More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4032 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_4032  rod shape-determining protein MreB  100 
 
 		 366 aa  733    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.467853 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0595  rod shape-determining protein MreB  87.91 
 
 		 345 aa  614  1e-175  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3645  rod shape-determining protein MreB  85.09 
 
 		 353 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2329  rod shape-determining protein MreB  85.8 
 
 		 345 aa  587  1e-167  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.103474  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1600  rod shape-determining protein MreB  87.06 
 
 		 345 aa  590  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1003  rod shape-determining protein MreB  85.8 
 
 		 345 aa  587  1e-167  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.382692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0473  rod shape-determining protein MreB  85.67 
 
 		 348 aa  584  1e-166  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.836992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2479  rod shape-determining protein MreB  70.24 
 
 		 346 aa  495  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173015  normal  0.21254 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0470  rod shape-determining protein MreB  68.45 
 
 		 342 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2017  rod shape-determining protein MreB  65.77 
 
 		 346 aa  464  9.999999999999999e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.881411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1489  rod shape-determining protein MreB  67.66 
 
 		 347 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.202566 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0583  rod shape-determining protein MreB  65.38 
 
 		 348 aa  451  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.127618  hitchhiker  0.00000000573376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0492  rod shape-determining protein MreB  64.83 
 
 		 346 aa  442  1e-123  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.152747  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1313  rod shape-determining protein MreB  65.18 
 
 		 346 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.615742  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1627  rod shape-determining protein MreB  63.5 
 
 		 348 aa  427  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2128  rod shape-determining protein MreB  62.73 
 
 		 348 aa  419  1e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1049  rod shape-determining protein MreB  59.94 
 
 		 347 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000197933  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2089  rod shape-determining protein MreB  58.63 
 
 		 347 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0918  rod shape-determining protein MreB  58.41 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000183454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2866  rod shape-determining protein MreB  58.11 
 
 		 347 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000181914  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2509  rod shape-determining protein MreB  56.73 
 
 		 347 aa  391  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000707423  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3356  rod shape-determining protein MreB  59.23 
 
 		 346 aa  394  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0692396  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1710  rod shape-determining protein MreB  56.73 
 
 		 347 aa  391  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.08427e-32 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2592  rod shape-determining protein MreB  58.88 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0088  rod shape-determining protein MreB  55.36 
 
 		 340 aa  390  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2222  rod shape-determining protein MreB  57.57 
 
 		 346 aa  388  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2563  rod shape-determining protein MreB  55.82 
 
 		 340 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.684063  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1258  rod shape-determining protein MreB  56.18 
 
 		 358 aa  386  1e-106  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0558  rod shape-determining protein MreB  59.04 
 
 		 349 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000306946  normal  0.447345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14240  rod shape-determining protein MreB  57.19 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000102365  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0996  rod shape-determining protein MreB  58.46 
 
 		 346 aa  385  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0162908  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4023  rod shape-determining protein MreB  58.36 
 
 		 350 aa  385  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0592  rod shape-determining protein MreB  57.1 
 
 		 347 aa  386  1e-106  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2134  rod shape-determining protein MreB  57.49 
 
 		 339 aa  386  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000759245  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03110  cell wall structural complex MreBCD, actin-like component MreB  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000155968  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0456  cell shape determining protein, MreB/Mrl family  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000227973  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03061  hypothetical protein  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000154905  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0456  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00000507844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3687  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000064313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0119  rod shape-determining protein MreB  56.72 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3440  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.46785e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0465  rod shape-determining protein MreB  60.66 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000238277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3734  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000718605  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3677  rod shape-determining protein MreB  60.36 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00194737  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3565  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000236359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2548  rod shape-determining protein MreB  56.97 
 
 		 343 aa  382  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3835  rod shape-determining protein MreB  60.36 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00197853  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3282  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000051141  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3546  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000601391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2184  rod shape-determining protein MreB  57.86 
 
 		 346 aa  384  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3566  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.00000307307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0112  rod shape-determining protein MreB  57.01 
 
 		 344 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3754  rod shape-determining protein MreB  58.43 
 
 		 349 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000701456  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0398  rod shape-determining protein MreB  60.66 
 
 		 347 aa  382  1e-105  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0857463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4402  rod shape-determining protein MreB  58.73 
 
 		 349 aa  382  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000143177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3672  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000126331  normal  0.279818 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3734  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000617813  normal  0.0424676 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4567  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000238726  normal  0.33905 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3637  rod shape-determining protein MreB  60.48 
 
 		 347 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000940362  hitchhiker  0.00158537 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0252  rod shape-determining protein MreB  60.71 
 
 		 347 aa  384  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00115776  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0117  rod shape-determining protein MreB  56.85 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.142106  normal  0.1175 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3339  rod shape-determining protein MreB  56.38 
 
 		 343 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000677131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3822  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000619946  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0522  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000845532  normal  0.369074 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4411  rod shape-determining protein MreB  60.06 
 
 		 347 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000473686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0164  rod shape-determining protein MreB  57.57 
 
 		 346 aa  380  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2192  rod shape-determining protein MreB  58.23 
 
 		 347 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.728891  hitchhiker  0.00000188341 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0113  rod shape-determining protein MreB  56.85 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.308435  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0130  rod shape-determining protein MreB  56.42 
 
 		 344 aa  379  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0131  rod shape-determining protein MreB  56.55 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0518  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000418886  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2562  rod shape-determining protein MreB  58.23 
 
 		 348 aa  381  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.497429  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0497  rod shape-determining protein MreB  59.64 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000391443  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0467  rod shape-determining protein MreB  59.34 
 
 		 349 aa  378  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000395514  normal  0.671219 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0120  rod shape-determining protein MreB  56.55 
 
 		 344 aa  378  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4098  rod shape-determining protein MreB  59.34 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0873  rod shape-determining protein MreB  58.23 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0844  rod shape-determining protein MreB  58.23 
 
 		 345 aa  377  1e-103  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04262  rod shape-determining protein MreB  57.83 
 
 		 348 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.917856  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0403  rod shape-determining protein MreB  59.34 
 
 		 349 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000126028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03685  rod shape-determining protein MreB  58.61 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002383  rod shape-determining protein MreB  58.61 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000533641  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0515  rod shape-determining protein MreB  54.12 
 
 		 343 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0667798  hitchhiker  0.00000000455643 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0574  rod shape-determining protein MreB  59.34 
 
 		 349 aa  376  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000161982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3472  rod shape-determining protein MreB  59.34 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000392935  normal  0.627264 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0479  rod shape-determining protein MreB  59.34 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000232389  normal  0.336975 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3738  rod shape-determining protein MreB  59.34 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000049309  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1005  rod shape-determining protein MreB  57.1 
 
 		 347 aa  375  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2834  rod shape-determining protein MreB  58.61 
 
 		 347 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.000000000000019673  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1412  rod shape-determining protein MreB  59.88 
 
 		 344 aa  376  1e-103  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000497097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3648  rod shape-determining protein MreB  59.34 
 
 		 349 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000380554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00264  rod shape-determining protein MreB  58.18 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000119217  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0980  rod shape-determining protein MreB  55.65 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000066828  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0668  rod shape-determining protein MreB  57.23 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167563  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2371  rod shape-determining protein Mbl  56.1 
 
 		 345 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000614585 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5095  rod shape-determining protein MreB  55.92 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0183  rod shape-determining protein MreB  57.88 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000147765  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0169  rod shape-determining protein MreB  57.7 
 
 		 347 aa  372  1e-102  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3454  rod shape-determining protein MreB  57.53 
 
 		 348 aa  374  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58150  rod shape-determining protein MreB  55.92 
 
 		 345 aa  372  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.138961  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>