More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0642 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0642  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
334 aa  687    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1136  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.96 
 
 
342 aa  204  1e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2490  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  37.9 
 
 
351 aa  204  2e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0932  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  39.47 
 
 
360 aa  202  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0187  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.6 
 
 
348 aa  198  9e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.380466  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0760  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.72 
 
 
342 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000035457 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1455  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.47 
 
 
338 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.324209  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1282  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.39 
 
 
348 aa  195  7e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.819086  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0636  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  36.07 
 
 
348 aa  194  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  decreased coverage  0.0076377  normal  0.238607 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.16 
 
 
349 aa  191  1e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.444418  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0148  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.55 
 
 
348 aa  191  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.911945  normal  0.0847459 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1495  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.42 
 
 
338 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.57 
 
 
348 aa  187  2e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1700  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.3 
 
 
348 aa  186  6e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.109656  normal  0.328927 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1886  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.65 
 
 
344 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0768  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.07 
 
 
345 aa  183  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.40952  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1861  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.75 
 
 
350 aa  182  6e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.667563  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1999  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.04 
 
 
338 aa  181  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.165812 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2563  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.8 
 
 
345 aa  179  4.999999999999999e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0216406 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.24 
 
 
351 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1745  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  34.57 
 
 
348 aa  179  5.999999999999999e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.405709 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0008  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.21 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4196  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.82 
 
 
351 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0158843  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1841  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.15 
 
 
338 aa  170  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0712  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.92 
 
 
338 aa  170  3e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.158442  normal  0.414928 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0957  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.24 
 
 
339 aa  169  9e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.538451  normal  0.0143726 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0378  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.05 
 
 
340 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.82 
 
 
344 aa  164  2.0000000000000002e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0272  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  33.82 
 
 
338 aa  163  3e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1399  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  32.74 
 
 
338 aa  160  2e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0677126  normal  0.303323 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3188  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.57 
 
 
352 aa  159  5e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00406547  normal  0.076183 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02450  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, putative  32.67 
 
 
365 aa  156  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.0000615112  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3078  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  35.28 
 
 
352 aa  156  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187789  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89195  threonine and methionine pathway  31.91 
 
 
363 aa  155  8e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase (Eurofung)  33.43 
 
 
363 aa  144  1e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.745703  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1586  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.45 
 
 
358 aa  144  2e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2908  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.29 
 
 
356 aa  144  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0426  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.07 
 
 
362 aa  144  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000985612  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2591  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.53 
 
 
361 aa  143  4e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.82 
 
 
368 aa  139  6e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.452166  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0709  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.26 
 
 
357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.954197 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1283  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.81 
 
 
364 aa  130  3e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4190  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.92 
 
 
362 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.16 
 
 
362 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0411  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.59 
 
 
362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.59 
 
 
362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.726603  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.71 
 
 
333 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1949  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.27 
 
 
339 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2701  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.22 
 
 
343 aa  101  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1448  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.48 
 
 
345 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0424  hypothetical protein  27.32 
 
 
332 aa  99.8  6e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0537  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.12 
 
 
329 aa  99.4  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.45 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.487501  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02400  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.54 
 
 
339 aa  97.8  2e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.156261  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.13 
 
 
325 aa  98.2  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.82 
 
 
329 aa  97.1  3e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0997  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.33 
 
 
328 aa  97.4  3e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0277  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  27.35 
 
 
340 aa  97.1  4e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.125695 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  27.51 
 
 
348 aa  95.9  8e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.83 
 
 
325 aa  95.9  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1252  aspartate semialdehyde dehydrogenase  29.11 
 
 
345 aa  95.1  1e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1320  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.14 
 
 
329 aa  95.5  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3654  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.22 
 
 
330 aa  95.1  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00566269  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3732  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.27 
 
 
336 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357313  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6574  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.6 
 
 
353 aa  94.4  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.55 
 
 
351 aa  94.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0282  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  26.29 
 
 
338 aa  94.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1073  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.45 
 
 
337 aa  94  3e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1782  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  29.89 
 
 
339 aa  94  3e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2287  aspartate semialdehyde dehydrogenase  27.06 
 
 
340 aa  94  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21221  aspartate semialdehyde dehydrogenase  28.08 
 
 
345 aa  94  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  31.52 
 
 
354 aa  93.2  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.301002 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04100  aspartate semialdehyde dehydrogenase  29.79 
 
 
346 aa  93.2  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.917016 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1455  aspartate semialdehyde dehydrogenase  28.14 
 
 
329 aa  92.8  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.993289  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1484  aspartate semialdehyde dehydrogenase  28.14 
 
 
329 aa  92.8  8e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2559  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.98 
 
 
341 aa  92.4  1e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.894195  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.01 
 
 
336 aa  92  1e-17  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0139  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.45 
 
 
330 aa  92  1e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0283298 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0587  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.39 
 
 
345 aa  92  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1717  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.16 
 
 
347 aa  92  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.806069  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2664  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.14 
 
 
341 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1691  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.29 
 
 
338 aa  92.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000277188  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0954  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  25.63 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  29.74 
 
 
332 aa  90.9  2e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.67 
 
 
341 aa  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0319  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.73 
 
 
343 aa  91.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.8 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.8 
 
 
339 aa  91.3  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4359  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  30.63 
 
 
344 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.657095  normal  0.503804 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2452  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.28 
 
 
347 aa  90.5  3e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2268  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.62 
 
 
347 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2228  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.28 
 
 
347 aa  90.5  3e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0790084  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5364  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.65 
 
 
337 aa  90.9  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190609  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.71 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2436  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.62 
 
 
347 aa  90.5  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.606943  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0636  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.4 
 
 
344 aa  90.1  5e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00726008  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2718  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  29.14 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.845789  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  27.78 
 
 
347 aa  89.7  7e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2465  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  28.62 
 
 
347 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.844771  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2131  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  26.98 
 
 
342 aa  89  1e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>