19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0530 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0530  actin/actin family protein  100 
 
 		 428 aa  867    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0873  actin/actin family protein  48.83 
 
 		 436 aa  395  1e-109  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1441  actin/actin family protein  48.58 
 
 		 429 aa  378  1e-104  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1814  actin/actin family protein  47.28 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.347081 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1635  actin/actin family protein  47.55 
 
 		 432 aa  369  1e-101  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0887  actin/actin family protein  47.64 
 
 		 429 aa  368  1e-100  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.34391  normal  0.266544 
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  27.31 
 
 		 438 aa  68.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  27.98 
 
 		 434 aa  66.6  0.0000000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  26.32 
 
 		 377 aa  55.1  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  25.39 
 
 		 419 aa  53.9  0.000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  24.59 
 
 		 411 aa  52.4  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  24.8 
 
 		 375 aa  47.8  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  22.22 
 
 		 377 aa  47.4  0.0005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  23.85 
 
 		 380 aa  47  0.0006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  23.23 
 
 		 407 aa  47  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  23.3 
 
 		 416 aa  46.6  0.0009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  22.93 
 
 		 376 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  24.56 
 
 		 388 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1455  putative CheA signal transduction histidine kinases  23.96 
 
 		 927 aa  43.5  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>