42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_06542 on replicon BN001301
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  80.75 
 
 		 377 aa  665    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  91.42 
 
 		 376 aa  725    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  80.21 
 
 		 377 aa  662    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  100 
 
 		 375 aa  780    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  80.21 
 
 		 377 aa  662    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  90.67 
 
 		 377 aa  731    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  80.75 
 
 		 377 aa  665    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  56.6 
 
 		 380 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  54.89 
 
 		 377 aa  437  1e-121  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  49.88 
 
 		 411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  47.86 
 
 		 391 aa  368  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  46.21 
 
 		 392 aa  367  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  46.11 
 
 		 390 aa  362  7.0000000000000005e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  45.31 
 
 		 388 aa  352  4e-96  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  43.98 
 
 		 407 aa  344  2e-93  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  38.86 
 
 		 377 aa  299  4e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  35.93 
 
 		 425 aa  252  8.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  36.67 
 
 		 419 aa  248  1e-64  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  33.95 
 
 		 438 aa  247  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  35.78 
 
 		 416 aa  247  2e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  35.58 
 
 		 434 aa  241  2e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  31.8 
 
 		 476 aa  194  3e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  25.11 
 
 		 479 aa  149  9e-35  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  26.43 
 
 		 490 aa  140  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  23.91 
 
 		 494 aa  139  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  25.71 
 
 		 463 aa  131  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42575  predicted protein  25.34 
 
 		 503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131448 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56314  actin-related protein  27.23 
 
 		 402 aa  122  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0289584  normal  0.219633 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3281  predicted protein  27.75 
 
 		 354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  24.38 
 
 		 429 aa  117  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  40.26 
 
 		 472 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02487  chromatin remodeling complex subunit (Arp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03020)  28 
 
 		 770 aa  106  8e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85755  vacuolar targeting, actin-related protein  26.28 
 
 		 775 aa  102  1e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116456  normal  0.301272 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41017  predicted protein  23.9 
 
 		 358 aa  100  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000637788  normal  0.733987 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  29.21 
 
 		 523 aa  87  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  22.32 
 
 		 724 aa  79.3  0.00000000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01210  hypothetical protein  22.19 
 
 		 613 aa  68.2  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09359  chromatin remodeling complex subunit (Arp9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02330)  31.33 
 
 		 667 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42377  normal  0.0103389 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02210  nucleus protein, putative  22.22 
 
 		 779 aa  50.4  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0446179  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2620  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  21.26 
 
 		 348 aa  49.3  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3137  actin/actin family protein  22.71 
 
 		 386 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340047  normal  0.74971 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27704  predicted protein  79.17 
 
 		 346 aa  42.7  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.277976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>