76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_1702 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_4289  hypothetical protein  79.02 
 
 
446 aa  680    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3615  hypothetical protein  78.6 
 
 
442 aa  674    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130992  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2761  hypothetical protein  73.23 
 
 
430 aa  649    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3670  hypothetical protein  78.52 
 
 
421 aa  675    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.753123  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1805  hypothetical protein  78.13 
 
 
430 aa  674    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.916296  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1579  hypothetical protein  79.95 
 
 
442 aa  685    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3853  hypothetical protein  80.18 
 
 
442 aa  685    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0186652  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1702  hypothetical protein  100 
 
 
437 aa  890    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317159  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44880  hypothetical protein  72.31 
 
 
425 aa  599  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.798821  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3822  hypothetical protein  71.4 
 
 
423 aa  592  1e-168  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21090  hypothetical protein  64.76 
 
 
389 aa  518  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0855882  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  45.62 
 
 
438 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.201182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3709  hypothetical protein  44.65 
 
 
394 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191189  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2430  hypothetical protein  45.85 
 
 
404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4873  hypothetical protein  41.72 
 
 
401 aa  356  5e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02521  predicted membrane protein  44.8 
 
 
426 aa  352  8.999999999999999e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.216294  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2071  hypothetical protein  43.21 
 
 
400 aa  349  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2426  hypothetical protein  42.73 
 
 
400 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2384  hypothetical protein  42.73 
 
 
400 aa  348  9e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.739988  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2529  hypothetical protein  42.73 
 
 
400 aa  348  1e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0707182  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1917  hypothetical protein  42.92 
 
 
448 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.159844  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  41.61 
 
 
398 aa  344  2e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  43.44 
 
 
438 aa  340  2.9999999999999998e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1311  hypothetical protein  41.36 
 
 
397 aa  338  8e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5269  hypothetical protein  40.59 
 
 
397 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.165228 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1345  protein of unknown function DUF989  42.21 
 
 
397 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.20155  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1946  hypothetical protein  41.04 
 
 
397 aa  335  7.999999999999999e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  42.26 
 
 
419 aa  335  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1958  hypothetical protein  41.27 
 
 
397 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1873  hypothetical protein  40.82 
 
 
397 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  0.121684 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1982  hypothetical protein  41.27 
 
 
397 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964885 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6120  hypothetical protein  41.27 
 
 
397 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469522  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3889  hypothetical protein  41.86 
 
 
408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.619788 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1932  hypothetical protein  40.45 
 
 
397 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.781025  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2325  protein of unknown function DUF989  41.5 
 
 
397 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.547716  normal  0.41049 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0455  hypothetical protein  38.57 
 
 
411 aa  325  7e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1932  protein of unknown function DUF989  40.5 
 
 
425 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0776481 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  39.44 
 
 
412 aa  323  3e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3141  protein of unknown function DUF989  38.94 
 
 
412 aa  320  3e-86  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.182707  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2255  protein of unknown function DUF989  40.72 
 
 
418 aa  320  3e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2433  hypothetical protein  40.09 
 
 
401 aa  320  3e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2837  hypothetical protein  36.98 
 
 
404 aa  318  9e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1295  hypothetical protein  41.5 
 
 
396 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.353438  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2045  hypothetical protein  40.51 
 
 
394 aa  318  1e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2869  protein of unknown function DUF989  39.17 
 
 
412 aa  317  2e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.492363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2115  hypothetical protein  42.12 
 
 
414 aa  317  3e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.766441  normal  0.766532 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4495  hypothetical protein  38.64 
 
 
410 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122524  normal  0.0576102 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3325  hypothetical protein  39.91 
 
 
410 aa  315  9.999999999999999e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0353  hypothetical protein  38.5 
 
 
414 aa  312  7.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0886  hypothetical protein  39.55 
 
 
402 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0272876  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3268  hypothetical protein  38.79 
 
 
406 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.152004 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3583  class I monoheme cytochrome c  39.02 
 
 
406 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.22446  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2611  hypothetical protein  37.61 
 
 
413 aa  302  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3294  hypothetical protein  40.05 
 
 
407 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.198313  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  38.37 
 
 
415 aa  295  8e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1151  hypothetical protein  37.5 
 
 
399 aa  295  1e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.782988  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3207  protein of unknown function DUF989  37.73 
 
 
410 aa  290  3e-77  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.175006 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2061  protein of unknown function DUF989  37.92 
 
 
416 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.076874  hitchhiker  0.00707187 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1742  hypothetical protein  37.7 
 
 
416 aa  283  5.000000000000001e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.364347  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1071  protein of unknown function DUF989  39 
 
 
416 aa  283  6.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276689  decreased coverage  0.0064959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3922  protein of unknown function DUF989  37.53 
 
 
401 aa  276  4e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0780  putative transmembrane protein  35.84 
 
 
399 aa  276  5e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6197  hypothetical protein  47.58 
 
 
417 aa  261  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.328689 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1430  putative transmembrane protein  34.82 
 
 
405 aa  261  2e-68  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.3347 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1142  hypothetical protein  34.46 
 
 
406 aa  261  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1103  hypothetical protein  35.14 
 
 
400 aa  259  8e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1119  hypothetical protein  34.68 
 
 
405 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.697257 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0780  hypothetical protein  34.83 
 
 
408 aa  246  4e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1128  hypothetical protein  42.29 
 
 
401 aa  229  8e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.143546  normal  0.514398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1048  protein of unknown function DUF989  42.29 
 
 
401 aa  229  1e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2128  hypothetical protein  41 
 
 
443 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.3228 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0357  hypothetical protein  41.25 
 
 
405 aa  224  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.155454 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  27.31 
 
 
253 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  23.32 
 
 
174 aa  47.8  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  21.17 
 
 
202 aa  45.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  26.67 
 
 
204 aa  43.9  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>