42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_31192 on replicon NC_009358
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  100 
 
 		 425 aa  880    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  35.93 
 
 		 375 aa  252  9.000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  35.14 
 
 		 376 aa  248  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  35.31 
 
 		 377 aa  247  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  34.75 
 
 		 377 aa  246  4.9999999999999997e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  34.19 
 
 		 377 aa  246  8e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  34.19 
 
 		 377 aa  246  8e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  34.28 
 
 		 377 aa  245  9.999999999999999e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  30.66 
 
 		 472 aa  241  1e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  31.8 
 
 		 476 aa  237  3e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  32.14 
 
 		 463 aa  200  5e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  30.81 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  27.42 
 
 		 494 aa  194  3e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  29.51 
 
 		 377 aa  178  2e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  30.79 
 
 		 392 aa  178  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  28.27 
 
 		 380 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  25.51 
 
 		 411 aa  172  1e-41  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  28.9 
 
 		 407 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  28.57 
 
 		 388 aa  168  2e-40  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  29.01 
 
 		 390 aa  166  8e-40  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  28.96 
 
 		 416 aa  155  2e-36  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  27.13 
 
 		 419 aa  148  1.0000000000000001e-34  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  24.7 
 
 		 377 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  24.95 
 
 		 438 aa  129  9.000000000000001e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  24.78 
 
 		 434 aa  126  8.000000000000001e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  28.35 
 
 		 523 aa  116  8.999999999999998e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  23.28 
 
 		 429 aa  105  2e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56314  actin-related protein  23.11 
 
 		 402 aa  84.3  0.000000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0289584  normal  0.219633 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  21.82 
 
 		 479 aa  80.9  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  23.28 
 
 		 490 aa  71.6  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  25.24 
 
 		 724 aa  61.6  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42575  predicted protein  22.32 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131448 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05911  nuclear actin-related protein (Eurofung)  18.98 
 
 		 619 aa  53.5  0.000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85755  vacuolar targeting, actin-related protein  21.95 
 
 		 775 aa  51.2  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116456  normal  0.301272 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1207  rod shape-determining protein MreB  24.12 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000344928  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1248  rod shape-determining protein MreB  24.12 
 
 		 336 aa  47.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0105666  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03185  Arp11 homolog (dynactin complex) (Eurofung)  23.91 
 
 		 554 aa  46.6  0.0009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4032  rod shape-determining protein MreB  23.19 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467853 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09359  chromatin remodeling complex subunit (Arp9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02330)  28.12 
 
 		 667 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42377  normal  0.0103389 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41017  predicted protein  18.91 
 
 		 358 aa  45.1  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000637788  normal  0.733987 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  22.34 
 
 		 346 aa  43.5  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2339  rod shape-determining protein MreB  23.08 
 
 		 339 aa  43.1  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000198225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>