23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE01210 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006687  CNE01210  hypothetical protein  100 
 
 		 613 aa  1231    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  23.98 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03185  Arp11 homolog (dynactin complex) (Eurofung)  22.94 
 
 		 554 aa  70.9  0.00000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  22.96 
 
 		 375 aa  70.5  0.00000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  26.32 
 
 		 391 aa  68.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  25.65 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  23.24 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  23.24 
 
 		 377 aa  66.2  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  23.24 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  25.81 
 
 		 479 aa  64.7  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  21.73 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  23.51 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  25 
 
 		 392 aa  58.9  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  22.58 
 
 		 472 aa  58.5  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  26.26 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  23.49 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  23.92 
 
 		 377 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  22.44 
 
 		 416 aa  54.3  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  32.56 
 
 		 523 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  31.33 
 
 		 724 aa  51.2  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  21.33 
 
 		 380 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  28.43 
 
 		 411 aa  48.5  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  27.13 
 
 		 377 aa  47.4  0.0008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>