More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2542 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_2542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
368 aa  750    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1586  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.88 
 
 
358 aa  373  1e-102  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2490  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.48 
 
 
351 aa  290  3e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1136  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.44 
 
 
342 aa  281  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0932  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.82 
 
 
360 aa  267  2.9999999999999995e-70  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0148  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  44.79 
 
 
348 aa  266  4e-70  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  0.0847459 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0760  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.18 
 
 
342 aa  258  8e-68  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000035457 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0957  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.53 
 
 
339 aa  253  5.000000000000001e-66  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.538451  normal  0.0143726 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.23 
 
 
349 aa  246  4e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.444418  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0378  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.13 
 
 
340 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.27 
 
 
351 aa  243  3e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.78 
 
 
351 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1841  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.19 
 
 
338 aa  242  6e-63  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0272  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.08 
 
 
338 aa  242  7.999999999999999e-63  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2563  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.39 
 
 
345 aa  242  9e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0216406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0187  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.46 
 
 
348 aa  241  1e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.380466  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0636  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.06 
 
 
348 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.0076377  normal  0.238607 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2591  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.04 
 
 
361 aa  239  4e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1282  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.5 
 
 
348 aa  235  8e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4190  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40 
 
 
362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1886  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
344 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0768  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.83 
 
 
345 aa  228  1e-58  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.40952  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3188  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.11 
 
 
352 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00406547  normal  0.076183 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.62 
 
 
362 aa  228  2e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1999  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.82 
 
 
338 aa  227  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.165812 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.89 
 
 
362 aa  226  4e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0411  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.62 
 
 
362 aa  226  6e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1455  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
338 aa  226  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.324209  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.4 
 
 
348 aa  225  1e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.59 
 
 
362 aa  225  1e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000985612  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1745  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.12 
 
 
348 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.405709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3078  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.83 
 
 
352 aa  223  4e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187789  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0712  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.66 
 
 
338 aa  218  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.158442  normal  0.414928 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.05 
 
 
356 aa  212  1e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  39.13 
 
 
363 aa  210  3e-53  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745703  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.87 
 
 
344 aa  210  4e-53  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0709  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.43 
 
 
357 aa  207  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1399  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39 
 
 
338 aa  207  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0677126  normal  0.303323 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.12 
 
 
364 aa  206  4e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89195  threonine and methionine pathway  37.13 
 
 
363 aa  206  4e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1495  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.36 
 
 
338 aa  206  7e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02450  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, putative  34.59 
 
 
365 aa  199  9e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.0000615112  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1861  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.37 
 
 
350 aa  193  3e-48  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.667563  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1700  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.96 
 
 
348 aa  193  5e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.109656  normal  0.328927 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0008  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.87 
 
 
343 aa  166  6.9999999999999995e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0642  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.82 
 
 
334 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.39 
 
 
342 aa  147  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.98 
 
 
341 aa  145  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1782  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  32.23 
 
 
339 aa  135  9e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.23 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.85 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.61 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3185  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.19 
 
 
344 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00609082 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.9 
 
 
344 aa  135  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1717  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.73 
 
 
347 aa  134  3e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.806069  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.66 
 
 
340 aa  133  5e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.36 
 
 
344 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.11 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.1 
 
 
344 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2876  aspartate semialdehyde dehydrogenase  30.33 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.1 
 
 
344 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1101  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.36 
 
 
343 aa  131  2.0000000000000002e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.77 
 
 
340 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0831  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.85 
 
 
344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.8 
 
 
344 aa  130  4.0000000000000003e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.77 
 
 
340 aa  129  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0724  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.55 
 
 
344 aa  129  9.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.675858  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.1 
 
 
338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.41 
 
 
340 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.12 
 
 
344 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3514  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.59 
 
 
357 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000101086 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.43 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  30.33 
 
 
338 aa  127  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.35 
 
 
336 aa  127  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.92 
 
 
325 aa  127  3e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.61 
 
 
344 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.1 
 
 
359 aa  126  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1340  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.12 
 
 
341 aa  126  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.665671 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0139  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.06 
 
 
330 aa  126  7e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0283298 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.28 
 
 
348 aa  125  9e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3805  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.8 
 
 
339 aa  125  1e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.54038  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0122  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.23 
 
 
345 aa  125  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.222343 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2110  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.41 
 
 
342 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.49 
 
 
347 aa  125  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.53 
 
 
337 aa  125  1e-27  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.49 
 
 
333 aa  124  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.94 
 
 
335 aa  124  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.18 
 
 
344 aa  124  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  30.79 
 
 
340 aa  124  2e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01202  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.33 
 
 
338 aa  124  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.11 
 
 
325 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2060  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.35 
 
 
347 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1691  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30 
 
 
338 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277188  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.85 
 
 
344 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2929  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.67 
 
 
344 aa  123  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.9 
 
 
338 aa  123  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1863  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.91 
 
 
329 aa  123  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.67 
 
 
344 aa  123  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  0.305752 
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.67 
 
 
338 aa  123  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  29.9 
 
 
340 aa  123  5e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>