30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45153 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  100 
 
 		 523 aa  1085    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  25.54 
 
 		 494 aa  126  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  28.35 
 
 		 425 aa  116  7.999999999999999e-25  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  29.32 
 
 		 476 aa  96.3  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  26.75 
 
 		 376 aa  94.7  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  26.2 
 
 		 377 aa  94.4  5e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  25.88 
 
 		 375 aa  87.8  4e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  24.84 
 
 		 377 aa  86.7  9e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  26.43 
 
 		 377 aa  84.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  26.81 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  26.81 
 
 		 377 aa  84.3  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  28.44 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  30.24 
 
 		 472 aa  84  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  29.27 
 
 		 380 aa  80.5  0.00000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  31.67 
 
 		 391 aa  75.1  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  30.88 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  29.41 
 
 		 429 aa  70.5  0.00000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  36.44 
 
 		 463 aa  66.2  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  26.63 
 
 		 390 aa  63.5  0.00000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  26.52 
 
 		 419 aa  59.7  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  32.99 
 
 		 416 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  26.75 
 
 		 434 aa  58.5  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  32.38 
 
 		 724 aa  56.6  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  25.24 
 
 		 377 aa  53.5  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01210  hypothetical protein  32.53 
 
 		 613 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  27.27 
 
 		 388 aa  50.4  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  24.5 
 
 		 407 aa  49.7  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  25.91 
 
 		 438 aa  50.1  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41017  predicted protein  24.29 
 
 		 358 aa  48.9  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000637788  normal  0.733987 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09359  chromatin remodeling complex subunit (Arp9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02330)  34.83 
 
 		 667 aa  46.6  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42377  normal  0.0103389 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>