74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2255 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2115  hypothetical protein  85.41 
 
 		 414 aa  685    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.766532 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1932  protein of unknown function DUF989  95.53 
 
 		 425 aa  763    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0776481 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2255  protein of unknown function DUF989  100 
 
 		 418 aa  852    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2433  hypothetical protein  72.01 
 
 		 401 aa  630  1e-179  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0886  hypothetical protein  71.22 
 
 		 402 aa  604  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0272876  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5269  hypothetical protein  60.58 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165228 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6120  hypothetical protein  60.48 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469522  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1982  hypothetical protein  60.48 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964885 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1958  hypothetical protein  60.48 
 
 		 397 aa  522  1e-147  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1311  hypothetical protein  60.48 
 
 		 397 aa  523  1e-147  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1946  hypothetical protein  60.24 
 
 		 397 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1295  hypothetical protein  59.76 
 
 		 396 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1873  hypothetical protein  60 
 
 		 397 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  0.121684 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2325  protein of unknown function DUF989  59.04 
 
 		 397 aa  512  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.547716  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2529  hypothetical protein  59.52 
 
 		 400 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0707182  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1932  hypothetical protein  58.55 
 
 		 397 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.781025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2426  hypothetical protein  59.52 
 
 		 400 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2384  hypothetical protein  59.52 
 
 		 400 aa  504  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.739988  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1430  putative transmembrane protein  58.59 
 
 		 405 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1142  hypothetical protein  58.81 
 
 		 406 aa  496  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2071  hypothetical protein  58.31 
 
 		 400 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3922  protein of unknown function DUF989  56.57 
 
 		 401 aa  476  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0357  hypothetical protein  57.45 
 
 		 405 aa  467  9.999999999999999e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.155454 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1119  hypothetical protein  56.5 
 
 		 405 aa  466  9.999999999999999e-131  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.697257 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1103  hypothetical protein  55.5 
 
 		 400 aa  454  1.0000000000000001e-126  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0780  hypothetical protein  54.61 
 
 		 408 aa  449  1e-125  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0780  putative transmembrane protein  56.87 
 
 		 399 aa  450  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2128  hypothetical protein  55.13 
 
 		 443 aa  444  1e-123  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1151  hypothetical protein  52.64 
 
 		 399 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1128  hypothetical protein  56.84 
 
 		 401 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.143546  normal  0.514398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1048  protein of unknown function DUF989  56.6 
 
 		 401 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1345  protein of unknown function DUF989  48.93 
 
 		 397 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20155  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2761  hypothetical protein  41.97 
 
 		 430 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3709  hypothetical protein  45.13 
 
 		 394 aa  354  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0455  hypothetical protein  43.99 
 
 		 411 aa  353  4e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2837  hypothetical protein  44.95 
 
 		 404 aa  352  7e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0353  hypothetical protein  44.17 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  46.56 
 
 		 412 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2045  hypothetical protein  44.69 
 
 		 394 aa  346  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3141  protein of unknown function DUF989  45.22 
 
 		 412 aa  346  5e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2869  protein of unknown function DUF989  45.22 
 
 		 412 aa  342  7e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4495  hypothetical protein  44.58 
 
 		 410 aa  339  4e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122524  normal  0.0576102 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1702  hypothetical protein  41.08 
 
 		 437 aa  338  8e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3325  hypothetical protein  45.08 
 
 		 410 aa  334  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3889  hypothetical protein  45.87 
 
 		 408 aa  333  4e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3670  hypothetical protein  41.3 
 
 		 421 aa  330  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.753123  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1579  hypothetical protein  39.96 
 
 		 442 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3853  hypothetical protein  39.96 
 
 		 442 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0186652  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44880  hypothetical protein  42.23 
 
 		 425 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.798821  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3615  hypothetical protein  39.96 
 
 		 442 aa  325  1e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  43.86 
 
 		 419 aa  322  6e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1805  hypothetical protein  40.23 
 
 		 430 aa  322  8e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.916296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3822  hypothetical protein  41.72 
 
 		 423 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115673  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02521  predicted membrane protein  42.08 
 
 		 426 aa  320  1.9999999999999998e-86  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2430  hypothetical protein  41.36 
 
 		 404 aa  320  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4289  hypothetical protein  39.38 
 
 		 446 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3294  hypothetical protein  41.77 
 
 		 407 aa  318  1e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.198313  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4873  hypothetical protein  41.37 
 
 		 401 aa  315  8e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3268  hypothetical protein  43.86 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.152004 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3583  class I monoheme cytochrome c  43.37 
 
 		 406 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22446  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1917  hypothetical protein  39.69 
 
 		 448 aa  311  2e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.159844  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  41.83 
 
 		 415 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2061  protein of unknown function DUF989  42.52 
 
 		 416 aa  306  3e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.076874  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  40.28 
 
 		 398 aa  305  7e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1742  hypothetical protein  41.82 
 
 		 416 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2611  hypothetical protein  40.05 
 
 		 413 aa  299  5e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21090  hypothetical protein  39.43 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0855882  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1071  protein of unknown function DUF989  41.36 
 
 		 416 aa  297  3e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276689  decreased coverage  0.0064959 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6197  hypothetical protein  43 
 
 		 417 aa  295  1e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3207  protein of unknown function DUF989  39.56 
 
 		 410 aa  286  7e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.175006 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  37.89 
 
 		 438 aa  270  4e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.201182 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  36.77 
 
 		 438 aa  248  1e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  22.57 
 
 		 202 aa  47  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  23.61 
 
 		 204 aa  45.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>