More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0008 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0008  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
343 aa  695    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1700  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.39 
 
 
348 aa  386  1e-106  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.109656  normal  0.328927 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1861  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.97 
 
 
350 aa  384  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.667563  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0148  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.79 
 
 
348 aa  244  9.999999999999999e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  0.0847459 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0957  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.67 
 
 
339 aa  241  1e-62  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.538451  normal  0.0143726 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0272  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  42.53 
 
 
338 aa  238  1e-61  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1136  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.93 
 
 
342 aa  236  3e-61  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0378  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.86 
 
 
340 aa  236  3e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0760  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.55 
 
 
342 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000035457 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1841  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  41.88 
 
 
338 aa  232  5e-60  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.6 
 
 
351 aa  232  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2490  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
351 aa  229  4e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1999  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.2 
 
 
338 aa  226  6e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.165812 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.9 
 
 
349 aa  224  2e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.444418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1495  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.29 
 
 
338 aa  222  9e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0636  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39 
 
 
348 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.0076377  normal  0.238607 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1455  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.5 
 
 
338 aa  219  5e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.324209  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.34 
 
 
351 aa  218  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0932  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.71 
 
 
360 aa  218  1e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0712  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.81 
 
 
338 aa  217  2e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.158442  normal  0.414928 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2563  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.95 
 
 
345 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0216406 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0187  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.72 
 
 
348 aa  216  4e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.380466  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1282  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.71 
 
 
348 aa  216  5e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.01 
 
 
348 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1399  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.69 
 
 
338 aa  211  2e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0677126  normal  0.303323 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1745  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.52 
 
 
348 aa  205  1e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.405709 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0768  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.01 
 
 
345 aa  203  4e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.40952  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1886  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.66 
 
 
344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.69 
 
 
362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000985612  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3188  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  40.52 
 
 
352 aa  194  2e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00406547  normal  0.076183 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0709  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.36 
 
 
357 aa  194  2e-48  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.54 
 
 
364 aa  191  2e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4190  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.85 
 
 
362 aa  186  5e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3078  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.26 
 
 
352 aa  186  7e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187789  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02450  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, putative  37.32 
 
 
365 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.0000615112  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.24 
 
 
344 aa  183  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.88 
 
 
356 aa  181  1e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89195  threonine and methionine pathway  35.28 
 
 
363 aa  182  1e-44  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1586  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.23 
 
 
358 aa  178  1e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0642  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.21 
 
 
334 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.25 
 
 
362 aa  172  9e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0411  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38 
 
 
362 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  38.07 
 
 
362 aa  169  8e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2591  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.4 
 
 
361 aa  169  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  36.47 
 
 
363 aa  168  1e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745703  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.87 
 
 
368 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1077  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.3 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000750093  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30 
 
 
329 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.487501  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.23 
 
 
341 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  30.83 
 
 
337 aa  107  4e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  0.000000305241 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1949  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.19 
 
 
339 aa  106  8e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.8 
 
 
348 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000189528  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.65 
 
 
335 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3290  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.11 
 
 
344 aa  104  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.378777  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1092  aspartate semialdehyde dehydrogenase  28.93 
 
 
327 aa  104  2e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.948427  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2559  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.04 
 
 
341 aa  105  2e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.894195  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4232  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.01 
 
 
344 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0846709 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.36 
 
 
344 aa  103  4e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.73 
 
 
344 aa  103  5e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.117901 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.32 
 
 
333 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.41 
 
 
344 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.03 
 
 
344 aa  102  9e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  28.46 
 
 
332 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30 
 
 
337 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2718  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.37 
 
 
341 aa  101  2e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2060  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.37 
 
 
347 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0282  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  28.25 
 
 
338 aa  100  4e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0070  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.41 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.627309  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1873  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27 
 
 
320 aa  99.8  6e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24064  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2453  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.68 
 
 
348 aa  99.8  6e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000194693  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0670  aspartate semialdehyde dehydrogenase  27.2 
 
 
337 aa  99.8  7e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30 
 
 
344 aa  99.4  8e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1748  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.09 
 
 
360 aa  99  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115714  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2131  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.76 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.69 
 
 
341 aa  97.8  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1320  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.82 
 
 
329 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3570  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.66 
 
 
348 aa  97.8  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2287  aspartate semialdehyde dehydrogenase  27.76 
 
 
340 aa  97.8  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1782  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  30.08 
 
 
339 aa  97.4  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1717  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.58 
 
 
347 aa  97.8  3e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.806069  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.39 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.39 
 
 
349 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2876  aspartate semialdehyde dehydrogenase  28.21 
 
 
341 aa  97.1  4e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.39 
 
 
348 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.39 
 
 
349 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.39 
 
 
348 aa  96.7  5e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1776  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.94 
 
 
334 aa  97.1  5e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1270  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.29 
 
 
338 aa  96.7  5e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000102592  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1731  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.32 
 
 
358 aa  96.7  5e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000172647  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.39 
 
 
348 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.39 
 
 
348 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.82392e-61 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.32 
 
 
344 aa  96.3  6e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.75 
 
 
338 aa  96.7  6e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.1 
 
 
340 aa  96.3  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.69 
 
 
344 aa  95.9  9e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.57 
 
 
344 aa  95.9  1e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.69 
 
 
344 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.69 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.77 
 
 
359 aa  95.1  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.67 
 
 
339 aa  95.1  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>