40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_29609 on replicon NC_009374
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  100 
 
 		 407 aa  845    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  57.96 
 
 		 390 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  56.74 
 
 		 392 aa  444  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  54.57 
 
 		 388 aa  432  1e-120  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  43.98 
 
 		 375 aa  344  2e-93  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  42.93 
 
 		 377 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  42.93 
 
 		 376 aa  335  9e-91  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  43.19 
 
 		 377 aa  334  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  42.46 
 
 		 377 aa  335  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  43.19 
 
 		 377 aa  334  1e-90  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  42.45 
 
 		 377 aa  335  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  40.53 
 
 		 380 aa  296  5e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  38.95 
 
 		 377 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  36.34 
 
 		 411 aa  280  2e-74  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  33.86 
 
 		 391 aa  229  9e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  35.4 
 
 		 416 aa  206  6e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  33.66 
 
 		 419 aa  198  2.0000000000000003e-49  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  31.05 
 
 		 438 aa  194  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  32.71 
 
 		 434 aa  188  2e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  31.95 
 
 		 377 aa  179  4.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  28.9 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  25.57 
 
 		 490 aa  110  5e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42575  predicted protein  26.52 
 
 		 503 aa  109  8.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131448 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  24.02 
 
 		 476 aa  107  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  21.94 
 
 		 479 aa  99  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  21.67 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  22.37 
 
 		 429 aa  80.9  0.00000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56314  actin-related protein  24.1 
 
 		 402 aa  80.1  0.00000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0289584  normal  0.219633 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02487  chromatin remodeling complex subunit (Arp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03020)  25.4 
 
 		 770 aa  79.7  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85755  vacuolar targeting, actin-related protein  26.41 
 
 		 775 aa  75.9  0.000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116456  normal  0.301272 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3281  predicted protein  24.78 
 
 		 354 aa  72  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  21.51 
 
 		 463 aa  70.1  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  24.75 
 
 		 494 aa  68.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41017  predicted protein  23.96 
 
 		 358 aa  66.6  0.0000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000637788  normal  0.733987 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64180  Actin-like protein (Actin-related protein 2)  26.69 
 
 		 411 aa  63.5  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01210  hypothetical protein  21.73 
 
 		 613 aa  62  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  24.22 
 
 		 724 aa  61.6  0.00000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  24.5 
 
 		 523 aa  50.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_80286  actin-related protein  24.35 
 
 		 835 aa  44.3  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0163475 
 
 
-
 
NC_006684  CNB02210  nucleus protein, putative  22.99 
 
 		 779 aa  43.1  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0446179  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>