More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0709 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_0709  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
357 aa  732    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  78.43 
 
 
356 aa  595  1e-169  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0957  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.8 
 
 
339 aa  280  2e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.538451  normal  0.0143726 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0378  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.7 
 
 
340 aa  277  2e-73  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1841  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.69 
 
 
338 aa  271  9e-72  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0272  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.23 
 
 
338 aa  269  7e-71  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0148  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.94 
 
 
348 aa  261  1e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  0.0847459 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.85 
 
 
351 aa  257  2e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0932  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.96 
 
 
360 aa  253  3e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2490  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.43 
 
 
351 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1136  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.74 
 
 
342 aa  242  7.999999999999999e-63  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0760  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.35 
 
 
342 aa  238  8e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000035457 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0187  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.94 
 
 
348 aa  236  3e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.380466  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1282  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.83 
 
 
348 aa  235  8e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.81 
 
 
349 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.444418  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1700  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.96 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.109656  normal  0.328927 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0636  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.55 
 
 
348 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.0076377  normal  0.238607 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1455  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.53 
 
 
338 aa  229  5e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.324209  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3188  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.11 
 
 
352 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00406547  normal  0.076183 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1745  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.1 
 
 
348 aa  228  2e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.405709 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1399  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.98 
 
 
338 aa  226  4e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0677126  normal  0.303323 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3078  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.11 
 
 
352 aa  225  8e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187789  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2563  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.26 
 
 
345 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0216406 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1495  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.76 
 
 
338 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.99 
 
 
351 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.53 
 
 
348 aa  220  3e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1861  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.29 
 
 
350 aa  218  1e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.667563  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0712  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.31 
 
 
338 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.158442  normal  0.414928 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1999  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.61 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.165812 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2591  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.46 
 
 
361 aa  212  7e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1886  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.26 
 
 
344 aa  210  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0768  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.78 
 
 
345 aa  206  4e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.40952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.99 
 
 
362 aa  203  5e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000985612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4190  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.26 
 
 
362 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.43 
 
 
368 aa  201  9.999999999999999e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02450  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, putative  34.89 
 
 
365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.0000615112  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.06 
 
 
364 aa  199  6e-50  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1586  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.98 
 
 
358 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.59 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0411  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.31 
 
 
362 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.59 
 
 
362 aa  196  7e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0008  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.36 
 
 
343 aa  194  2e-48  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89195  threonine and methionine pathway  33.15 
 
 
363 aa  183  5.0000000000000004e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  34.36 
 
 
363 aa  179  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745703  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.52 
 
 
344 aa  176  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0642  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.26 
 
 
334 aa  134  3e-30  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.3 
 
 
325 aa  102  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2701  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.24 
 
 
343 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2060  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.84 
 
 
347 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  24.34 
 
 
333 aa  98.2  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.29 
 
 
325 aa  97.8  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2392  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.38 
 
 
347 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2241  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.64 
 
 
347 aa  95.9  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.363521  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.15 
 
 
335 aa  95.9  9e-19  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  24.33 
 
 
329 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1691  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.06 
 
 
338 aa  94.7  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277188  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2228  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.78 
 
 
347 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0790084  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.38 
 
 
348 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1484  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  26.75 
 
 
338 aa  92.8  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0171916  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.52 
 
 
347 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.132113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2939  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.06 
 
 
347 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0514925  hitchhiker  0.00000205933 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2465  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.52 
 
 
347 aa  92  2e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.844771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2530  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.52 
 
 
347 aa  91.3  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00134439  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5364  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.67 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190609  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2452  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.26 
 
 
347 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2268  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25 
 
 
347 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2436  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25 
 
 
347 aa  90.5  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606943  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0139  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.68 
 
 
330 aa  90.1  6e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0283298 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.32 
 
 
340 aa  89.7  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0350  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.28 
 
 
334 aa  89.4  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1949  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.81 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1424  aspartate semialdehyde dehydrogenase  25.92 
 
 
338 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000300384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1489  aspartate semialdehyde dehydrogenase  25.92 
 
 
338 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000183684  normal  0.923378 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.77 
 
 
340 aa  88.2  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25 
 
 
347 aa  88.6  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1748  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  23.4 
 
 
360 aa  88.2  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115714  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3654  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.39 
 
 
330 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00566269  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1477  aspartate semialdehyde dehydrogenase  25.71 
 
 
338 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000311076  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1320  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  23.66 
 
 
329 aa  87  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.65 
 
 
338 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000159168  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1615  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.65 
 
 
338 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000415846  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2744  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.65 
 
 
338 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000610142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2761  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.65 
 
 
338 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339959  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3070  aspartate semialdehyde dehydrogenese  25.19 
 
 
338 aa  87  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2443  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.45 
 
 
338 aa  86.7  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000737036  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.65 
 
 
341 aa  86.3  7e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002872  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.96 
 
 
337 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0797453  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3732  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25 
 
 
336 aa  85.9  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357313  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1808  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.8 
 
 
340 aa  85.9  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.996773  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0636  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.74 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00726008  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.46 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17801  aspartate semialdehyde dehydrogenase  25.93 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  25.65 
 
 
340 aa  85.5  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.46 
 
 
344 aa  85.9  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2453  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.57 
 
 
348 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000194693  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0537  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.39 
 
 
329 aa  84  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  26.85 
 
 
332 aa  84  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.7 
 
 
338 aa  84  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000971394  normal  0.367426 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.07 
 
 
332 aa  84  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.705444  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1042  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.27 
 
 
343 aa  84  0.000000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>