More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0712 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008942  Mlab_0712  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
338 aa  696    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.158442  normal  0.414928 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1455  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70.71 
 
 
338 aa  509  1e-143  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.324209  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1999  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.93 
 
 
338 aa  496  1e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.165812 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1399  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  71.01 
 
 
338 aa  487  1e-136  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0677126  normal  0.303323 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1495  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.09 
 
 
338 aa  472  1e-132  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0760  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.64 
 
 
342 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000035457 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1136  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.4 
 
 
342 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.14 
 
 
349 aa  337  9.999999999999999e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.444418  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1282  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.15 
 
 
348 aa  333  2e-90  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0932  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.87 
 
 
360 aa  330  2e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0187  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.15 
 
 
348 aa  328  1.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.380466  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0148  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.43 
 
 
348 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  0.0847459 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0636  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
348 aa  323  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.0076377  normal  0.238607 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
348 aa  317  2e-85  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1745  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.97 
 
 
348 aa  313  3.9999999999999997e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.405709 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0768  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.23 
 
 
345 aa  311  1e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.40952  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1886  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.2 
 
 
344 aa  311  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2563  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.25 
 
 
345 aa  310  2e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0216406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2490  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.97 
 
 
351 aa  306  3e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.8 
 
 
344 aa  293  2e-78  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.06 
 
 
351 aa  286  5e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0272  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.22 
 
 
338 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0957  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.51 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.538451  normal  0.0143726 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3078  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.52 
 
 
352 aa  283  3.0000000000000004e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187789  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1841  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.45 
 
 
338 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0378  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.51 
 
 
340 aa  280  2e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.95 
 
 
351 aa  280  2e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3188  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.36 
 
 
352 aa  279  5e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00406547  normal  0.076183 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89195  threonine and methionine pathway  44.97 
 
 
363 aa  278  1e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2591  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.13 
 
 
361 aa  272  8.000000000000001e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4190  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.79 
 
 
362 aa  271  9e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02450  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, putative  45.45 
 
 
365 aa  264  1e-69  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.0000615112  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.22 
 
 
362 aa  263  3e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000985612  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.07 
 
 
362 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.79 
 
 
362 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0411  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.79 
 
 
362 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  43.26 
 
 
363 aa  258  1e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745703  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1586  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
358 aa  250  3e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1861  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.13 
 
 
350 aa  248  2e-64  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.667563  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
364 aa  245  6e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1700  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.15 
 
 
348 aa  244  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.109656  normal  0.328927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.42 
 
 
356 aa  217  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0008  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.81 
 
 
343 aa  217  2e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0709  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.31 
 
 
357 aa  215  9.999999999999999e-55  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.82 
 
 
368 aa  214  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0642  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.92 
 
 
334 aa  170  3e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2530  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.05 
 
 
347 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00134439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.05 
 
 
347 aa  126  5e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132113  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2228  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.79 
 
 
347 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0790084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2452  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.79 
 
 
347 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1748  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.38 
 
 
360 aa  124  3e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2268  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.52 
 
 
347 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2436  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.52 
 
 
347 aa  123  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606943  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2392  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.79 
 
 
347 aa  122  7e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21221  aspartate semialdehyde dehydrogenase  30.83 
 
 
345 aa  122  9e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2939  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.79 
 
 
347 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0514925  hitchhiker  0.00000205933 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1252  aspartate semialdehyde dehydrogenase  30.56 
 
 
345 aa  121  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0587  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.9 
 
 
345 aa  120  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2465  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.72 
 
 
347 aa  118  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.844771  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18441  aspartate semialdehyde dehydrogenase  30.35 
 
 
343 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18441  aspartate semialdehyde dehydrogenase  28.8 
 
 
343 aa  117  3e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.39713  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18631  aspartate semialdehyde dehydrogenase  29.38 
 
 
343 aa  116  6e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0915019  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.56 
 
 
325 aa  115  8.999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2453  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.1 
 
 
348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000194693  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.73 
 
 
329 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.487501  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3567  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.04 
 
 
341 aa  115  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.11 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.39 
 
 
329 aa  113  5e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03103  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.98 
 
 
337 aa  112  7.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2241  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.16 
 
 
347 aa  112  9e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.363521  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  30.29 
 
 
337 aa  112  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3482  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.07 
 
 
348 aa  112  9e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2060  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.45 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.73 
 
 
338 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04100  aspartate semialdehyde dehydrogenase  32.05 
 
 
346 aa  110  3e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.917016 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3946  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.33 
 
 
341 aa  110  4.0000000000000004e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.973774  normal  0.182306 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002872  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.47 
 
 
337 aa  109  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797453  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17801  aspartate semialdehyde dehydrogenase  29.62 
 
 
343 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1477  aspartate semialdehyde dehydrogenase  32.08 
 
 
338 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000311076  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.22 
 
 
348 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0319  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.84 
 
 
343 aa  109  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.75 
 
 
349 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.75 
 
 
349 aa  109  9.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.75 
 
 
348 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.75 
 
 
348 aa  108  9.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.82392e-61 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1400  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.01 
 
 
348 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00002128  hitchhiker  5.26638e-21 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.75 
 
 
348 aa  108  1e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.75 
 
 
349 aa  108  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.21 
 
 
340 aa  108  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1746  aspartate semialdehyde dehydrogenase  29.81 
 
 
343 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3899  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.01 
 
 
348 aa  108  1e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.75 
 
 
348 aa  108  1e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1424  aspartate semialdehyde dehydrogenase  31.81 
 
 
338 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000300384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1489  aspartate semialdehyde dehydrogenase  31.81 
 
 
338 aa  108  1e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000183684  normal  0.923378 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3070  aspartate semialdehyde dehydrogenese  31.54 
 
 
338 aa  108  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1691  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.62 
 
 
338 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277188  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.64 
 
 
338 aa  107  2e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2744  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31 
 
 
338 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000610142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1615  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31 
 
 
338 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000415846  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31 
 
 
338 aa  107  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000159168  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>