31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_48682 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  100 
 
 		 429 aa  886    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  24.83 
 
 		 377 aa  125  1e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  24.83 
 
 		 376 aa  120  3.9999999999999996e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  24.38 
 
 		 375 aa  117  5e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  24.21 
 
 		 377 aa  113  7.000000000000001e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  24.42 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  24.42 
 
 		 377 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  24.19 
 
 		 377 aa  110  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  23.77 
 
 		 494 aa  106  7e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  23.28 
 
 		 425 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  25.88 
 
 		 380 aa  103  5e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  25.67 
 
 		 377 aa  102  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  23.63 
 
 		 476 aa  99  1e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  21.71 
 
 		 472 aa  97.4  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  23.09 
 
 		 411 aa  91.3  3e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  31.58 
 
 		 391 aa  88.2  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  21.65 
 
 		 390 aa  87  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  22.9 
 
 		 388 aa  83.6  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  22.37 
 
 		 407 aa  80.9  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  22.54 
 
 		 392 aa  77  0.0000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  29.41 
 
 		 523 aa  70.5  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  27.44 
 
 		 416 aa  68.9  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  23.86 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  25.3 
 
 		 724 aa  61.2  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  20.74 
 
 		 419 aa  59.3  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  24.89 
 
 		 434 aa  58.2  0.0000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  22.35 
 
 		 438 aa  55.1  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  27.08 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09359  chromatin remodeling complex subunit (Arp9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02330)  24.63 
 
 		 667 aa  47.4  0.0005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42377  normal  0.0103389 
 
 
-
 
NC_006694  CNI00980  RNA polymerase II transcription factor, putative  24.46 
 
 		 513 aa  46.2  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.214338  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  20.4 
 
 		 463 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>