More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_89195 on replicon NC_009044
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009044  PICST_89195  threonine and methionine pathway  100 
 
 
363 aa  741    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02450  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, putative  54.14 
 
 
365 aa  380  1e-104  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.0000615112  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  53.02 
 
 
363 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745703  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0187  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.66 
 
 
348 aa  311  1e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.380466  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0932  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.31 
 
 
360 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.22 
 
 
349 aa  305  5.0000000000000004e-82  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.444418  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0636  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.38 
 
 
348 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.0076377  normal  0.238607 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1282  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.38 
 
 
348 aa  305  6e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.53 
 
 
351 aa  294  1e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.28 
 
 
348 aa  292  6e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2490  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.25 
 
 
351 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1495  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.44 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0760  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.91 
 
 
342 aa  286  4e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000035457 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1455  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.37 
 
 
338 aa  281  2e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.324209  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0712  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.97 
 
 
338 aa  278  1e-73  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.158442  normal  0.414928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1999  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.35 
 
 
338 aa  270  2e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.165812 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1136  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.72 
 
 
342 aa  271  2e-71  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0148  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.98 
 
 
348 aa  270  2.9999999999999997e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  0.0847459 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1399  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.93 
 
 
338 aa  263  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0677126  normal  0.303323 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2563  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.21 
 
 
345 aa  263  4.999999999999999e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0216406 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.41 
 
 
362 aa  251  2e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000985612  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0768  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.84 
 
 
345 aa  249  7e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.40952  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1886  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.93 
 
 
344 aa  245  9.999999999999999e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2591  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.65 
 
 
361 aa  243  3e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.61 
 
 
351 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1841  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.31 
 
 
338 aa  238  1e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1745  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.89 
 
 
348 aa  238  2e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.405709 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0957  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.48 
 
 
339 aa  233  5e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.538451  normal  0.0143726 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0272  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.11 
 
 
338 aa  231  1e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0378  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
340 aa  228  1e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3078  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.15 
 
 
352 aa  228  2e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187789  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3188  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.94 
 
 
352 aa  227  3e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00406547  normal  0.076183 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.67 
 
 
364 aa  226  6e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1700  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.2 
 
 
348 aa  226  7e-58  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.109656  normal  0.328927 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4190  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.03 
 
 
362 aa  222  9e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1586  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.22 
 
 
358 aa  220  3e-56  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.22 
 
 
344 aa  216  7e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.05 
 
 
362 aa  211  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0411  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
362 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1861  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.77 
 
 
350 aa  209  5e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.667563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.19 
 
 
362 aa  207  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.13 
 
 
368 aa  202  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.98 
 
 
356 aa  197  3e-49  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0709  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.15 
 
 
357 aa  183  5.0000000000000004e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0008  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.28 
 
 
343 aa  182  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0642  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.91 
 
 
334 aa  155  8e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1077  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.66 
 
 
352 aa  120  4.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000750093  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2939  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.22 
 
 
347 aa  116  6e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0514925  hitchhiker  0.00000205933 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2392  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.03 
 
 
347 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2241  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.03 
 
 
347 aa  113  6e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.363521  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2465  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.53 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.844771  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2268  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.03 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.03 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132113  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2436  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.03 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2452  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.03 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2530  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.03 
 
 
347 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00134439  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2228  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.78 
 
 
347 aa  110  5e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0790084  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.28 
 
 
336 aa  105  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0776  aspartate semialdehyde dehydrogenase  30.77 
 
 
366 aa  105  2e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1940  aspartate semialdehyde dehydrogenase  30.05 
 
 
364 aa  103  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  29.95 
 
 
338 aa  103  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1782  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  28.42 
 
 
339 aa  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.34 
 
 
340 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.68 
 
 
338 aa  102  9e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.43 
 
 
338 aa  102  1e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.08 
 
 
329 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.487501  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.48 
 
 
325 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1748  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.22 
 
 
360 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115714  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0618  aspartate semialdehyde dehydrogenase  30.15 
 
 
352 aa  101  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.61 
 
 
341 aa  101  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.68 
 
 
341 aa  100  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.22 
 
 
325 aa  100  4e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.95 
 
 
335 aa  100  5e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.2 
 
 
351 aa  99.8  6e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1270  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.83 
 
 
338 aa  99.4  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000102592  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36370  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.75 
 
 
349 aa  99.4  9e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1051  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.8 
 
 
358 aa  98.6  1e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000545446  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1073  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.69 
 
 
337 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.4 
 
 
358 aa  99.4  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000172647  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2011  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.1 
 
 
353 aa  99  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.251769  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2287  aspartate semialdehyde dehydrogenase  28.97 
 
 
340 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.46 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.93 
 
 
340 aa  98.2  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.98 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.98 
 
 
339 aa  98.2  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1717  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.27 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.806069  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  30.4 
 
 
337 aa  98.2  2e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.92 
 
 
340 aa  97.4  3e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.15882  hitchhiker  0.00000411486 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0282  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  28.61 
 
 
338 aa  97.4  3e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0130  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.43 
 
 
355 aa  97.4  3e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.25 
 
 
358 aa  97.4  3e-19  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000518903  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0587  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.83 
 
 
345 aa  97.1  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.18 
 
 
341 aa  96.7  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.11 
 
 
341 aa  96.7  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.22 
 
 
359 aa  96.3  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2718  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.42 
 
 
341 aa  95.9  1e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.37 
 
 
347 aa  95.1  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3899  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.12 
 
 
348 aa  94.7  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01202  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.67 
 
 
338 aa  95.1  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0505  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.75 
 
 
356 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>