56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3039 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  403  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  63.24 
 
 		 202 aa  254  9e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1384  hypothetical protein  62.38 
 
 		 197 aa  228  6e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0576  hypothetical protein  60.89 
 
 		 197 aa  221  6e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2734  hypothetical protein  57.29 
 
 		 190 aa  188  4e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101284  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3105  hypothetical protein  50.72 
 
 		 204 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2934  membrane-like protein  58.23 
 
 		 188 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1398  hypothetical protein  56.96 
 
 		 190 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259428  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1852  hypothetical protein  52.83 
 
 		 166 aa  143  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  50.3 
 
 		 174 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0886  transcription antitermination protein NusG  41.25 
 
 		 212 aa  115  3.9999999999999997e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  hitchhiker  0.00000687026 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2966  hypothetical protein  40.85 
 
 		 236 aa  111  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280918  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2838  membrane protein  35.8 
 
 		 166 aa  97.4  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768899  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  35.71 
 
 		 253 aa  55.1  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  24.45 
 
 		 412 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_004310  BR0353  hypothetical protein  24.89 
 
 		 414 aa  53.9  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  23.04 
 
 		 419 aa  52  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0455  hypothetical protein  25.64 
 
 		 411 aa  51.2  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.730035  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  23.38 
 
 		 398 aa  48.5  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4873  hypothetical protein  25.75 
 
 		 401 aa  48.5  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2430  hypothetical protein  25.42 
 
 		 404 aa  48.1  0.00009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3709  hypothetical protein  23.79 
 
 		 394 aa  47.8  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.191189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2761  hypothetical protein  23.21 
 
 		 430 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.654808  normal  0.643822 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  35.29 
 
 		 415 aa  47.4  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1702  hypothetical protein  23.11 
 
 		 437 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  26.29 
 
 		 438 aa  47  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4289  hypothetical protein  23.61 
 
 		 446 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1579  hypothetical protein  23.61 
 
 		 442 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0886  hypothetical protein  25.11 
 
 		 402 aa  46.6  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0272876  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2255  protein of unknown function DUF989  24.15 
 
 		 418 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3615  hypothetical protein  22.41 
 
 		 442 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.130992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3853  hypothetical protein  23.61 
 
 		 442 aa  47  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0186652  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1932  protein of unknown function DUF989  23.61 
 
 		 425 aa  46.2  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0776481 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1805  hypothetical protein  21.88 
 
 		 430 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.916296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2611  hypothetical protein  22.61 
 
 		 413 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0780  hypothetical protein  23.5 
 
 		 408 aa  44.7  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0430239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44880  hypothetical protein  35.94 
 
 		 425 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.798821  normal  0.217943 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  39.06 
 
 		 438 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.201182 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3822  hypothetical protein  35.94 
 
 		 423 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0115673  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3207  protein of unknown function DUF989  34.38 
 
 		 410 aa  43.5  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.175006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3294  hypothetical protein  37.5 
 
 		 407 aa  43.5  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.198313  normal  0.824259 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2433  hypothetical protein  24.24 
 
 		 401 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1311  hypothetical protein  23.81 
 
 		 397 aa  42.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0221433 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1369  hypothetical protein  32.39 
 
 		 251 aa  43.1  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3670  hypothetical protein  22.32 
 
 		 421 aa  43.1  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.753123  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1142  hypothetical protein  23.5 
 
 		 406 aa  42.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5269  hypothetical protein  23.58 
 
 		 397 aa  42.4  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.165228 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1982  hypothetical protein  23.14 
 
 		 397 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0964885 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4495  hypothetical protein  37.5 
 
 		 410 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122524  normal  0.0576102 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3922  protein of unknown function DUF989  23.18 
 
 		 401 aa  42.4  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6120  hypothetical protein  23.14 
 
 		 397 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.469522  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1958  hypothetical protein  23.14 
 
 		 397 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1917  hypothetical protein  24.47 
 
 		 448 aa  42  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.159844  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3325  hypothetical protein  31.76 
 
 		 410 aa  41.6  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.414273  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1873  hypothetical protein  23.38 
 
 		 397 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.147429  normal  0.121684 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1946  hypothetical protein  23.38 
 
 		 397 aa  41.2  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>