118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0538 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0538  hypothetical protein  100 
 
 
407 aa  806    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.428838  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05941  Zn-dependent proteases  83.29 
 
 
407 aa  676    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05641  Zn-dependent protease  84.52 
 
 
407 aa  694    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.394997  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06021  Zn-dependent protease  71.5 
 
 
407 aa  556  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1629  hypothetical protein  34.32 
 
 
431 aa  270  2.9999999999999997e-71  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0734  hypothetical protein  32.35 
 
 
416 aa  258  2e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.168601  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05401  Zn-dependent protease  34.92 
 
 
413 aa  244  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05931  Zn-dependent proteases  38.46 
 
 
405 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.111882  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1868  hypothetical protein  38.38 
 
 
396 aa  237  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.180278  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07871  Zn-dependent protease  31.94 
 
 
422 aa  230  4e-59  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1337  peptidase M50  26.32 
 
 
412 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2181  hypothetical protein  25.06 
 
 
403 aa  151  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.392153 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3191  peptidase M50  27.52 
 
 
375 aa  149  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00586872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1797  peptidase M50  24.88 
 
 
397 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1872  peptidase M50  25.14 
 
 
373 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0947  peptidase M50  26.22 
 
 
374 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0920  peptidase M50  25.95 
 
 
374 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5036  peptidase M50  23.02 
 
 
413 aa  140  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.206475 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1457  peptidase M50  24.21 
 
 
417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1483  peptidase M50  24.21 
 
 
417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.511598  normal  0.569675 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3381  peptidase M50  23.8 
 
 
396 aa  135  9e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  decreased coverage  0.000039902  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4785  peptidase M50  24.86 
 
 
373 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.384856  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3922  peptidase M50  25.27 
 
 
385 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_002936  DET0769  protease family protein  24.38 
 
 
380 aa  119  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000172815  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_675  protease  24.11 
 
 
380 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159772  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1410  peptidase M50  24.38 
 
 
373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.226741  normal  0.248277 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2488  peptidase M50  24.03 
 
 
383 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0222  peptidase M50  24.51 
 
 
394 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0700  peptidase M50  26.02 
 
 
370 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_680  metallopeptidase, M50 family  26.08 
 
 
371 aa  102  1e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0373838  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1747  peptidase M50  24.87 
 
 
370 aa  100  4e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.951218  normal  0.0691878 
 
 
-
 
NC_002936  DET0774  M50 family metallopeptidase  25.14 
 
 
370 aa  100  5e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1412  peptidase M50  21.49 
 
 
383 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.742384  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0695  peptidase M50  23.55 
 
 
379 aa  98.6  2e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836286  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0406  peptidase M50  23 
 
 
380 aa  95.5  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.445518 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0259  peptidase M50  23.64 
 
 
374 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12644  hypothetical protein  21.73 
 
 
393 aa  94  4e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1291  peptidase M50  26.85 
 
 
366 aa  92.4  1e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00117198  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0155  peptidase M50  21.12 
 
 
392 aa  91.7  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2627  peptidase M50  20.85 
 
 
405 aa  90.5  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11470  Zn-dependent protease  21.33 
 
 
388 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.844041 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  27.57 
 
 
364 aa  86.3  9e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1032  peptidase M50  21.05 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0615226 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1011  peptidase M50  20.64 
 
 
404 aa  82.8  0.000000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1368  peptidase M50  20.33 
 
 
395 aa  81.6  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00624726  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1843  peptidase M50  21.1 
 
 
376 aa  79  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.616528  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2355  peptidase M50  22.22 
 
 
396 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0704943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0613  peptidase M50  22.46 
 
 
361 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.190222  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0318  CBS domain-containing protein  23.53 
 
 
370 aa  76.3  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147887  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  25.47 
 
 
378 aa  75.1  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3672  peptidase M50  20.99 
 
 
375 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2415  peptidase M50  21.03 
 
 
424 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0170  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 
343 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.356486  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1449  peptidase M50  27.67 
 
 
337 aa  73.6  0.000000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0709676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5283  peptidase M50  19.93 
 
 
390 aa  73.6  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0459  peptidase M50  27.18 
 
 
342 aa  72  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0769405  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0613  peptidase M50  24.05 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0236174 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1185  peptidase M50  26.7 
 
 
338 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3134  peptidase M50  20 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  23.02 
 
 
384 aa  70.5  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1815  hypothetical protein  27.62 
 
 
383 aa  70.1  0.00000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.434017  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2637  peptidase M50  27.61 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.599853  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0289  peptidase M50  21.48 
 
 
393 aa  70.1  0.00000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1479  peptidase M50  27.31 
 
 
384 aa  69.7  0.00000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0658829  normal  0.564629 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1508  peptidase M50  19.48 
 
 
412 aa  68.9  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5902  Zn-dependent protease-like protein  25.82 
 
 
362 aa  69.3  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0267336  normal  0.154235 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2305  peptidase M50  23.65 
 
 
362 aa  68.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00177185  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3648  peptidase M50  19.73 
 
 
381 aa  67.8  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0203123 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2223  peptidase M50  19 
 
 
376 aa  67.8  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3750  peptidase M50  25.93 
 
 
372 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.69281  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2601  peptidase M50  19.16 
 
 
394 aa  67  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.603215  normal  0.812434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3400  peptidase M50  20 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4494  peptidase M50  21.29 
 
 
381 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  24.06 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22910  Zn-dependent protease  23.28 
 
 
244 aa  65.9  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.511612  normal  0.351338 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1434  CBS domain-containing protein  29.57 
 
 
336 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1483  peptidase M50  26.63 
 
 
365 aa  64.3  0.000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4923  peptidase M50  18.67 
 
 
373 aa  63.9  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.465017 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  30.09 
 
 
366 aa  62.4  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2633  peptidase M50  27.72 
 
 
405 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.962625  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0149  CBS domain containing protein  23.5 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0113637 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1914  peptidase M50  26.97 
 
 
387 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000446293 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3626  peptidase M50  20.43 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.721542 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2136  peptidase M50  20.27 
 
 
415 aa  58.2  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.821665  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4475  peptidase M50  23.53 
 
 
400 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.580173  normal  0.145803 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22130  Zn-dependent protease  26.12 
 
 
390 aa  57.4  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2535  peptidase M50  25.86 
 
 
373 aa  56.2  0.0000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.180251  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2006  peptidase M50  26.23 
 
 
376 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223407  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2620  hypothetical protein  30.08 
 
 
239 aa  54.3  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00161745  normal  0.443629 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0116  peptidase M50  30.77 
 
 
365 aa  54.7  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.345861 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1762  putative peptidase  29.82 
 
 
360 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.0051203  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3165  peptidase M50  22.6 
 
 
376 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0540  peptidase M50  19.12 
 
 
364 aa  53.9  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0613  peptidase M50  22.99 
 
 
380 aa  53.5  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.750705  normal  0.0786713 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0483  hypothetical protein  28.8 
 
 
360 aa  52.4  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119997  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1988  peptidase M50  30.16 
 
 
373 aa  52.4  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.319732 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2201  peptidase M50  23.86 
 
 
375 aa  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3646  peptidase M50  27.38 
 
 
485 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.415625  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1617  putative protease  25.56 
 
 
286 aa  50.4  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3580  peptidase M50  26.79 
 
 
489 aa  50.1  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>