37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND05140 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  100 
 
 		 438 aa  901    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  67.13 
 
 		 419 aa  565  1e-160  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  66.29 
 
 		 434 aa  566  1e-160  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  56.45 
 
 		 416 aa  488  1e-137  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  35.8 
 
 		 377 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  35.8 
 
 		 377 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  35.8 
 
 		 377 aa  271  2e-71  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  34.57 
 
 		 377 aa  267  2.9999999999999995e-70  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  34.65 
 
 		 377 aa  266  4e-70  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  33.95 
 
 		 375 aa  262  8e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  34.11 
 
 		 376 aa  258  2e-67  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  37.24 
 
 		 380 aa  256  7e-67  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  34.86 
 
 		 411 aa  236  5.0000000000000005e-61  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  34.35 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  32.25 
 
 		 390 aa  216  5.9999999999999996e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  31.42 
 
 		 392 aa  216  5.9999999999999996e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  32.08 
 
 		 388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  31.51 
 
 		 407 aa  208  2e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  30.91 
 
 		 391 aa  184  3e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  26.24 
 
 		 425 aa  142  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  22.54 
 
 		 377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  21.91 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  22.46 
 
 		 472 aa  93.6  6e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  23.55 
 
 		 490 aa  90.9  4e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56314  actin-related protein  23.35 
 
 		 402 aa  82.8  0.00000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0289584  normal  0.219633 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42575  predicted protein  21.34 
 
 		 503 aa  82  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131448 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  21.79 
 
 		 479 aa  81.3  0.00000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  22.38 
 
 		 463 aa  74.3  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85755  vacuolar targeting, actin-related protein  24.52 
 
 		 775 aa  67.4  0.0000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116456  normal  0.301272 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  19.92 
 
 		 494 aa  65.5  0.000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  25.91 
 
 		 523 aa  62.4  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0530  actin/actin family protein  25.8 
 
 		 428 aa  62.8  0.00000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  22.35 
 
 		 429 aa  60.8  0.00000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3281  predicted protein  22.04 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02487  chromatin remodeling complex subunit (Arp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03020)  21.35 
 
 		 770 aa  54.3  0.000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0873  actin/actin family protein  25.56 
 
 		 436 aa  54.3  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41017  predicted protein  23.08 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000637788  normal  0.733987 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>