 
412 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0455  hypothetical protein  38.5 
 
 
411 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3889  hypothetical protein  39.31 
 
 
408 aa  313  5.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0886  hypothetical protein  39.24 
 
 
402 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0272876  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2837  hypothetical protein  36.55 
 
 
404 aa  311  1e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  39.59 
 
 
419 aa  310  5e-83  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0353  hypothetical protein  38.28 
 
 
414 aa  307  2.0000000000000002e-82  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2045  hypothetical protein  38.1 
 
 
394 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2611  hypothetical protein  37.5 
 
 
413 aa  301  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3325  hypothetical protein  38.52 
 
 
410 aa  301  1e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3583  class I monoheme cytochrome c  37.88 
 
 
406 aa  298  1e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22446  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3268  hypothetical protein  37.88 
 
 
406 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.152004 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3207  protein of unknown function DUF989  38.72 
 
 
410 aa  295  1e-78  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.175006 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  37.59 
 
 
415 aa  290  3e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1151  hypothetical protein  37 
 
 
399 aa  289  6e-77  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3294  hypothetical protein  37.99 
 
 
407 aa  289  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.198313  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0780  putative transmembrane protein  36.11 
 
 
399 aa  278  1e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3922  protein of unknown function DUF989  37.31 
 
 
401 aa  276  5e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1430  putative transmembrane protein  35.46 
 
 
405 aa  271  2e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1142  hypothetical protein  34.29 
 
 
406 aa  268  2e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1071  protein of unknown function DUF989  37.08 
 
 
416 aa  268  2e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276689  decreased coverage  0.0064959 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1119  hypothetical protein  37.58 
 
 
405 aa  265  1e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.697257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2061  protein of unknown function DUF989  36.69 
 
 
416 aa  264  3e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.076874  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1742  hypothetical protein  36.91 
 
 
416 aa  263  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6197  hypothetical protein  46.93 
 
 
417 aa  263  4.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1103  hypothetical protein  34.97 
 
 
400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0780  hypothetical protein  33.86 
 
 
408 aa  240  4e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1128  hypothetical protein  44.44 
 
 
401 aa  238  1e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.143546  normal  0.514398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1048  protein of unknown function DUF989  44.09 
 
 
401 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2128  hypothetical protein  42.65 
 
 
443 aa  231  2e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0357  hypothetical protein  43.43 
 
 
405 aa  227  3e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155454 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  24.22 
 
 
174 aa  54.7  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  27.78 
 
 
253 aa  52.4  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  21.17 
 
 
202 aa  49.7  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  22.41 
 
 
204 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2966  hypothetical protein  30.56 
 
 
236 aa  43.1  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>