75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1372 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  100 
 
 		 174 aa  348  3e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1852  hypothetical protein  57.56 
 
 		 166 aa  176  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0576  hypothetical protein  49.69 
 
 		 197 aa  147  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  50.3 
 
 		 204 aa  141  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1384  hypothetical protein  47.2 
 
 		 197 aa  140  7e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  48.17 
 
 		 202 aa  132  3e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3105  hypothetical protein  46.95 
 
 		 204 aa  124  8.000000000000001e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2734  hypothetical protein  49.4 
 
 		 190 aa  123  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2934  membrane-like protein  49.08 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2966  hypothetical protein  43.33 
 
 		 236 aa  115  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280918  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1398  hypothetical protein  45.83 
 
 		 190 aa  115  3e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259428  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2838  membrane protein  41.14 
 
 		 166 aa  115  3.9999999999999997e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768899  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0886  transcription antitermination protein NusG  43.83 
 
 		 212 aa  107  8.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  hitchhiker  0.00000687026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  45.07 
 
 		 253 aa  63.5  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_004310  BR0353  hypothetical protein  26.84 
 
 		 414 aa  60.8  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0455  hypothetical protein  27.23 
 
 		 411 aa  60.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2045  hypothetical protein  29.49 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  28.45 
 
 		 438 aa  58.9  0.00000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  27.85 
 
 		 412 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3709  hypothetical protein  28.09 
 
 		 394 aa  58.2  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  26.92 
 
 		 415 aa  57  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2761  hypothetical protein  24.89 
 
 		 430 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  26.61 
 
 		 419 aa  56.6  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3325  hypothetical protein  24.89 
 
 		 410 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4873  hypothetical protein  24.26 
 
 		 401 aa  55.5  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3853  hypothetical protein  25 
 
 		 442 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0186652  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3615  hypothetical protein  24.22 
 
 		 442 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4495  hypothetical protein  26.38 
 
 		 410 aa  54.7  0.0000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122524  normal  0.0576102 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4289  hypothetical protein  24.44 
 
 		 446 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1579  hypothetical protein  24.22 
 
 		 442 aa  53.9  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  27.62 
 
 		 438 aa  52.4  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.201182 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1805  hypothetical protein  23.32 
 
 		 430 aa  52.4  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.916296  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3670  hypothetical protein  23.32 
 
 		 421 aa  52  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.753123  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2837  hypothetical protein  26.69 
 
 		 404 aa  52  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3141  protein of unknown function DUF989  27.35 
 
 		 412 aa  51.2  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3294  hypothetical protein  23.18 
 
 		 407 aa  50.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.198313  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02521  predicted membrane protein  25.74 
 
 		 426 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21090  hypothetical protein  25.55 
 
 		 389 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0855882  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1345  protein of unknown function DUF989  25.94 
 
 		 397 aa  49.3  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20155  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1917  hypothetical protein  25.43 
 
 		 448 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.159844  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1071  protein of unknown function DUF989  25.33 
 
 		 416 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276689  decreased coverage  0.0064959 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1702  hypothetical protein  24.44 
 
 		 437 aa  48.1  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3822  hypothetical protein  25.55 
 
 		 423 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115673  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44880  hypothetical protein  25.55 
 
 		 425 aa  47.8  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.798821  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1311  hypothetical protein  25.73 
 
 		 397 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3207  protein of unknown function DUF989  24.79 
 
 		 410 aa  46.2  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.175006 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1742  hypothetical protein  24.89 
 
 		 416 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2430  hypothetical protein  35.05 
 
 		 404 aa  46.2  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1946  hypothetical protein  24.48 
 
 		 397 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2869  protein of unknown function DUF989  24.58 
 
 		 412 aa  45.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0886  hypothetical protein  23.73 
 
 		 402 aa  45.4  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0272876  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  22.27 
 
 		 398 aa  45.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1048  protein of unknown function DUF989  25.96 
 
 		 401 aa  45.4  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2061  protein of unknown function DUF989  24.44 
 
 		 416 aa  45.1  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.076874  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1128  hypothetical protein  25.11 
 
 		 401 aa  45.1  0.0005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.143546  normal  0.514398 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1958  hypothetical protein  24.07 
 
 		 397 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6120  hypothetical protein  24.07 
 
 		 397 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1982  hypothetical protein  24.07 
 
 		 397 aa  44.7  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964885 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1151  hypothetical protein  29.41 
 
 		 399 aa  45.1  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5269  hypothetical protein  24.07 
 
 		 397 aa  44.3  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165228 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2071  hypothetical protein  24.58 
 
 		 400 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1873  hypothetical protein  24.07 
 
 		 397 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  0.121684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1103  hypothetical protein  34.57 
 
 		 400 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2611  hypothetical protein  23.18 
 
 		 413 aa  43.5  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6197  hypothetical protein  35 
 
 		 417 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2433  hypothetical protein  35.37 
 
 		 401 aa  42  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2128  hypothetical protein  30.86 
 
 		 443 aa  42  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2529  hypothetical protein  22.88 
 
 		 400 aa  41.6  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0707182  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0780  hypothetical protein  32.53 
 
 		 408 aa  42  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3889  hypothetical protein  23.18 
 
 		 408 aa  41.6  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2255  protein of unknown function DUF989  26.63 
 
 		 418 aa  41.6  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1430  putative transmembrane protein  32.53 
 
 		 405 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1932  protein of unknown function DUF989  26.63 
 
 		 425 aa  41.2  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0776481 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2426  hypothetical protein  22.88 
 
 		 400 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2384  hypothetical protein  22.88 
 
 		 400 aa  41.6  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.739988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>