34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB05320 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  100 
 
 		 476 aa  990    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  32.57 
 
 		 472 aa  251  2e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  31.23 
 
 		 494 aa  239  5.999999999999999e-62  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  31.8 
 
 		 425 aa  237  3e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  31.52 
 
 		 376 aa  202  9e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  31.87 
 
 		 377 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  31.03 
 
 		 377 aa  195  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  30.04 
 
 		 377 aa  195  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  30.04 
 
 		 377 aa  195  2e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  31.87 
 
 		 375 aa  195  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  30.17 
 
 		 377 aa  194  4e-48  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  27.54 
 
 		 380 aa  163  5.0000000000000005e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  28.63 
 
 		 391 aa  159  1e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  26.43 
 
 		 411 aa  158  2e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  28.43 
 
 		 463 aa  151  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  26.98 
 
 		 377 aa  144  4e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  24.22 
 
 		 407 aa  107  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  25.55 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  29.72 
 
 		 523 aa  105  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  26.1 
 
 		 377 aa  100  4e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  23.01 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  22.02 
 
 		 419 aa  99.8  9e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  23.63 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  23.48 
 
 		 390 aa  97.1  6e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  21.54 
 
 		 438 aa  91.3  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  22.94 
 
 		 388 aa  89.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  20.99 
 
 		 434 aa  80.5  0.00000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  28.28 
 
 		 479 aa  50.8  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56314  actin-related protein  27.7 
 
 		 402 aa  49.7  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0289584  normal  0.219633 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  29.36 
 
 		 724 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42575  predicted protein  25.37 
 
 		 503 aa  45.8  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.131448 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09359  chromatin remodeling complex subunit (Arp9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02330)  24.11 
 
 		 667 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42377  normal  0.0103389 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  24.53 
 
 		 490 aa  44.3  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64180  Actin-like protein (Actin-related protein 2)  20.9 
 
 		 411 aa  43.1  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>