42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_51545 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  80.75 
 
 		 375 aa  665    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  80.27 
 
 		 376 aa  656    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  100 
 
 		 377 aa  788    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  79.31 
 
 		 377 aa  652    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  79.31 
 
 		 377 aa  652    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  84.35 
 
 		 377 aa  683    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  79.31 
 
 		 377 aa  652    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  55.8 
 
 		 380 aa  451  1.0000000000000001e-126  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  53.26 
 
 		 377 aa  431  1e-120  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  50.62 
 
 		 411 aa  414  1e-114  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  45.99 
 
 		 391 aa  361  1e-98  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  44.77 
 
 		 390 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  44.91 
 
 		 392 aa  357  2.9999999999999997e-97  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  44.24 
 
 		 388 aa  351  1e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  42.45 
 
 		 407 aa  335  1e-90  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  36.76 
 
 		 377 aa  291  1e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  34.57 
 
 		 438 aa  252  8.000000000000001e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  35.31 
 
 		 425 aa  247  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  37.06 
 
 		 416 aa  247  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  35.12 
 
 		 419 aa  239  8e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  34.35 
 
 		 434 aa  230  2e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  30.96 
 
 		 476 aa  195  1e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  29.12 
 
 		 472 aa  181  1e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  25.11 
 
 		 479 aa  144  3e-33  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  25.82 
 
 		 463 aa  138  2e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42575  predicted protein  26.4 
 
 		 503 aa  135  9.999999999999999e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131448 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  26.19 
 
 		 490 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56314  actin-related protein  26.18 
 
 		 402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0289584  normal  0.219633 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  24.21 
 
 		 429 aa  113  6e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_3281  predicted protein  24.38 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41017  predicted protein  24.68 
 
 		 358 aa  105  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000637788  normal  0.733987 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02487  chromatin remodeling complex subunit (Arp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03020)  26.51 
 
 		 770 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  29.35 
 
 		 523 aa  90.5  4e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85755  vacuolar targeting, actin-related protein  24.68 
 
 		 775 aa  87  5e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116456  normal  0.301272 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  23.4 
 
 		 494 aa  86.3  9e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  22.41 
 
 		 724 aa  75.9  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27704  predicted protein  96.3 
 
 		 346 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.277976  normal  1 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01210  hypothetical protein  26.92 
 
 		 613 aa  55.5  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09359  chromatin remodeling complex subunit (Arp9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02330)  26.04 
 
 		 667 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42377  normal  0.0103389 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3137  actin/actin family protein  23.42 
 
 		 386 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.340047  normal  0.74971 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0873  actin/actin family protein  19.95 
 
 		 436 aa  43.9  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2620  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  18.9 
 
 		 348 aa  43.9  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>