42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA04650 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  80.37 
 
 		 377 aa  665    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  90.67 
 
 		 375 aa  731    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  84.35 
 
 		 377 aa  683    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  80.64 
 
 		 377 aa  667    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  100 
 
 		 377 aa  787    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  80.37 
 
 		 377 aa  665    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  89.54 
 
 		 376 aa  714    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  57.14 
 
 		 380 aa  458  9.999999999999999e-129  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  56.52 
 
 		 377 aa  445  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  50.87 
 
 		 411 aa  414  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  47.33 
 
 		 391 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  45.17 
 
 		 392 aa  360  2e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  44.77 
 
 		 390 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  44.5 
 
 		 388 aa  348  6e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  42.93 
 
 		 407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  37.77 
 
 		 377 aa  296  5e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  36.86 
 
 		 419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  35.87 
 
 		 416 aa  252  8.000000000000001e-66  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  34.65 
 
 		 438 aa  252  1e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  34.75 
 
 		 425 aa  246  4.9999999999999997e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  35.03 
 
 		 434 aa  240  2.9999999999999997e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  31.59 
 
 		 476 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  28.45 
 
 		 472 aa  178  2e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  25.11 
 
 		 479 aa  140  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  26.9 
 
 		 490 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  24.83 
 
 		 429 aa  125  1e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42575  predicted protein  25.62 
 
 		 503 aa  124  2e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131448 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  23.31 
 
 		 463 aa  125  2e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3281  predicted protein  27.47 
 
 		 354 aa  116  5e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56314  actin-related protein  27.11 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0289584  normal  0.219633 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41017  predicted protein  24.35 
 
 		 358 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000637788  normal  0.733987 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02487  chromatin remodeling complex subunit (Arp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03020)  25.4 
 
 		 770 aa  99.4  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85755  vacuolar targeting, actin-related protein  26.24 
 
 		 775 aa  98.2  2e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116456  normal  0.301272 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  22.04 
 
 		 494 aa  88.2  2e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  28.22 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  22.55 
 
 		 724 aa  77.4  0.0000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09359  chromatin remodeling complex subunit (Arp9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02330)  26.56 
 
 		 667 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42377  normal  0.0103389 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01210  hypothetical protein  25.94 
 
 		 613 aa  53.9  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3137  actin/actin family protein  23.04 
 
 		 386 aa  48.9  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340047  normal  0.74971 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02210  nucleus protein, putative  21.89 
 
 		 779 aa  48.1  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0446179  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27704  predicted protein  74.07 
 
 		 346 aa  44.3  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.277976  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2620  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  20.59 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>