44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_69529 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  91.42 
 
 		 375 aa  725    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  79.73 
 
 		 377 aa  657    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  79.47 
 
 		 377 aa  656    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  89.54 
 
 		 377 aa  714    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  79.47 
 
 		 377 aa  656    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  80.27 
 
 		 377 aa  656    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  100 
 
 		 376 aa  783    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  55.8 
 
 		 380 aa  442  1e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  54.89 
 
 		 377 aa  432  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  49.38 
 
 		 411 aa  404  1e-111  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  45.81 
 
 		 392 aa  358  6e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  44.77 
 
 		 390 aa  356  5e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  45.45 
 
 		 391 aa  353  2e-96  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  44.77 
 
 		 388 aa  348  9e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  42.93 
 
 		 407 aa  335  7.999999999999999e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  38.69 
 
 		 377 aa  296  4e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  35.14 
 
 		 425 aa  248  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  34.11 
 
 		 438 aa  245  9.999999999999999e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  36.34 
 
 		 419 aa  245  9.999999999999999e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  35.37 
 
 		 416 aa  242  7.999999999999999e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  34.51 
 
 		 434 aa  230  3e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  31.46 
 
 		 476 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  28.36 
 
 		 472 aa  175  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  25.76 
 
 		 479 aa  155  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  26.9 
 
 		 490 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42575  predicted protein  25.82 
 
 		 503 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131448 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3281  predicted protein  27.47 
 
 		 354 aa  126  5e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  24.2 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  24.83 
 
 		 429 aa  120  3e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56314  actin-related protein  27.41 
 
 		 402 aa  120  4.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0289584  normal  0.219633 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02487  chromatin remodeling complex subunit (Arp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03020)  26.4 
 
 		 770 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85755  vacuolar targeting, actin-related protein  25.84 
 
 		 775 aa  98.6  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116456  normal  0.301272 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41017  predicted protein  23.14 
 
 		 358 aa  97.4  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000637788  normal  0.733987 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  23.32 
 
 		 494 aa  95.9  1e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  26.75 
 
 		 523 aa  90.9  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  21.7 
 
 		 724 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01210  hypothetical protein  23.47 
 
 		 613 aa  73.9  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09359  chromatin remodeling complex subunit (Arp9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02330)  31.33 
 
 		 667 aa  61.2  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42377  normal  0.0103389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3137  actin/actin family protein  23.82 
 
 		 386 aa  49.7  0.00009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340047  normal  0.74971 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02210  nucleus protein, putative  21.89 
 
 		 779 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0446179  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0873  actin/actin family protein  20.43 
 
 		 436 aa  43.9  0.005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2620  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  19.92 
 
 		 348 aa  43.5  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05911  nuclear actin-related protein (Eurofung)  17.48 
 
 		 619 aa  43.5  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64180  Actin-like protein (Actin-related protein 2)  22.04 
 
 		 411 aa  42.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>