42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_36825 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  100 
 
 		 392 aa  808    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  78.57 
 
 		 388 aa  649    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  72.09 
 
 		 390 aa  593  1e-168  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  56.74 
 
 		 407 aa  444  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  46.21 
 
 		 375 aa  367  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  45.17 
 
 		 377 aa  360  2e-98  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  45.81 
 
 		 376 aa  358  6e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  44.91 
 
 		 377 aa  357  2.9999999999999997e-97  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  44.13 
 
 		 377 aa  351  1e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  43.86 
 
 		 377 aa  350  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  43.86 
 
 		 377 aa  350  2e-95  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  42.2 
 
 		 380 aa  316  6e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  40.46 
 
 		 377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  40.25 
 
 		 411 aa  297  2e-79  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  37.34 
 
 		 391 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  33.25 
 
 		 419 aa  207  3e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  33.79 
 
 		 434 aa  203  3e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  31.7 
 
 		 416 aa  199  9e-50  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  31.22 
 
 		 438 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  30.41 
 
 		 377 aa  191  2.9999999999999997e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  30.79 
 
 		 425 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  25.89 
 
 		 472 aa  119  9e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  23.41 
 
 		 479 aa  101  2e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  24.87 
 
 		 490 aa  99  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  23.2 
 
 		 476 aa  99  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85755  vacuolar targeting, actin-related protein  28.36 
 
 		 775 aa  94.7  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116456  normal  0.301272 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42575  predicted protein  23.64 
 
 		 503 aa  88.2  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131448 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56314  actin-related protein  25.86 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0289584  normal  0.219633 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3281  predicted protein  23.33 
 
 		 354 aa  82  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  22.54 
 
 		 429 aa  77  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41017  predicted protein  25.86 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000637788  normal  0.733987 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  26.88 
 
 		 494 aa  70.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  22.83 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02487  chromatin remodeling complex subunit (Arp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03020)  24.9 
 
 		 770 aa  68.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110638  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02210  nucleus protein, putative  25.37 
 
 		 779 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0446179  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80286  actin-related protein  26.2 
 
 		 835 aa  53.1  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0163475 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64180  Actin-like protein (Actin-related protein 2)  26.91 
 
 		 411 aa  52.8  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  22.54 
 
 		 724 aa  52.4  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09359  chromatin remodeling complex subunit (Arp9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02330)  29.55 
 
 		 667 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42377  normal  0.0103389 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01210  hypothetical protein  25 
 
 		 613 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05911  nuclear actin-related protein (Eurofung)  24.53 
 
 		 619 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  25 
 
 		 523 aa  43.5  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>