37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_00140 on replicon BN001308
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  100 
 
 
434 aa  888    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  70.09 
 
 
419 aa  618  1e-176  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  65.77 
 
 
438 aa  567  1e-160  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  56.39 
 
 
416 aa  471  1e-132  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  35.58 
 
 
375 aa  256  5e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  35.03 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  35.5 
 
 
377 aa  253  4.0000000000000004e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  36.19 
 
 
377 aa  253  5.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  36.19 
 
 
377 aa  253  5.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  34.35 
 
 
377 aa  245  9.999999999999999e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  34.51 
 
 
376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  36.38 
 
 
380 aa  238  2e-61  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  35.4 
 
 
388 aa  235  1.0000000000000001e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  34.57 
 
 
411 aa  222  9.999999999999999e-57  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  32.78 
 
 
390 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  33.79 
 
 
392 aa  221  3e-56  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  33.18 
 
 
377 aa  210  3e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  32.71 
 
 
407 aa  202  8e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  30.48 
 
 
391 aa  182  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  25.49 
 
 
425 aa  134  3e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  25.97 
 
 
377 aa  130  5.0000000000000004e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  21.37 
 
 
476 aa  88.6  2e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42575  predicted protein  22.79 
 
 
503 aa  87  6e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.131448 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  22.55 
 
 
472 aa  86.3  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  23.11 
 
 
490 aa  82  0.00000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  23.73 
 
 
479 aa  78.2  0.0000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56314  actin-related protein  25.93 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0289584  normal  0.219633 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  27.51 
 
 
523 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  21.27 
 
 
463 aa  67.8  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3281  predicted protein  25.49 
 
 
354 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  24.89 
 
 
429 aa  63.5  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0530  actin/actin family protein  27.98 
 
 
428 aa  61.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0873  actin/actin family protein  28.71 
 
 
436 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85755  vacuolar targeting, actin-related protein  29.88 
 
 
775 aa  58.2  0.0000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116456  normal  0.301272 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02487  chromatin remodeling complex subunit (Arp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03020)  24.31 
 
 
770 aa  56.6  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110638  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  20.74 
 
 
494 aa  55.5  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  22.22 
 
 
724 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>