30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNK01830 on replicon NC_006680
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  100 
 
 		 724 aa  1494    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02487  chromatin remodeling complex subunit (Arp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03020)  41.6 
 
 		 770 aa  519  1e-146  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85755  vacuolar targeting, actin-related protein  35.1 
 
 		 775 aa  445  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116456  normal  0.301272 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  22.32 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  22.55 
 
 		 377 aa  75.9  0.000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  22.41 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  21.7 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  23.53 
 
 		 380 aa  74.7  0.000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  20.99 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  20.99 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  24.45 
 
 		 391 aa  67.8  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  20.89 
 
 		 377 aa  67.4  0.0000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  19.91 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  23.01 
 
 		 390 aa  63.2  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  23.12 
 
 		 411 aa  62.4  0.00000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  25.24 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  24.12 
 
 		 407 aa  60.8  0.00000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  25.3 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  29.25 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  23.81 
 
 		 388 aa  59.3  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  25 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  32.38 
 
 		 523 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  22.71 
 
 		 472 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  28.12 
 
 		 377 aa  54.7  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  22.54 
 
 		 392 aa  51.6  0.00004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01210  hypothetical protein  31.33 
 
 		 613 aa  51.6  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  23.28 
 
 		 494 aa  50.8  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56314  actin-related protein  27.82 
 
 		 402 aa  49.3  0.0002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0289584  normal  0.219633 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  29.36 
 
 		 476 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  22.22 
 
 		 490 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>