50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_65353 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_65353  actin-related protein  100 
 
 		 494 aa  1034    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05320  53 kda brg1-associated factor b (actin-related protein baf53b), putative  31.03 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0277221  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07441  Actin-related protein 4 (Actin-like protein arp4)(Actin-like protein 4) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AW89]  30.19 
 
 		 472 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31192  predicted protein  27.42 
 
 		 425 aa  194  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0140439  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06542  Actin, gamma [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P20359]  23.91 
 
 		 375 aa  139  1e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.271372  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20837  actin related protein  26.92 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01953  Actin-related protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9Y772]  23.98 
 
 		 380 aa  120  4.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.108777  normal  0.0547316 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_36282  centractin- actin-related protein of the dynactin complex  22.86 
 
 		 411 aa  117  5e-25  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.574061 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45153  predicted protein  25.13 
 
 		 523 aa  112  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.978768  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48682  general RNA polymerase II transcription factor  23.77 
 
 		 429 aa  106  8e-22  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0296051  normal  0.933986 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_69529  Actin  23.32 
 
 		 376 aa  95.9  2e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.425094  normal  0.344688 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_44089  actin related protein  26.98 
 
 		 391 aa  90.5  7e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.549451  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA04650  actin  22.04 
 
 		 377 aa  88.2  3e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.479636  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_51545  predicted protein  23.4 
 
 		 377 aa  86.3  0.000000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29136  actin/actin like protein  36.7 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29812  predicted protein  36.7 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.550808  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_51157  actin/actin like protein  36.7 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.289764  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39896  predicted protein  21.56 
 
 		 416 aa  76.3  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.213761  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA01330  actin ii (centractin-like protein), putative  39.39 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03340  actin binding protein, putative  24.76 
 
 		 390 aa  72.4  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_36825  endocytosis and membrane growth and polarity  26.88 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.240853  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00673  arp2 homolog (Eurofung)  25.54 
 
 		 388 aa  69.7  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.913852  normal  0.363518 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29609  predicted protein  24.75 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00127301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_84432  actin-related protein  20.63 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00880  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  24.54 
 
 		 490 aa  65.1  0.000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05140  actin binding protein, putative  18.96 
 
 		 438 aa  57.4  0.0000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK01830  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  23.71 
 
 		 724 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0158802  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00140  putative arp3 homolog (Eurofung)  19.57 
 
 		 434 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09359  chromatin remodeling complex subunit (Arp9), putative (AFU_orthologue; AFUA_3G02330)  26.09 
 
 		 667 aa  51.2  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.42377  normal  0.0103389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1671  actin/actin family protein  32 
 
 		 377 aa  50.8  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.188498  normal  0.0238434 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  23.88 
 
 		 349 aa  47.4  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07009  Actin-like protein arp6 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AXH1]  29.59 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  22.5 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  22.5 
 
 		 349 aa  46.2  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  24.6 
 
 		 349 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000380554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0574  rod shape-determining protein MreB  24.6 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000161982  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4098  rod shape-determining protein MreB  24.6 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3472  rod shape-determining protein MreB  24.6 
 
 		 349 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000392935  normal  0.627264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0479  rod shape-determining protein MreB  24.6 
 
 		 349 aa  45.8  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000232389  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0467  rod shape-determining protein MreB  25.79 
 
 		 349 aa  45.1  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000395514  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0300  rod shape-determining protein MreB  25.13 
 
 		 345 aa  45.1  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85755  vacuolar targeting, actin-related protein  32.63 
 
 		 775 aa  44.7  0.004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.116456  normal  0.301272 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0518  rod shape-determining protein MreB  24.22 
 
 		 349 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000418886  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02487  chromatin remodeling complex subunit (Arp5), putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03020)  23.81 
 
 		 770 aa  44.3  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.110638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0522  rod shape-determining protein MreB  24.22 
 
 		 349 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000845532  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3822  rod shape-determining protein MreB  24.22 
 
 		 349 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0497  rod shape-determining protein MreB  24.22 
 
 		 349 aa  44.3  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000391443  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4032  rod shape-determining protein MreB  25 
 
 		 366 aa  44.3  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467853 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0403  rod shape-determining protein MreB  24.88 
 
 		 349 aa  43.9  0.006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3738  rod shape-determining protein MreB  24.6 
 
 		 349 aa  43.5  0.01  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000049309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>