29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1852 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1852  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  331  3e-90  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1372  hypothetical protein  57.56 
 
 		 174 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3039  hypothetical protein  52.83 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1384  hypothetical protein  49.67 
 
 		 197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0576  hypothetical protein  49.35 
 
 		 197 aa  136  1e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2734  hypothetical protein  53.1 
 
 		 190 aa  130  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1897  hypothetical protein  49.35 
 
 		 202 aa  127  6e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.169609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2934  membrane-like protein  49.35 
 
 		 188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.391683 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2838  membrane protein  44.79 
 
 		 166 aa  123  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.768899  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3105  hypothetical protein  44.58 
 
 		 204 aa  118  3.9999999999999996e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.27509  normal  0.295178 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2966  hypothetical protein  45.88 
 
 		 236 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280918  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1398  hypothetical protein  47.4 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0259428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0886  transcription antitermination protein NusG  45.7 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  hitchhiker  0.00000687026 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4342  hypothetical protein  46.03 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.121402 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1781  protein of unknown function DUF989  26.07 
 
 		 438 aa  45.4  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.201182 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3478  hypothetical protein  22.77 
 
 		 419 aa  43.5  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.300585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1579  hypothetical protein  20.72 
 
 		 442 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3853  hypothetical protein  20.72 
 
 		 442 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0186652  normal  0.587321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1805  hypothetical protein  22.52 
 
 		 430 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.916296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0835  protein of unknown function DUF989  24.68 
 
 		 398 aa  43.9  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.510797  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4289  hypothetical protein  20.72 
 
 		 446 aa  43.9  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3914  hypothetical protein  22.94 
 
 		 415 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.410571  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3670  hypothetical protein  22.07 
 
 		 421 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.753123  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4624  hypothetical protein  23.38 
 
 		 412 aa  42  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.449143 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21090  hypothetical protein  31.71 
 
 		 389 aa  42  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0855882  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2045  hypothetical protein  36.76 
 
 		 394 aa  41.2  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.654077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1702  hypothetical protein  22.07 
 
 		 437 aa  41.2  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.317159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1917  hypothetical protein  22.31 
 
 		 448 aa  40.8  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.159844  normal  0.631971 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1391  hypothetical protein  40.2 
 
 		 438 aa  40.4  0.01  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.196967  normal  0.0829452 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>