More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5364 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_5364  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  687    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190609  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3732  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  85.76 
 
 
336 aa  585  1e-166  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.357313  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0139  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  75.15 
 
 
330 aa  518  1e-146  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0283298 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0537  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  76.85 
 
 
329 aa  508  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3654  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  74.24 
 
 
330 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00566269  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1320  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70 
 
 
329 aa  481  1e-135  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02400  Aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.06 
 
 
339 aa  454  1.0000000000000001e-126  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.156261  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1863  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  65.15 
 
 
329 aa  447  1.0000000000000001e-124  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0424  hypothetical protein  60.54 
 
 
332 aa  442  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1949  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.98 
 
 
339 aa  401  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.57 
 
 
333 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.54 
 
 
329 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0282  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  60.86 
 
 
338 aa  391  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2131  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.45 
 
 
342 aa  381  1e-105  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0277  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  58.46 
 
 
340 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.125695 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2559  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.61 
 
 
341 aa  382  1e-105  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.894195  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.04 
 
 
340 aa  382  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.7 
 
 
341 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  59.76 
 
 
349 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0306509  normal  0.940701 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  60.3 
 
 
339 aa  376  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000116797  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.36 
 
 
332 aa  377  1e-103  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.02 
 
 
332 aa  373  1e-102  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.705444  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  57.4 
 
 
332 aa  373  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2287  aspartate semialdehyde dehydrogenase  57.62 
 
 
340 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.62 
 
 
325 aa  368  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  57.54 
 
 
325 aa  369  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.89 
 
 
349 aa  370  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  56.76 
 
 
349 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  55.26 
 
 
348 aa  356  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.79 
 
 
339 aa  355  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.79 
 
 
339 aa  355  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.15 
 
 
340 aa  355  5.999999999999999e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.76 
 
 
348 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.49 
 
 
340 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0997  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.27 
 
 
328 aa  352  4e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.66 
 
 
335 aa  352  7e-96  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1066  aspartate semialdehyde dehydrogenase  55.99 
 
 
335 aa  349  5e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.058115  hitchhiker  0.00506315 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  55.56 
 
 
339 aa  344  1e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.95 
 
 
339 aa  341  1e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0350  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.27 
 
 
334 aa  340  2e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.05 
 
 
339 aa  339  4e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000070881  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.05 
 
 
338 aa  339  4e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.31 
 
 
337 aa  338  7e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.44 
 
 
351 aa  336  2.9999999999999997e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.78 
 
 
340 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.15 
 
 
338 aa  335  7e-91  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  52.96 
 
 
338 aa  333  3e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1231  aspartate semialdehyde dehydrogenase  53.47 
 
 
340 aa  333  3e-90  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  54.44 
 
 
339 aa  331  9e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000271293  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.27 
 
 
340 aa  330  2e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  53.43 
 
 
339 aa  330  2e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3899  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 
348 aa  329  3e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1400  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 
348 aa  329  3e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00002128  hitchhiker  5.26638e-21 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 
349 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.98 
 
 
340 aa  329  5.0000000000000004e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 
348 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 
348 aa  329  5.0000000000000004e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.82392e-61 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 
348 aa  328  6e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 
349 aa  328  6e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 
349 aa  328  6e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.72 
 
 
348 aa  328  6e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000145815  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0344  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.46 
 
 
344 aa  328  8e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.034026 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5289  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.63 
 
 
347 aa  328  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3182  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.85 
 
 
344 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2793  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.29 
 
 
344 aa  326  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.430867  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3570  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.14 
 
 
348 aa  323  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1248  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.8 
 
 
340 aa  323  2e-87  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.207297  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0338  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.42 
 
 
344 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3593  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.29 
 
 
344 aa  323  3e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1458  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.3 
 
 
344 aa  323  3e-87  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2443  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.35 
 
 
338 aa  322  8e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000737036  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2453  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.14 
 
 
348 aa  321  9.999999999999999e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000194693  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1016  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  51.19 
 
 
340 aa  321  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.71 
 
 
336 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0229  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
344 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.21 
 
 
340 aa  320  3e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2744  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000610142  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2761  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000339959  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000159168  hitchhiker  0.00278212 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3363  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81581  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1615  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000415846  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0319  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.36 
 
 
343 aa  319  5e-86  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2824  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.73 
 
 
344 aa  317  1e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.163926  normal  0.649951 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1186  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.73 
 
 
344 aa  318  1e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3070  aspartate semialdehyde dehydrogenese  50.15 
 
 
338 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2702  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 
344 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.347697  normal  0.305752 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0493  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.12 
 
 
344 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.60024  normal  0.710301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2929  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.88 
 
 
344 aa  317  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.047306 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2214  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.58 
 
 
344 aa  317  2e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.244055  normal  0.319963 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0887  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.85 
 
 
344 aa  316  3e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0640  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.06 
 
 
344 aa  316  4e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0237  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.42 
 
 
344 aa  316  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00833547 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1424  aspartate semialdehyde dehydrogenase  50.15 
 
 
338 aa  316  4e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000300384  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1489  aspartate semialdehyde dehydrogenase  50.15 
 
 
338 aa  316  4e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000183684  normal  0.923378 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
341 aa  315  5e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0670  aspartate semialdehyde dehydrogenase  51.05 
 
 
337 aa  316  5e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3384  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.69 
 
 
344 aa  315  7e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1477  aspartate semialdehyde dehydrogenase  49.85 
 
 
338 aa  315  7e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000311076  normal  0.537594 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.71 
 
 
347 aa  314  9.999999999999999e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.79 
 
 
341 aa  314  9.999999999999999e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.308974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>