More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1700 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1700  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
348 aa  702    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.109656  normal  0.328927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1861  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  68.59 
 
 
350 aa  477  1e-133  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.667563  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0008  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.39 
 
 
343 aa  386  1e-106  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0378  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.26 
 
 
340 aa  285  5.999999999999999e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0957  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.77 
 
 
339 aa  281  9e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.538451  normal  0.0143726 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1841  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.19 
 
 
338 aa  280  3e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1136  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.31 
 
 
342 aa  276  5e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0272  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.77 
 
 
338 aa  276  5e-73  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0760  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.02 
 
 
342 aa  275  9e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000035457 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0148  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.71 
 
 
348 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  0.0847459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1495  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
338 aa  269  5e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.47 
 
 
351 aa  268  1e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.41 
 
 
349 aa  264  2e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.444418  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1455  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.42 
 
 
338 aa  258  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.324209  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1999  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.57 
 
 
338 aa  257  2e-67  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.165812 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2563  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.9 
 
 
345 aa  255  8e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0216406 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1282  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.53 
 
 
348 aa  252  9.000000000000001e-66  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1399  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.87 
 
 
338 aa  251  9.000000000000001e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0677126  normal  0.303323 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0636  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.7 
 
 
348 aa  251  1e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.0076377  normal  0.238607 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0768  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.9 
 
 
345 aa  250  2e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.40952  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0187  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.24 
 
 
348 aa  250  3e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.380466  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2490  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.11 
 
 
351 aa  249  5e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
348 aa  248  8e-65  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1745  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.18 
 
 
348 aa  246  6e-64  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.405709 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0712  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.15 
 
 
338 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.158442  normal  0.414928 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.37 
 
 
351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.07 
 
 
356 aa  240  2e-62  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1886  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.42 
 
 
344 aa  238  9e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0932  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.14 
 
 
360 aa  236  4e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0709  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.96 
 
 
357 aa  234  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3188  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.61 
 
 
352 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00406547  normal  0.076183 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.38 
 
 
362 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000985612  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3078  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.57 
 
 
352 aa  228  1e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187789  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2591  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.21 
 
 
361 aa  226  3e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89195  threonine and methionine pathway  38.2 
 
 
363 aa  226  7e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  40.22 
 
 
363 aa  224  1e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745703  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1586  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.43 
 
 
358 aa  225  1e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.71 
 
 
344 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA02450  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, putative  36.39 
 
 
365 aa  214  1.9999999999999998e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.0000615112  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4190  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.62 
 
 
362 aa  213  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.9 
 
 
364 aa  211  2e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.9 
 
 
362 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0411  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.9 
 
 
362 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.62 
 
 
362 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0642  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.3 
 
 
334 aa  186  7e-46  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.96 
 
 
368 aa  185  9e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1077  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.59 
 
 
352 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000750093  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.21 
 
 
344 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.95 
 
 
344 aa  116  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1782  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  27.93 
 
 
339 aa  114  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.6 
 
 
337 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.43 
 
 
344 aa  114  3e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.03 
 
 
344 aa  114  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.72 
 
 
344 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.03 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.34 
 
 
344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.88 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.16 
 
 
344 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.99 
 
 
329 aa  110  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.487501  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.76 
 
 
344 aa  109  7.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.07 
 
 
344 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.8 
 
 
344 aa  107  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.19 
 
 
348 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.21 
 
 
359 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.42 
 
 
344 aa  106  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.56 
 
 
344 aa  106  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.42 
 
 
344 aa  106  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2060  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.25 
 
 
347 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.79 
 
 
344 aa  105  9e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0618  aspartate semialdehyde dehydrogenase  27.18 
 
 
352 aa  105  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  28.34 
 
 
337 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.91 
 
 
351 aa  102  8e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1320  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.01 
 
 
329 aa  102  1e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.29 
 
 
329 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1092  aspartate semialdehyde dehydrogenase  29.78 
 
 
327 aa  102  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.948427  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.37 
 
 
344 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01202  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.94 
 
 
338 aa  101  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1940  aspartate semialdehyde dehydrogenase  28.02 
 
 
364 aa  101  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.93 
 
 
340 aa  101  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.2 
 
 
345 aa  100  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.97 
 
 
340 aa  100  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.15882  hitchhiker  0.00000411486 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2775  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.21 
 
 
340 aa  100  4e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.21 
 
 
341 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3482  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.42 
 
 
348 aa  99.8  7e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0042  aspartate semialdehyde dehydrogenase  27.44 
 
 
352 aa  99.4  7e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2876  aspartate semialdehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
341 aa  99.8  7e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.81 
 
 
344 aa  99.4  9e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.79 
 
 
344 aa  99.4  9e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  27.86 
 
 
338 aa  99.4  9e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1748  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.42 
 
 
360 aa  98.6  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115714  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2173  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.89 
 
 
338 aa  98.6  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00782862  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.38 
 
 
341 aa  99  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.65 
 
 
341 aa  98.6  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0776  aspartate semialdehyde dehydrogenase  27.57 
 
 
366 aa  99  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.81 
 
 
335 aa  97.8  2e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2718  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.21 
 
 
341 aa  98.2  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.34 
 
 
336 aa  98.2  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0587  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.68 
 
 
345 aa  97.8  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0537  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.61 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3570  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.58 
 
 
348 aa  98.2  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>