15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_0873 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_0873  actin/actin family protein  100 
 
 		 436 aa  887    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0887  actin/actin family protein  57.87 
 
 		 429 aa  527  1e-148  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34391  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1441  actin/actin family protein  56.25 
 
 		 429 aa  519  1e-146  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1814  actin/actin family protein  55.81 
 
 		 432 aa  512  1e-144  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.347081 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1635  actin/actin family protein  55.12 
 
 		 432 aa  506  9.999999999999999e-143  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0530  actin/actin family protein  48.83 
 
 		 428 aa  375  1e-103  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  29.02 
 
 		 434 aa  58.9  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  25.6 
 
 		 438 aa  53.1  0.000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  22.92 
 
 		 419 aa  53.1  0.000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2259  actin-like ATPase  21.15 
 
 		 346 aa  50.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000332471  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  20 
 
 		 377 aa  45.8  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  20 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  20 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  19.95 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  20.43 
 
 		 376 aa  43.9  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>