More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3738 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0574  rod shape-determining protein MreB  98.57 
 
 		 349 aa  689    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000161982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0497  rod shape-determining protein MreB  97.99 
 
 		 349 aa  684    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000391443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  91.09 
 
 		 347 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4098  rod shape-determining protein MreB  98.85 
 
 		 349 aa  691    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3822  rod shape-determining protein MreB  97.99 
 
 		 349 aa  684    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  91.09 
 
 		 347 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0467  rod shape-determining protein MreB  97.99 
 
 		 349 aa  664    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000395514  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0403  rod shape-determining protein MreB  97.99 
 
 		 349 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126028  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  91.09 
 
 		 347 aa  639    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  90.8 
 
 		 347 aa  634    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0522  rod shape-determining protein MreB  97.99 
 
 		 349 aa  684    Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000845532  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3334  rod shape-determining protein MreB  98.28 
 
 		 348 aa  657    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000427845  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0518  rod shape-determining protein MreB  97.99 
 
 		 349 aa  684    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000418886  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  89.94 
 
 		 347 aa  634    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3472  rod shape-determining protein MreB  98.57 
 
 		 349 aa  690    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000392935  normal  0.627264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0479  rod shape-determining protein MreB  98.57 
 
 		 349 aa  690    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000232389  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3738  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 349 aa  701    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000049309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  91.09 
 
 		 347 aa  637    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  97.71 
 
 		 349 aa  682    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  97.71 
 
 		 349 aa  682    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  98.57 
 
 		 349 aa  690    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000380554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  96.85 
 
 		 349 aa  680    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  90.52 
 
 		 347 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  89.66 
 
 		 347 aa  628  1e-179  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  89.37 
 
 		 347 aa  630  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4561  rod shape-determining protein MreB  89.66 
 
 		 347 aa  617  1e-176  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  88.22 
 
 		 347 aa  620  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  88.22 
 
 		 347 aa  620  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  87.36 
 
 		 347 aa  615  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0483  rod shape-determining protein MreB  89.37 
 
 		 347 aa  605  9.999999999999999e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0049  rod shape-determining protein MreB  86.21 
 
 		 347 aa  606  9.999999999999999e-173  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.483131  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1122  rod shape-determining protein MreB  83.62 
 
 		 347 aa  591  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.201462 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  79.89 
 
 		 345 aa  572  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  79.89 
 
 		 345 aa  572  1.0000000000000001e-162  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0933  rod shape-determining protein MreB  80.17 
 
 		 345 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.283099  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0940  rod shape-determining protein MreB  80.17 
 
 		 345 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4472  rod shape-determining protein MreB  80.46 
 
 		 345 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4163  rod shape-determining protein MreB  80.46 
 
 		 345 aa  565  1e-160  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0973  rod shape-determining protein MreB  80.17 
 
 		 345 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118066  normal  0.719218 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0838  rod shape-determining protein MreB  80.46 
 
 		 345 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00330287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0856  rod shape-determining protein MreB  80.75 
 
 		 345 aa  567  1e-160  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4282  rod shape-determining protein MreB  80.17 
 
 		 345 aa  565  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  79.31 
 
 		 345 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  79.31 
 
 		 345 aa  560  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  77.87 
 
 		 347 aa  560  1e-158  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  78.45 
 
 		 347 aa  558  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12650  rod shape-determining protein MreB  78.74 
 
 		 345 aa  556  1e-157  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  76.72 
 
 		 348 aa  552  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0100  rod shape-determining protein MreB  77.39 
 
 		 347 aa  550  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0514  rod shape-determining protein MreB  79.89 
 
 		 348 aa  548  1e-155  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0330  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  76.15 
 
 		 348 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.111648  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2728  rod shape-determining protein MreB  77.87 
 
 		 347 aa  548  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000000992624  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1648  rod shape-determining protein MreB  77.36 
 
 		 352 aa  546  1e-154  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  2.03031e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  75.57 
 
 		 348 aa  545  1e-154  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0515  rod shape-determining protein MreB  77.36 
 
 		 352 aa  546  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1127  rod shape-determining protein MreB  76.86 
 
 		 351 aa  544  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000227657  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0587  rod shape-determining protein MreB  76.59 
 
 		 347 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00216045  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2240  rod shape-determining protein MreB  77.01 
 
 		 345 aa  543  1e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  76.59 
 
 		 347 aa  543  1e-153  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1937  rod shape-determining protein MreB  74.5 
 
 		 347 aa  534  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000814712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1248  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  74.43 
 
 		 345 aa  531  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0506008  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3192  rod shape-determining protein MreB  79.94 
 
 		 343 aa  532  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.000000000000467509  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1630  rod shape-determining protein MreB  73.41 
 
 		 348 aa  514  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0107268  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0236  rod shape-determining protein MreB  71.18 
 
 		 347 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0260  rod shape-determining protein MreB  75.74 
 
 		 347 aa  511  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.516664  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  74.17 
 
 		 347 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  74.17 
 
 		 348 aa  509  1e-143  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0059  rod shape-determining protein MreB  73.28 
 
 		 347 aa  501  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.259581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3367  rod shape-determining protein MreB  73.28 
 
 		 347 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3690  rod shape-determining protein MreB  73.28 
 
 		 347 aa  501  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0076  rod shape-determining protein MreB  72.99 
 
 		 347 aa  500  1e-140  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.780876  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3923  rod shape-determining protein MreB  73.78 
 
 		 347 aa  498  1e-140  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0051  rod shape-determining protein MreB  72.99 
 
 		 347 aa  500  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0766615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0170  rod shape-determining protein MreB  72.13 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.695664  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0181  rod shape-determining protein MreB  72.13 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306812  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0162  rod shape-determining protein MreB  72.13 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0525916  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3107  rod shape-determining protein MreB  72.13 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.249961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0052  rod shape-determining protein MreB  72.13 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.618949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2374  rod shape-determining protein MreB  72.13 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0146  rod shape-determining protein MreB  72.13 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.949868  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3126  rod shape-determining protein MreB  72.13 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2496  rod shape-determining protein MreB  72.13 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.485441  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3048  rod shape-determining protein MreB  72.13 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2785  rod shape-determining protein MreB  71.84 
 
 		 347 aa  494  1e-139  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3165  rod shape-determining protein MreB  72.13 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3110  rod shape-determining protein MreB  72.13 
 
 		 347 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.309947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>